More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0478 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0478  ABC transporter related protein  100 
 
 
245 aa  484  1e-136  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1153  ABC transporter related  51.61 
 
 
246 aa  251  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0879  ABC transporter related  47.76 
 
 
254 aa  242  5e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13650  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  42.28 
 
 
255 aa  215  4e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1443  ABC transporter related  47.83 
 
 
244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.605121 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0393  ABC transporter related  43.66 
 
 
281 aa  199  3.9999999999999996e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0671  ABC transporter related  41.41 
 
 
255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2066  ABC transporter related protein  41.63 
 
 
244 aa  192  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.572481  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3118  ABC transporter related  39.57 
 
 
254 aa  187  9e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.758008  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4548  ABC transporter, ATP-binding protein  40.82 
 
 
249 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0719358  normal  0.368942 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0692  ABC transporter ATP-binding protein  46.53 
 
 
249 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0636  ABC transporter, ATP-binding protein  46.53 
 
 
249 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000460876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0636  ABC transporter, ATP-binding protein  46.53 
 
 
249 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0726  ABC transporter ATP-binding protein  46.53 
 
 
249 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00713867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0803  ABC transporter, ATP-binding protein  46.53 
 
 
249 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17589e-46 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2295  ABC transporter related  38.2 
 
 
260 aa  187  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3203  ABC transporter related  41.48 
 
 
275 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565389  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0880  ABC transporter, ATP-binding protein  41.22 
 
 
249 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018154  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0668  ABC transporter related  42.18 
 
 
255 aa  184  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0642  ABC transporter related  40.82 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0796  ABC transporter, ATP-binding protein  40.82 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0783  ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 
249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3646  ABC transporter related  40 
 
 
270 aa  181  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0372  ABC transporter-related protein  38.87 
 
 
250 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0448  ABC transporter, ATP-binding protein  39.09 
 
 
249 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  38.05 
 
 
267 aa  180  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4876  ABC transporter, ATP-binding protein  38.68 
 
 
249 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0613  ABC transporter-related protein  45.1 
 
 
249 aa  178  8e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0364  ABC transporter related  37.86 
 
 
249 aa  177  9e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0426  ABC transporter, ATP-binding protein  38.68 
 
 
249 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0359  ABC transporter, ATP-binding protein  38.27 
 
 
249 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0356  ABC transporter, ATP-binding protein  38.68 
 
 
249 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0493  ABC transporter, ATP-binding protein  38.27 
 
 
249 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0495  ABC transporter, ATP-binding protein  38.27 
 
 
249 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3935  ABC transporter related  40 
 
 
270 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0369  ABC transporter ATP-binding protein  38.27 
 
 
249 aa  175  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0383  ABC transporter ATP-binding protein  38.27 
 
 
249 aa  175  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2776  ABC transporter related  42.79 
 
 
262 aa  174  9e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1667  ABC transporter related  34.8 
 
 
260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0642211  normal  0.357453 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  40.61 
 
 
250 aa  170  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1220  ABC transporter related protein  39.47 
 
 
262 aa  169  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1182  ABC transporter related  40.43 
 
 
262 aa  169  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2083  ABC transporter related  38.46 
 
 
223 aa  167  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0816  ABC transporter related  40.78 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0336  ABC transporter, ATP-binding protein  41.47 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4902  ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 
254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4535  ABC transporter, ATP-binding protein  39.24 
 
 
254 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4516  ABC transporter, ATP-binding protein  39.24 
 
 
254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4922  ABC transporter, ATP-binding protein  39.24 
 
 
254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4557  ABC transporter related  39.74 
 
 
255 aa  162  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.218362  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  34.78 
 
 
247 aa  161  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  39.24 
 
 
254 aa  161  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4676  ABC transporter ATP-binding protein  38.82 
 
 
254 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5037  ABC transporter ATP-binding protein  38.82 
 
 
254 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  38.05 
 
 
432 aa  160  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11500  ABC transporter related  45.37 
 
 
257 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4614  ABC transporter related  38.82 
 
 
254 aa  159  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4539  ABC transporter related  36.48 
 
 
256 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.113352 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0150  ABC transporter related  35.22 
 
 
252 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  37.97 
 
 
278 aa  158  9e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3455  ABC transporter-related protein  39.81 
 
 
254 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.302044  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  37.5 
 
 
256 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  34.82 
 
 
265 aa  156  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  39.04 
 
 
251 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2783  ABC transporter related  42.41 
 
 
257 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6299  ABC transporter related  36.25 
 
 
285 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  37.84 
 
 
339 aa  155  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4901  ABC transporter, ATP-binding protein  38.86 
 
 
229 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
426 aa  154  9e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  39.04 
 
 
251 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1472  ABC transporter related  38.2 
 
 
292 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211771  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2359  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  33.19 
 
 
259 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.504714 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  37.66 
 
 
291 aa  153  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3080  ABC transporter related  35.71 
 
 
290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178187  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  36.07 
 
 
445 aa  152  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4216  ABC transporter related  34.07 
 
 
256 aa  152  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  35.21 
 
 
257 aa  152  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.3 
 
 
251 aa  151  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  34.43 
 
 
448 aa  151  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4036  ABC transporter related  33.94 
 
 
273 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.494746  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  38.29 
 
 
258 aa  151  1e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  38.6 
 
 
251 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4565  taurine transporter ATP-binding subunit  33.94 
 
 
255 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.739 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3426  ABC transporter ATP-binding protein  38.97 
 
 
356 aa  151  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00810027 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4148  ABC transporter related  33.94 
 
 
273 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  36.32 
 
 
269 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0551  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  40.61 
 
 
236 aa  150  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.978201  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0437  ABC transporter related  35.37 
 
 
235 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  36.84 
 
 
260 aa  150  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2480  ABC transporter related protein  34.13 
 
 
263 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0452  ABC transporter related  35.37 
 
 
235 aa  150  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3016  ABC transporter related protein  36.87 
 
 
259 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.840701  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  33.19 
 
 
271 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  35.56 
 
 
432 aa  149  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  34.67 
 
 
286 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5375  ABC transporter related  37.38 
 
 
387 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0766723  normal  0.734389 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  35.11 
 
 
286 aa  149  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6161  ABC transporter related  35.75 
 
 
287 aa  149  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.551746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0465  ABC transporter related protein  34.78 
 
 
244 aa  149  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  34.68 
 
 
244 aa  149  3e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>