More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2658 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2658  ABC transporter related  100 
 
 
271 aa  523  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2510  ABC transporter related  74.47 
 
 
261 aa  311  6.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.827702  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21610  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP binding component  63.49 
 
 
266 aa  285  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1797  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  63.28 
 
 
270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555456  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3597  ABC transporter  63.42 
 
 
274 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4520  ABC transporter related  60.41 
 
 
249 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.719426 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6405  ABC transporter related  58.78 
 
 
249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0333973  normal  0.45445 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1557  ABC transporter-like protein  60.43 
 
 
247 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1379  ABC transporter-like protein  61.8 
 
 
246 aa  250  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.279047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0465  ABC transporter related protein  60.26 
 
 
244 aa  248  6e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3817  ABC transporter related protein  56.91 
 
 
249 aa  248  8e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0723  ABC transporter related  59.34 
 
 
251 aa  246  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00967662  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4339  ABC transporter related  61.34 
 
 
252 aa  240  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.764562  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5004  ABC transporter related  60.24 
 
 
245 aa  237  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.472634  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2621  ABC transporter related  57.69 
 
 
245 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2582  ABC transporter related  57.69 
 
 
245 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2627  ABC transporter related  57.69 
 
 
245 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0950652  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3465  ABC transporter related  61.44 
 
 
241 aa  236  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3281  ABC transporter related  59.66 
 
 
261 aa  236  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3781  ABC transporter related  58.44 
 
 
259 aa  235  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4422  ABC transporter related  65.83 
 
 
226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3158  ABC transporter related  56.6 
 
 
245 aa  233  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0249  ABC transporter related  54.04 
 
 
302 aa  232  6e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3479  ABC transporter related protein  54.96 
 
 
250 aa  230  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.558732  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2980  ABC transporter related protein  53.54 
 
 
255 aa  229  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2637  ABC sulfonate transporter, ATPase subunit  56.71 
 
 
247 aa  228  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.327484  hitchhiker  0.00000882208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3399  ABC transporter related protein  58.33 
 
 
246 aa  228  6e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.857812  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1375  ABC transporter related protein  54.78 
 
 
258 aa  228  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.239653  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4418  ABC transporter related  53.56 
 
 
241 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26331  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0982  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  56.78 
 
 
247 aa  221  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0117  ATPase  49.81 
 
 
312 aa  221  8e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182044  hitchhiker  0.000782511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3873  ABC transporter related  59.23 
 
 
289 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195534  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0424  ABC transporter related protein  53.56 
 
 
254 aa  217  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.573696  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29410  ABC transporter, ATP binding component  55.27 
 
 
250 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2227  ABC transporter related protein  50.61 
 
 
267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0741245  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2416  ABC transporter related  50.4 
 
 
270 aa  215  7e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.769125  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3298  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  63.51 
 
 
239 aa  214  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0886961  normal  0.245703 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0434  ABC transporter related protein  57.21 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2973  ABC transporter related  49.58 
 
 
276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.493702  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2407  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  46.4 
 
 
245 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626164  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7802  ABC transporter ATP-binding protein  54.01 
 
 
237 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1775  ABC transporter related  48.76 
 
 
278 aa  210  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4107  ABC transporter related  53 
 
 
242 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1974  ABC transporter related  48.82 
 
 
299 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1452  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  51.32 
 
 
256 aa  208  7e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1647  ABC transporter related  50 
 
 
330 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.121683 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1486  ABC transporter related  52.8 
 
 
319 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4636  ABC transporter related  49.01 
 
 
326 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214467  hitchhiker  0.0000194183 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1465  ABC transporter related  52.8 
 
 
319 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.08781  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2491  ABC aliphatic sulfonates transporter, ATPase subunit  49.57 
 
 
261 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1735  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.41 
 
 
257 aa  206  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19580  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.21 
 
 
274 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0240  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50 
 
 
270 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10949  hitchhiker  0.000841582 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0255  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50 
 
 
270 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.213675  normal  0.0453993 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0023  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.8 
 
 
266 aa  203  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1373  ABC transporter-related protein  48.46 
 
 
291 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1685  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.21 
 
 
274 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2186  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.44 
 
 
255 aa  203  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0564256  normal  0.601575 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3041  ABC transporter-related protein  48.31 
 
 
272 aa  202  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.784211  normal  0.0417825 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1237  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.13 
 
 
271 aa  201  8e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017659 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1341  aliphatic sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  48.33 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120657  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4972  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  49.59 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243489  normal  0.0217357 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0029  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.34 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.05113  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1084  ABC transporter related  50 
 
 
319 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0264  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  49.19 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1564  ABC transporter related  50 
 
 
319 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0356  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.13 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5411  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.18 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125743  hitchhiker  0.00768268 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1540  ABC transporter related  51.87 
 
 
318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0499832  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30480  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.58 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.3789  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0424  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.72 
 
 
271 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4706  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  51.87 
 
 
319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1280  ABC transporter related  50.66 
 
 
279 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161997  normal  0.0814876 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1746  ABC transporter related  48.73 
 
 
333 aa  198  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3412  ABC transporter related protein  49.17 
 
 
258 aa  198  9e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00937  alkanesulfonate transporter subunit  50.88 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.059764  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2710  ABC transporter related protein  50.88 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.35574  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1217  ABC transporter related  51.32 
 
 
279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.216616 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1042  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.88 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00944  hypothetical protein  50.88 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0618654  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2663  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.88 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.501147  normal  0.0102717 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1095  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.88 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00325172  normal  0.604485 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1035  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.88 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0244681  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2499  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  49.16 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3412  ABC transporter-related protein  50.22 
 
 
250 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0308441  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2786  ABC transporter related  50.64 
 
 
251 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00998807  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1237  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
273 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4320  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.72 
 
 
266 aa  192  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.151299 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1823  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
327 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1838  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
335 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391117  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1991  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
335 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0937962  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0781  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
335 aa  191  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309085  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0380  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
335 aa  191  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.625066  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1723  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
335 aa  191  8e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1868  ABC transporter ATP-binding protein  49.3 
 
 
288 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5314  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  46.96 
 
 
270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4874  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.96 
 
 
270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0766  ABC transporter related  49.34 
 
 
253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  45.76 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5515  ABC transporter related  52.63 
 
 
278 aa  188  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>