More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1464 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1464  nitrate ABC transporter ATP binding protein  100 
 
 		 228 aa  449  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.104655  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1736  ABC transporter, ATP-binding protein  95.18 
 
 		 228 aa  434  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0183932  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1146  ABC transporter related  41.44 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0318577  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0876  ABC transporter related  43.06 
 
 		 218 aa  159  4e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3465  ABC transporter related  37 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  35.25 
 
 		 261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4034  ABC transporter related  35.94 
 
 		 276 aa  154  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105857 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2628  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.41 
 
 		 270 aa  153  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.197945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0243  ABC transporter related  42.5 
 
 		 240 aa  154  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.498468  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2279  ABC transporter related protein  44.78 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3570  ABC transporter related  35.71 
 
 		 265 aa  152  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.476626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  36.19 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3900  ABC transporter related  37.07 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10000  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  38.61 
 
 		 241 aa  151  5.9999999999999996e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0152878  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1384  ABC transporter related protein  32.49 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0283767 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  33.91 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19370  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  35.12 
 
 		 326 aa  149  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4472  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.48 
 
 		 265 aa  148  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.75399 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1746  ABC transporter related  37.69 
 
 		 333 aa  148  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  43.32 
 
 		 246 aa  148  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2480  ABC transporter related protein  37.02 
 
 		 263 aa  148  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  33.77 
 
 		 245 aa  148  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0285  ABC transporter related protein  33.03 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120651  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1968  sulphate transport system permease protein 1  37.44 
 
 		 378 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  35.94 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5421  ABC transporter related  35.43 
 
 		 294 aa  146  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  37.95 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2815  ABC transporter related  37.98 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000485223 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2491  ABC aliphatic sulfonates transporter, ATPase subunit  37.37 
 
 		 261 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3593  ABC transporter related  37.68 
 
 		 255 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34330  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  35.14 
 
 		 262 aa  145  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6459  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.05 
 
 		 265 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100631 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  36.49 
 
 		 260 aa  145  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1173  ABC transporter related  33.19 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628732  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  40.11 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0448  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1034  ABC transporter related protein  36.41 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.64 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  36.02 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1540  ABC transporter related  35.44 
 
 		 318 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0499832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4876  ABC transporter, ATP-binding protein  37.02 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1084  ABC transporter related  34.47 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1564  ABC transporter related  34.47 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  36.41 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4848  Sigma 54 interacting domain protein  38.38 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.627338 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  35.07 
 
 		 330 aa  142  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1775  ABC transporter related  36.87 
 
 		 278 aa  142  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  37.91 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3499  ABC transporter related  38.3 
 
 		 265 aa  142  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14517  normal  0.695761 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4372  ABC transporter related  38.38 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.191075 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3597  ABC transporter  37.37 
 
 		 274 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2621  ABC transporter related  33.48 
 
 		 245 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3035  ABC transporter related  36.97 
 
 		 255 aa  142  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1647  ABC transporter related  33.91 
 
 		 330 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.121683 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6521  ABC transporter related  33.18 
 
 		 270 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6755  ABC transporter related  33.18 
 
 		 270 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0664482 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0230  ABC transporter related protein  35.71 
 
 		 275 aa  142  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6344  ABC transporter related  33.18 
 
 		 270 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4164  ABC transporter related  31.22 
 
 		 268 aa  142  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143983  normal  0.780966 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2436  ABC transporter related  33.47 
 
 		 277 aa  142  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0364  ABC transporter related  37.02 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  33.48 
 
 		 244 aa  142  5e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0339  putative sulfonate transport system ATP-binding protein  41.05 
 
 		 231 aa  141  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5895  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  34.63 
 
 		 267 aa  142  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0163214  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  32.24 
 
 		 272 aa  141  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  39.78 
 
 		 297 aa  141  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0773  ABC transporter related  33.19 
 
 		 262 aa  141  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.050143 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3080  ABC transporter related  37.5 
 
 		 290 aa  141  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178187  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3116  ABC transporter related  37.02 
 
 		 241 aa  141  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  32.71 
 
 		 272 aa  141  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1486  ABC transporter related  34.67 
 
 		 319 aa  141  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3016  ABC transporter related protein  32.26 
 
 		 259 aa  141  9e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.840701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1465  ABC transporter related  34.67 
 
 		 319 aa  141  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.08781  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0880  ABC transporter related  43.01 
 
 		 256 aa  141  9e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0392492  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1797  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.87 
 
 		 270 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555456  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0692  ABC transporter ATP-binding protein  33.77 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0636  ABC transporter, ATP-binding protein  33.77 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000460876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0636  ABC transporter, ATP-binding protein  33.77 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0495  ABC transporter, ATP-binding protein  37.02 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2514  ABC transporter  33.02 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0726  ABC transporter ATP-binding protein  33.77 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00713867  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4422  ABC transporter related  35.45 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2359  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  33.93 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.504714 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  36.9 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2582  ABC transporter related  33.48 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0803  ABC transporter, ATP-binding protein  33.77 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17589e-46 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2961  ABC transporter related  34.45 
 
 		 271 aa  140  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0491364  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2627  ABC transporter related  33.48 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0950652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2563  ABC-transport protein, ATP-binding protein  32.34 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.25889 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0468  ABC transporter, ATP-binding protein  35.58 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  36.02 
 
 		 274 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0356  ABC transporter, ATP-binding protein  36.54 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0407  ABC transporter, ATP-binding protein  35.58 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  36.13 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  37.09 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1758  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  33.62 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.228695  normal  0.0130766 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  32.71 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0779  ABC transporter related  38.28 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3281  ABC transporter related  33.02 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1817  ABC transporter  34.33 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>