More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0181 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0181  ABC transporter related  100 
 
 
260 aa  509  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.945523  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4264  ABC transporter related  49.01 
 
 
255 aa  210  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4848  Sigma 54 interacting domain protein  49.39 
 
 
253 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.627338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4372  ABC transporter related  48.98 
 
 
253 aa  209  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.191075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3456  ABC transporter related  53.23 
 
 
252 aa  205  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000578297 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2449  ABC transporter related  54.25 
 
 
255 aa  204  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259885 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  47.23 
 
 
263 aa  195  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  47.93 
 
 
252 aa  194  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  45.49 
 
 
281 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.86 
 
 
258 aa  191  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  43.91 
 
 
254 aa  190  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0150  ABC transporter related  47.37 
 
 
252 aa  189  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  46.93 
 
 
278 aa  189  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  44.19 
 
 
445 aa  188  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  43.93 
 
 
256 aa  188  9e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  43.04 
 
 
254 aa  187  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  47.19 
 
 
262 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2719  ABC transporter related protein  48.9 
 
 
454 aa  187  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  46.05 
 
 
247 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3158  ABC transporter related  48.58 
 
 
245 aa  186  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  46.64 
 
 
434 aa  187  2e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  47.53 
 
 
292 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  46.64 
 
 
438 aa  186  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  44.05 
 
 
432 aa  186  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1020  ABC transporter-like protein  45.27 
 
 
437 aa  186  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  46.05 
 
 
252 aa  186  5e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  48.17 
 
 
297 aa  185  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  47.39 
 
 
256 aa  185  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  50.94 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  45.42 
 
 
274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3496  hypothetical protein  48.76 
 
 
437 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  47.16 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  44.78 
 
 
432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  44.78 
 
 
432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  47.32 
 
 
282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2582  ABC transporter related  48.18 
 
 
245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  48.89 
 
 
258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  45 
 
 
289 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  45.68 
 
 
303 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2627  ABC transporter related  48.18 
 
 
245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0950652  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  43.17 
 
 
254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  44.44 
 
 
445 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  46.88 
 
 
266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4894  ABC transporter related  54.85 
 
 
252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  45.79 
 
 
303 aa  183  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  46.33 
 
 
263 aa  183  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  44.21 
 
 
304 aa  183  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2359  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.58 
 
 
259 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.504714 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  45.68 
 
 
303 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  44.4 
 
 
267 aa  183  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  49.53 
 
 
330 aa  183  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2621  ABC transporter related  48.18 
 
 
245 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  42.4 
 
 
437 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  45.41 
 
 
256 aa  183  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  46.43 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  40.59 
 
 
254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  44.36 
 
 
262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0271  ABC transporter related  44.83 
 
 
435 aa  182  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.342926 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  43.8 
 
 
256 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  47.87 
 
 
278 aa  182  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  46.19 
 
 
278 aa  182  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1824  putative nitrate transport system ATP-binding protein  40.7 
 
 
433 aa  181  7e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  46.19 
 
 
303 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  46.05 
 
 
274 aa  181  8.000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1270  ABC transporter related  45.23 
 
 
447 aa  181  9.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  51.21 
 
 
291 aa  181  9.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  46.26 
 
 
306 aa  181  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  42.24 
 
 
257 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  47.73 
 
 
315 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1756  ABC transporter related  41.34 
 
 
433 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  47.64 
 
 
440 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0054  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.03 
 
 
257 aa  181  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7222  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.09 
 
 
245 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  43.11 
 
 
256 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  46.46 
 
 
289 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  47.66 
 
 
291 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0550  ABC transporter related  45.69 
 
 
276 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.589055  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.42 
 
 
284 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  47.64 
 
 
286 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  43.32 
 
 
245 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  47 
 
 
286 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  46.08 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  45.65 
 
 
253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0275  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  46.76 
 
 
267 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  54.5 
 
 
261 aa  179  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  45.92 
 
 
263 aa  179  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  43.15 
 
 
244 aa  179  4e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5496  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.33 
 
 
446 aa  179  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5983  ABC transporter ATP-binding protein  47.46 
 
 
267 aa  179  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  45.37 
 
 
253 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7489  ABC transporter ATP-binding protein  45.02 
 
 
433 aa  179  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57359  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16920  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  47.37 
 
 
269 aa  179  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.407228  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  46.82 
 
 
249 aa  179  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  46.67 
 
 
268 aa  179  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  46.33 
 
 
285 aa  178  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  46.08 
 
 
263 aa  178  7e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  45.53 
 
 
265 aa  178  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  43.55 
 
 
448 aa  178  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  41.56 
 
 
301 aa  178  9e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  42.8 
 
 
269 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>