More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5975 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5975  ABC transporter related  100 
 
 		 246 aa  475  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5750  ABC transporter related  86.59 
 
 		 246 aa  378  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0500187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1760  ABC transporter related  66.4 
 
 		 265 aa  318  6e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2144  ABC transporter related  64.45 
 
 		 257 aa  309  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.431214 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1808  ABC transporter related  64.45 
 
 		 257 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.611078 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2775  ABC transporter related  65.45 
 
 		 244 aa  276  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0974078 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1783  ABC transporter related  60.34 
 
 		 251 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.520432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0014  ABC transporter related  47.81 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5957  putative ABC transporter ATP-binding protein  49.78 
 
 		 236 aa  179  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.844305  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2850  ABC transporter related  47.15 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.220732  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  37.75 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  39.53 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  40.43 
 
 		 279 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  40.93 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1866  ABC transporter related  39.11 
 
 		 246 aa  159  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  40.32 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  38.21 
 
 		 269 aa  158  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  40.43 
 
 		 279 aa  158  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4034  ABC transporter related  43.56 
 
 		 276 aa  158  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105857 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  37.8 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1930  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  35.52 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0780137  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6521  ABC transporter related  43.87 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6755  ABC transporter related  43.87 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0664482 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  38.46 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  39.27 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.28 
 
 		 284 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6344  ABC transporter related  43.87 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  38.31 
 
 		 269 aa  154  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2786  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0961461  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  39.24 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  35.87 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  39.53 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  38.46 
 
 		 246 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  40.93 
 
 		 291 aa  153  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  34.93 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  37.5 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  43.38 
 
 		 259 aa  152  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  38.03 
 
 		 253 aa  151  8e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  38.59 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  39.17 
 
 		 304 aa  150  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  40.36 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  34.5 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  37.95 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1146  ABC transporter related  34.47 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0318577  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7505  ABC transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 		 273 aa  149  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000247297  normal  0.575396 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  33.05 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  34.98 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  43.63 
 
 		 330 aa  149  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  38.79 
 
 		 269 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 		 251 aa  148  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0550  ABC transporter related  35.91 
 
 		 276 aa  148  9e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.589055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  41 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0285  ABC transporter related protein  41.12 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120651  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0876  ABC transporter related  33.18 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  36.74 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  34.53 
 
 		 251 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  34.53 
 
 		 251 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  39.3 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4329  ABC transporter related  42.03 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.413281  normal  0.920294 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  41.67 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  34.51 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  40.47 
 
 		 286 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  33.76 
 
 		 255 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0353  ABC transporter related protein  37.99 
 
 		 253 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  36.32 
 
 		 252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  39.91 
 
 		 249 aa  145  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3269  ABC transporter related  46.03 
 
 		 263 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874896 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2628  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.45 
 
 		 270 aa  145  6e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.197945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0116  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  41.74 
 
 		 276 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  36.65 
 
 		 265 aa  145  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.06 
 
 		 251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  40.17 
 
 		 439 aa  144  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  39.13 
 
 		 269 aa  144  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  37.44 
 
 		 281 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  37.45 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  38.36 
 
 		 281 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  37.44 
 
 		 281 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  37.44 
 
 		 281 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  37.99 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  41.05 
 
 		 436 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  36.87 
 
 		 278 aa  143  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0339  putative sulfonate transport system ATP-binding protein  36.77 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  42.79 
 
 		 265 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  40.85 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  40.87 
 
 		 268 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0458  ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 		 270 aa  142  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  37.44 
 
 		 281 aa  142  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  40.28 
 
 		 276 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  39.81 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  39.05 
 
 		 284 aa  142  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  36.89 
 
 		 275 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1680  ABC transporter ATP-binding protein  39.91 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19520  ABC transporter ATP-binding protein  39.91 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3080  ABC transporter related  36.87 
 
 		 290 aa  142  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178187  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  38.57 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4786  ABC transporter related  36.41 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  36.73 
 
 		 247 aa  142  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  38.29 
 
 		 289 aa  142  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  41.3 
 
 		 262 aa  142  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>