More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4894 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4894  ABC transporter related  100 
 
 		 252 aa  480  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3456  ABC transporter related  84.92 
 
 		 252 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000578297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4264  ABC transporter related  64.88 
 
 		 255 aa  296  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4372  ABC transporter related  63.56 
 
 		 253 aa  294  9e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.191075 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4848  Sigma 54 interacting domain protein  63.79 
 
 		 253 aa  294  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.627338 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2449  ABC transporter related  57.59 
 
 		 255 aa  236  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259885 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  48.47 
 
 		 256 aa  216  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  48.91 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  50.43 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0667  ABC transporter related  51.11 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  49.37 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1321  ABC transporter-like protein  52.33 
 
 		 288 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251104 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  45.9 
 
 		 246 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  47.04 
 
 		 445 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  44.59 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  54.71 
 
 		 261 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  50.83 
 
 		 261 aa  209  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0181  ABC transporter related  54.43 
 
 		 260 aa  208  7e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.945523  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  49.58 
 
 		 256 aa  208  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  42.13 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  48.29 
 
 		 445 aa  205  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  51.07 
 
 		 259 aa  205  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  47.41 
 
 		 263 aa  204  8e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  50.64 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  47.47 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  40.41 
 
 		 258 aa  204  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  47.83 
 
 		 263 aa  202  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  55.14 
 
 		 252 aa  202  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  47.33 
 
 		 271 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  46 
 
 		 265 aa  202  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  49.56 
 
 		 255 aa  202  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0104  ABC transporter related  51.49 
 
 		 260 aa  201  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 		 264 aa  201  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1296  ABC transporter related  43.2 
 
 		 265 aa  201  9e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  40.8 
 
 		 254 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.38 
 
 		 261 aa  200  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  43.6 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  47.33 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  45.75 
 
 		 289 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3570  ABC transporter related  44.92 
 
 		 457 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  42.74 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5983  ABC transporter ATP-binding protein  50.93 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  45.8 
 
 		 437 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  47.33 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  50.84 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  45.42 
 
 		 281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2951  ABC transporter, ATP-binding protein  51.38 
 
 		 435 aa  199  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  46.37 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  47.58 
 
 		 266 aa  199  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  43.9 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0523  ABC transporter-related protein  50.68 
 
 		 435 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  42.91 
 
 		 262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  49.07 
 
 		 289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.56 
 
 		 283 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16920  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  46.03 
 
 		 269 aa  199  5e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.407228  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  50.41 
 
 		 267 aa  198  6e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  40 
 
 		 254 aa  198  6e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  46 
 
 		 259 aa  198  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  46.7 
 
 		 297 aa  198  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1173  ABC transporter related  47.03 
 
 		 253 aa  197  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628732  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  49.15 
 
 		 278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  47.52 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  46.26 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3600  ABC transporter related  50.64 
 
 		 263 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00199632  normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3716  ABC transporter related  51.5 
 
 		 263 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00980305 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  49.16 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  45.93 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  42.08 
 
 		 252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  48.9 
 
 		 273 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  41.45 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3247  ABC transporter related  44.14 
 
 		 457 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  45.75 
 
 		 287 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  40.61 
 
 		 256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1020  ABC transporter-like protein  46.51 
 
 		 437 aa  196  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  46.15 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  37.85 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3499  ABC transporter related  51.39 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14517  normal  0.695761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  46.75 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  48.92 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  47.83 
 
 		 269 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  50 
 
 		 284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  47.24 
 
 		 278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  45.99 
 
 		 245 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  42.8 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4539  ABC transporter related  47.48 
 
 		 256 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.113352 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2188  ABC transporter related  52.97 
 
 		 260 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0571708  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  46.06 
 
 		 261 aa  195  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  49.15 
 
 		 270 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  41.6 
 
 		 263 aa  195  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  41.94 
 
 		 258 aa  195  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  50.65 
 
 		 260 aa  195  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  41.15 
 
 		 279 aa  195  7e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0113  ABC transporter related  49.77 
 
 		 261 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3407  ABC transporter related  51.07 
 
 		 263 aa  194  9e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.81445  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  45.15 
 
 		 432 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  44.35 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  45.15 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  45.04 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  45.58 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>