More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1339 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1339  ABC transporter related  100 
 
 
283 aa  541  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0379728 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5515  ABC transporter related  79.31 
 
 
278 aa  359  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3716  ABC transporter related  73.91 
 
 
263 aa  345  3e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00980305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3407  ABC transporter related  74.31 
 
 
263 aa  345  4e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.81445  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3600  ABC transporter related  72.91 
 
 
263 aa  339  4e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00199632  normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5129  ABC transporter related  76.73 
 
 
275 aa  330  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1868  ABC transporter ATP-binding protein  61.76 
 
 
288 aa  295  8e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2303  ABC transporter related  57.04 
 
 
275 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.711472 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2436  ABC transporter related  62.24 
 
 
277 aa  286  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2881  ABC transporter related  63.71 
 
 
280 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30480  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  61.32 
 
 
266 aa  273  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.3789  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0766  ABC transporter related  60.08 
 
 
253 aa  271  9e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5411  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  59.09 
 
 
268 aa  270  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125743  hitchhiker  0.00768268 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0773  ABC transporter related  64.23 
 
 
262 aa  271  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.050143 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4320  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  58.94 
 
 
266 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.151299 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0264  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  58.47 
 
 
270 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0240  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  58.06 
 
 
270 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10949  hitchhiker  0.000841582 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4874  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  58.04 
 
 
270 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0255  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  58.06 
 
 
270 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.213675  normal  0.0453993 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4972  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  57.66 
 
 
270 aa  265  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243489  normal  0.0217357 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1237  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  57.44 
 
 
271 aa  265  7e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5314  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  57.65 
 
 
270 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0356  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  57.44 
 
 
271 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1735  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  55.77 
 
 
257 aa  262  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0424  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  57.02 
 
 
271 aa  262  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0029  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  53.61 
 
 
266 aa  261  6.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.05113  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0023  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  54.3 
 
 
266 aa  260  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  55.47 
 
 
255 aa  260  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5467  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (aliphatic sulfonate)  55.85 
 
 
275 aa  260  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0163214  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1974  ABC transporter related  53.52 
 
 
299 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1452  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  56.2 
 
 
256 aa  259  5.0000000000000005e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2186  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  55.97 
 
 
255 aa  257  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0564256  normal  0.601575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1685  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  57.44 
 
 
274 aa  255  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1373  ABC transporter-related protein  57.98 
 
 
291 aa  255  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1341  aliphatic sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  58.61 
 
 
284 aa  254  8e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120657  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1775  ABC transporter related  57.85 
 
 
278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19580  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  57.02 
 
 
274 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1280  ABC transporter related  56.85 
 
 
279 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161997  normal  0.0814876 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1217  ABC transporter related  56.02 
 
 
279 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.216616 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1672  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  53.46 
 
 
267 aa  251  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4636  ABC transporter related  56.4 
 
 
326 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214467  hitchhiker  0.0000194183 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2416  ABC transporter related  55.12 
 
 
270 aa  250  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.769125  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0117  ATPase  56.85 
 
 
312 aa  249  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182044  hitchhiker  0.000782511 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00937  alkanesulfonate transporter subunit  56.79 
 
 
255 aa  248  8e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.059764  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2710  ABC transporter related protein  56.79 
 
 
255 aa  248  8e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.35574  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1042  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  56.79 
 
 
255 aa  248  8e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00944  hypothetical protein  56.79 
 
 
255 aa  248  8e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0618654  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1095  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  56.79 
 
 
255 aa  248  8e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00325172  normal  0.604485 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1641  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  53.97 
 
 
269 aa  248  8e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2663  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  56.79 
 
 
255 aa  248  8e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.501147  normal  0.0102717 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1035  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  55.97 
 
 
255 aa  248  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0244681  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2973  ABC transporter related  56.02 
 
 
276 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.493702  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1647  ABC transporter related  55.16 
 
 
330 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.121683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3041  ABC transporter-related protein  56.68 
 
 
272 aa  242  6e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.784211  normal  0.0417825 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1746  ABC transporter related  56.33 
 
 
333 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2786  ABC transporter related  51.43 
 
 
251 aa  238  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00998807  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2227  ABC transporter related protein  54.36 
 
 
267 aa  236  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0741245  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2491  ABC aliphatic sulfonates transporter, ATPase subunit  55.14 
 
 
261 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1465  ABC transporter related  53.05 
 
 
319 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.08781  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1486  ABC transporter related  55.97 
 
 
319 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2499  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 
335 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4706  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  55.56 
 
 
319 aa  225  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1084  ABC transporter related  55.1 
 
 
319 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1564  ABC transporter related  55.1 
 
 
319 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1540  ABC transporter related  55.1 
 
 
318 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0499832  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1209  ABC transporter related  55.84 
 
 
290 aa  217  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  47.76 
 
 
280 aa  215  8e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1237  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  55.23 
 
 
273 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1991  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  55.23 
 
 
335 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0937962  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1723  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  55.23 
 
 
335 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0380  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  55.23 
 
 
335 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.625066  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1823  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  55.23 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1838  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  55.23 
 
 
335 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391117  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0781  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  55.23 
 
 
335 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309085  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0249  ABC transporter related  47.89 
 
 
302 aa  207  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4372  ABC transporter related  49.58 
 
 
253 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.191075 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1668  ABC transporter related  56.38 
 
 
320 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0241971  normal  0.174834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4848  Sigma 54 interacting domain protein  49.58 
 
 
253 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.627338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  49.22 
 
 
263 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  48.8 
 
 
268 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6405  ABC transporter related  48.74 
 
 
249 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0333973  normal  0.45445 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  48.99 
 
 
266 aa  201  9e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  48.99 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  47.58 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  48.37 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2621  ABC transporter related  51.34 
 
 
245 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  50.88 
 
 
286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  48.99 
 
 
273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  48.99 
 
 
273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  48.21 
 
 
262 aa  199  6e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3265  ABC transporter related  48.58 
 
 
273 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.952951 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.39 
 
 
275 aa  198  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4520  ABC transporter related  49.16 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.719426 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  48.79 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2582  ABC transporter related  50.89 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2627  ABC transporter related  50.89 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0950652  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4264  ABC transporter related  52.09 
 
 
255 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  45.77 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  47.01 
 
 
262 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  47.81 
 
 
255 aa  196  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>