More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5750 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5750  ABC transporter related  100 
 
 		 246 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0500187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5975  ABC transporter related  86.59 
 
 		 246 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1760  ABC transporter related  66.29 
 
 		 265 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2144  ABC transporter related  66.41 
 
 		 257 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.431214 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1808  ABC transporter related  66.02 
 
 		 257 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.611078 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2775  ABC transporter related  67.48 
 
 		 244 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0974078 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1783  ABC transporter related  59.48 
 
 		 251 aa  241  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.520432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0014  ABC transporter related  50.7 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5957  putative ABC transporter ATP-binding protein  50.66 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.844305  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1866  ABC transporter related  40.32 
 
 		 246 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  41.45 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2850  ABC transporter related  45.12 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.220732  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4034  ABC transporter related  44.09 
 
 		 276 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105857 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  41.03 
 
 		 279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  37.35 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  38.46 
 
 		 269 aa  162  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  37.6 
 
 		 266 aa  162  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  37.75 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  41.3 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1930  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  36.5 
 
 		 262 aa  159  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0780137  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6521  ABC transporter related  42.04 
 
 		 270 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6755  ABC transporter related  42.04 
 
 		 270 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0664482 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6344  ABC transporter related  42.92 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  37.5 
 
 		 287 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  38.6 
 
 		 287 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  36.97 
 
 		 254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  37.56 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  37.44 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7505  ABC transporter, ATPase subunit  41.59 
 
 		 273 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000247297  normal  0.575396 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  41.42 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2786  ABC transporter, ATP-binding protein  38.25 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0961461  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  38.74 
 
 		 278 aa  152  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  37.07 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  39.46 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  35.81 
 
 		 251 aa  150  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  35.71 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  42.59 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  37.16 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.45 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  37.34 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  37.34 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  31.93 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0550  ABC transporter related  35.59 
 
 		 276 aa  149  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.589055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  33.19 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  38.14 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4786  ABC transporter related  37.07 
 
 		 260 aa  149  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  37.34 
 
 		 281 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1146  ABC transporter related  35.53 
 
 		 237 aa  149  5e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0318577  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  38.1 
 
 		 269 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  39.57 
 
 		 260 aa  148  9e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  31.36 
 
 		 287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  39.38 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  32.29 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  38.52 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  31.9 
 
 		 251 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  41.28 
 
 		 265 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  41.28 
 
 		 265 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  42.17 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  38.25 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  41.23 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  31.51 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4329  ABC transporter related  41.75 
 
 		 243 aa  146  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.413281  normal  0.920294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  35.27 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  37.77 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  35.44 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  36.96 
 
 		 275 aa  146  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  32.74 
 
 		 251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  41.1 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  36.52 
 
 		 269 aa  145  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  41.75 
 
 		 252 aa  145  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  35.81 
 
 		 281 aa  145  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  39.22 
 
 		 268 aa  145  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  33.33 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.88 
 
 		 251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3269  ABC transporter related  40.09 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874896 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  33.61 
 
 		 256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  31.9 
 
 		 251 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  33.48 
 
 		 261 aa  145  8.000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  31.9 
 
 		 251 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  35.43 
 
 		 252 aa  144  9e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2188  ABC transporter related  40.95 
 
 		 260 aa  144  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0571708  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  36.05 
 
 		 281 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0876  ABC transporter related  32.88 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  39.27 
 
 		 284 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  39.32 
 
 		 286 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  42.68 
 
 		 259 aa  142  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  38.07 
 
 		 245 aa  143  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  35.92 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  40.59 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0243  ABC transporter related  31.9 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.498468  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  40.59 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0353  ABC transporter related protein  37.56 
 
 		 253 aa  142  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2628  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.94 
 
 		 270 aa  141  7e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.197945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0116  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  39.91 
 
 		 276 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  34.39 
 
 		 259 aa  141  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  39.92 
 
 		 244 aa  141  8e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0896  ABC transporter related  35.62 
 
 		 257 aa  141  8e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.152369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  38.32 
 
 		 286 aa  141  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2936  ABC transporter related  35.12 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  35.6 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>