More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4557 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4557  ABC transporter related  100 
 
 
255 aa  528  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.218362  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2573  ABC transporter related protein  71.76 
 
 
255 aa  388  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0880  ABC transporter related  65.23 
 
 
256 aa  350  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0392492  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2294  ABC transporter related  65.08 
 
 
248 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1835  ABC transporter related  58.63 
 
 
251 aa  297  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0803  ABC transporter related  56.22 
 
 
260 aa  288  7e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.32112  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11500  ABC transporter related  55.56 
 
 
257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4614  ABC transporter related  51.53 
 
 
254 aa  257  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2783  ABC transporter related  52.16 
 
 
257 aa  254  9e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3455  ABC transporter-related protein  52.4 
 
 
254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.302044  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4535  ABC transporter, ATP-binding protein  50.66 
 
 
254 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4676  ABC transporter ATP-binding protein  50.66 
 
 
254 aa  251  7e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5037  ABC transporter ATP-binding protein  50.66 
 
 
254 aa  251  7e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  50.66 
 
 
254 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4516  ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 
254 aa  248  5e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4922  ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 
254 aa  248  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4901  ABC transporter, ATP-binding protein  50.44 
 
 
229 aa  248  6e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0336  ABC transporter, ATP-binding protein  50.66 
 
 
254 aa  248  6e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0590  ABC transporter related protein  48.43 
 
 
263 aa  248  7e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4902  ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 
254 aa  247  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2776  ABC transporter related  45.15 
 
 
262 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0816  ABC transporter related  44.44 
 
 
263 aa  225  6e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117233  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1182  ABC transporter related  43.2 
 
 
262 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6299  ABC transporter related  40.48 
 
 
285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  40.96 
 
 
288 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  40.96 
 
 
288 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  40.96 
 
 
288 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  41.13 
 
 
265 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  41.13 
 
 
265 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  41.13 
 
 
265 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  41.13 
 
 
265 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  41.3 
 
 
258 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  40.41 
 
 
261 aa  211  9e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0230  ABC transporter related protein  44 
 
 
275 aa  208  7e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 
265 aa  207  9e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3960  ABC transporter related  41.77 
 
 
265 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.13 
 
 
272 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  42.66 
 
 
260 aa  206  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  43.06 
 
 
286 aa  206  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0494  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  41.77 
 
 
264 aa  205  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146722  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4034  ABC transporter related  41.77 
 
 
264 aa  205  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3217  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  40.32 
 
 
265 aa  204  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  40.08 
 
 
254 aa  204  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0035  ABC transporter related  40.32 
 
 
265 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  42.59 
 
 
286 aa  202  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0025  ABC transporter related  39.92 
 
 
265 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0034  ABC transporter related  39.92 
 
 
265 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0052  ABC transporter related  40.32 
 
 
265 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  38.1 
 
 
280 aa  201  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  40.87 
 
 
254 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  40.87 
 
 
254 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0037  ABC transporter related  39.92 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0033  ABC transporter related  39.92 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  41.18 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  41.15 
 
 
284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2961  ABC transporter related  42.17 
 
 
271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0491364  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  39.11 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  40.32 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  44.29 
 
 
267 aa  199  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  42.92 
 
 
253 aa  199  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  43.3 
 
 
297 aa  199  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  40.42 
 
 
276 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  39.11 
 
 
272 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1199  ABC transporter ATP-binding protein  43.72 
 
 
270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621607  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  38.11 
 
 
267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  42.52 
 
 
291 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  36.84 
 
 
267 aa  198  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  41.56 
 
 
262 aa  198  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  38.21 
 
 
264 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  39.76 
 
 
263 aa  197  9e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  42.34 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  41.63 
 
 
272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  40.48 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  41.83 
 
 
269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  36.69 
 
 
267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  40.54 
 
 
281 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1135  ABC transporter related  43.29 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.185737  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  42.42 
 
 
251 aa  196  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  41.42 
 
 
301 aa  196  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  42.86 
 
 
267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  39.74 
 
 
280 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1831  ABC transporter related  42.42 
 
 
270 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747209  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1043  ABC transporter related  42.86 
 
 
270 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  43.29 
 
 
270 aa  195  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2747  ABC transporter related  41.99 
 
 
269 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.769453  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  42.27 
 
 
263 aa  193  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  42.86 
 
 
282 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  38.18 
 
 
276 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  40.43 
 
 
288 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2356  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  41.99 
 
 
270 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659325  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0951  ABC transporter related  42.08 
 
 
264 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438313  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  38.89 
 
 
271 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  37.76 
 
 
259 aa  192  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  39.37 
 
 
285 aa  192  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  39.2 
 
 
267 aa  192  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3211  ABC transporter related  37.7 
 
 
282 aa  192  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289662  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  39.22 
 
 
278 aa  192  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  44.93 
 
 
293 aa  191  7e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  44.93 
 
 
293 aa  191  8e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4036  ABC transporter related  36.76 
 
 
273 aa  191  9e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.494746  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>