More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_13650 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_13650  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  100 
 
 
255 aa  518  1e-146  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0393  ABC transporter related  52.51 
 
 
281 aa  276  2e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1153  ABC transporter related  45.56 
 
 
246 aa  226  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0879  ABC transporter related  44.86 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0478  ABC transporter related protein  42.28 
 
 
245 aa  215  4e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1443  ABC transporter related  44.4 
 
 
244 aa  209  3e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.605121 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  52.79 
 
 
267 aa  202  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  45.6 
 
 
250 aa  188  8e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3646  ABC transporter related  48.37 
 
 
270 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3935  ABC transporter related  47.85 
 
 
270 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3203  ABC transporter related  48.7 
 
 
275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565389  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0816  ABC transporter related  47.89 
 
 
263 aa  178  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117233  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0671  ABC transporter related  45.75 
 
 
255 aa  176  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0692  ABC transporter ATP-binding protein  37.72 
 
 
249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0636  ABC transporter, ATP-binding protein  37.72 
 
 
249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000460876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0636  ABC transporter, ATP-binding protein  37.72 
 
 
249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0726  ABC transporter ATP-binding protein  37.72 
 
 
249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00713867  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1667  ABC transporter related  45.6 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0642211  normal  0.357453 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0803  ABC transporter, ATP-binding protein  37.28 
 
 
249 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17589e-46 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4557  ABC transporter related  43.63 
 
 
255 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.218362  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1220  ABC transporter related protein  42.61 
 
 
262 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2066  ABC transporter related protein  38.36 
 
 
244 aa  171  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.572481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0642  ABC transporter related  38.16 
 
 
249 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0783  ABC transporter, ATP-binding protein  39.81 
 
 
249 aa  169  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2295  ABC transporter related  48.97 
 
 
260 aa  169  4e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0668  ABC transporter related  45.67 
 
 
255 aa  169  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0880  ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 
249 aa  168  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018154  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0796  ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 
249 aa  168  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2776  ABC transporter related  45.36 
 
 
262 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4548  ABC transporter, ATP-binding protein  37.73 
 
 
249 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0719358  normal  0.368942 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3016  ABC transporter related protein  50.26 
 
 
259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.840701  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1831  ABC transporter related  44.61 
 
 
270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747209  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0613  ABC transporter-related protein  37.44 
 
 
249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  42.11 
 
 
260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2083  ABC transporter related  45.95 
 
 
223 aa  163  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4036  ABC transporter related  40.39 
 
 
273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.494746  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4148  ABC transporter related  40.39 
 
 
273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3118  ABC transporter related  44.71 
 
 
254 aa  161  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.758008  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2356  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.12 
 
 
270 aa  161  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659325  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1182  ABC transporter related  42.27 
 
 
262 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0880  ABC transporter related  42.71 
 
 
256 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0392492  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0452  ABC transporter related  41.36 
 
 
235 aa  159  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0437  ABC transporter related  41.36 
 
 
235 aa  159  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1135  ABC transporter related  40.68 
 
 
270 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.185737  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1043  ABC transporter related  40.68 
 
 
270 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2961  ABC transporter related  45.74 
 
 
271 aa  158  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0491364  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6299  ABC transporter related  41.35 
 
 
285 aa  158  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  38.89 
 
 
255 aa  158  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  37.44 
 
 
282 aa  158  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0336  ABC transporter, ATP-binding protein  37.44 
 
 
254 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1644  ABC transporter related protein  44.5 
 
 
257 aa  157  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.609657  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2783  ABC transporter related  38.86 
 
 
257 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  44.68 
 
 
270 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  44.17 
 
 
292 aa  157  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  44.44 
 
 
282 aa  156  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3455  ABC transporter-related protein  40.62 
 
 
254 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.302044  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  43.01 
 
 
265 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  43.01 
 
 
265 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  43.01 
 
 
288 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  43.01 
 
 
265 aa  156  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  43.01 
 
 
265 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  41.8 
 
 
272 aa  156  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  43.01 
 
 
288 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4902  ABC transporter, ATP-binding protein  37.44 
 
 
254 aa  156  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  43.01 
 
 
288 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  43.01 
 
 
265 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4614  ABC transporter related  36.95 
 
 
254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4535  ABC transporter, ATP-binding protein  36.45 
 
 
254 aa  155  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2335  ABC transporter related  43.72 
 
 
281 aa  155  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4676  ABC transporter ATP-binding protein  36.45 
 
 
254 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5037  ABC transporter ATP-binding protein  36.45 
 
 
254 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  42.36 
 
 
264 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4516  ABC transporter, ATP-binding protein  36.45 
 
 
254 aa  154  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3080  ABC transporter related  38.08 
 
 
290 aa  154  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178187  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4922  ABC transporter, ATP-binding protein  36.45 
 
 
254 aa  154  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  36.45 
 
 
254 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  40.87 
 
 
253 aa  154  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  40.3 
 
 
285 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  38.82 
 
 
257 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  40.41 
 
 
291 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  37.55 
 
 
286 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  39.11 
 
 
254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.11 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3217  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  42.49 
 
 
265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0035  ABC transporter related  42.49 
 
 
265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2573  ABC transporter related protein  41.58 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1199  ABC transporter ATP-binding protein  39.65 
 
 
270 aa  152  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621607  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0285  ABC transporter related protein  41.58 
 
 
267 aa  152  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120651  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2273  ABC transporter related  42.64 
 
 
275 aa  152  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4901  ABC transporter, ATP-binding protein  36.87 
 
 
229 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0621  ABC transporter related  38.24 
 
 
276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2294  ABC transporter related  42.93 
 
 
248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  40.98 
 
 
267 aa  152  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0448  ABC transporter, ATP-binding protein  40.62 
 
 
249 aa  151  8e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0052  ABC transporter related  41.97 
 
 
265 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  42.06 
 
 
252 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0034  ABC transporter related  41.97 
 
 
265 aa  151  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0037  ABC transporter related  41.97 
 
 
265 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0033  ABC transporter related  41.97 
 
 
265 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  42.72 
 
 
244 aa  151  8.999999999999999e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>