More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1783 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1783  ABC transporter related  100 
 
 		 251 aa  488  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.520432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5975  ABC transporter related  59.59 
 
 		 246 aa  252  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2144  ABC transporter related  55.74 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.431214 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1808  ABC transporter related  55.74 
 
 		 257 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.611078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1760  ABC transporter related  52.4 
 
 		 265 aa  234  8e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5750  ABC transporter related  57.96 
 
 		 246 aa  232  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0500187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2775  ABC transporter related  55.06 
 
 		 244 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0974078 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0014  ABC transporter related  46.02 
 
 		 235 aa  181  7e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5957  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.76 
 
 		 236 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.844305  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6344  ABC transporter related  41.83 
 
 		 270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2850  ABC transporter related  42.86 
 
 		 255 aa  162  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.220732  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6521  ABC transporter related  41.83 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6755  ABC transporter related  41.83 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0664482 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7505  ABC transporter, ATPase subunit  43.1 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000247297  normal  0.575396 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4034  ABC transporter related  42.73 
 
 		 276 aa  156  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105857 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1866  ABC transporter related  40.08 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  40 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0243  ABC transporter related  36.07 
 
 		 240 aa  150  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.498468  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1146  ABC transporter related  37.75 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0318577  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  42.41 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  39.29 
 
 		 254 aa  148  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1930  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  35.74 
 
 		 262 aa  148  9e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0780137  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  39.3 
 
 		 253 aa  148  9e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.43 
 
 		 284 aa  145  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  38.31 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  37.61 
 
 		 251 aa  145  6e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2786  ABC transporter, ATP-binding protein  41.26 
 
 		 232 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0961461  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  38.39 
 
 		 271 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  39.48 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0339  putative sulfonate transport system ATP-binding protein  37.93 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  41.53 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  37.08 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  39.48 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  39.55 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  39.35 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  40.64 
 
 		 287 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2188  ABC transporter related  41.42 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0571708  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  41.3 
 
 		 259 aa  142  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  36.21 
 
 		 252 aa  142  7e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  38.84 
 
 		 275 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21980  ABC transporter, ATP binding component  42.13 
 
 		 271 aa  142  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  39.64 
 
 		 266 aa  141  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2936  ABC transporter related  38.24 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  43.19 
 
 		 439 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  34.75 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  38.79 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0802  ABC transporter related  42.15 
 
 		 434 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  40.45 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  39.73 
 
 		 297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  39.13 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  35.66 
 
 		 307 aa  139  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  39.52 
 
 		 252 aa  139  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  41.94 
 
 		 330 aa  138  7e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  32.66 
 
 		 250 aa  138  7e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  40.32 
 
 		 260 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  34.32 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  39.55 
 
 		 281 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  39.55 
 
 		 281 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  37.97 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  37.92 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  34.93 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  36.89 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  40.89 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  35.18 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  40.49 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0876  ABC transporter related  35.2 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  40.38 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  38.84 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  38.33 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  37.61 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0720  ABC transporter related  40.49 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  35.09 
 
 		 251 aa  136  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  39.47 
 
 		 245 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0116  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  37.4 
 
 		 276 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  36.02 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  37.24 
 
 		 281 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  35.56 
 
 		 287 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5421  ABC transporter related  37.23 
 
 		 294 aa  135  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  35.56 
 
 		 251 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  35.56 
 
 		 251 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  38.84 
 
 		 260 aa  135  5e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0347  ABC transporter, ATP-binding protein  34.73 
 
 		 511 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2628  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.59 
 
 		 270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.197945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  40.62 
 
 		 267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  41.1 
 
 		 268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  39.15 
 
 		 271 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3900  ABC transporter related  37.16 
 
 		 228 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  37.14 
 
 		 281 aa  135  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  36.71 
 
 		 668 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  36.71 
 
 		 668 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 		 251 aa  135  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  32.28 
 
 		 262 aa  135  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  39.48 
 
 		 281 aa  135  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  34.33 
 
 		 267 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  40.17 
 
 		 273 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  40.17 
 
 		 273 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.8 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  38.91 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  35.08 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>