More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1305 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1305  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  100 
 
 		 277 aa  558  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.19201  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2961  ABC transporter related  46.03 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0491364  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0230  ABC transporter related protein  45.9 
 
 		 275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  45.34 
 
 		 280 aa  212  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3912  ABC transporter related  45.22 
 
 		 276 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00786464  normal  0.17343 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3277  translation initiation factor IF-2  46.25 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1043  ABC transporter related  42.74 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1135  ABC transporter related  42.31 
 
 		 270 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.185737  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2273  ABC transporter related  41.45 
 
 		 275 aa  198  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0286  ABC transporter, ATP binding protein  40.08 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1199  ABC transporter ATP-binding protein  43.36 
 
 		 270 aa  193  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2747  ABC transporter related  40.95 
 
 		 269 aa  192  6e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.769453  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3591  ABC transporter related  38.58 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0262  ABC transporter, ATP binding protein  39.3 
 
 		 281 aa  191  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.263629  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2335  ABC transporter related  40.98 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  43.69 
 
 		 263 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  48 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  47.37 
 
 		 297 aa  189  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  47.11 
 
 		 267 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  41.15 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0816  ABC transporter related  42.73 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117233  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  40.52 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2356  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  40.95 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659325  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  42.57 
 
 		 254 aa  186  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0336  ABC transporter, ATP-binding protein  42.57 
 
 		 254 aa  186  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  42.11 
 
 		 272 aa  186  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4883  ABC transporter related  40.33 
 
 		 269 aa  186  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.641028  normal  0.709013 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1831  ABC transporter related  40.52 
 
 		 270 aa  185  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747209  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4036  ABC transporter related  40.89 
 
 		 273 aa  185  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.494746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4148  ABC transporter related  40.89 
 
 		 273 aa  185  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4516  ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4922  ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1433  ABC transporter related  43.83 
 
 		 292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4902  ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 		 254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2106  ABC transporter related  43.05 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  44.2 
 
 		 252 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4614  ABC transporter related  39.66 
 
 		 254 aa  183  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  44.2 
 
 		 252 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3211  ABC transporter related  39.77 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  43.42 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  41.3 
 
 		 288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4535  ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 		 254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  42.79 
 
 		 263 aa  182  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0956  ABC transporter related  40.17 
 
 		 274 aa  182  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  44.6 
 
 		 304 aa  182  6e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  43.42 
 
 		 272 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2253  ABC transporter related  42.92 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.460298  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4676  ABC transporter ATP-binding protein  41.58 
 
 		 254 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5037  ABC transporter ATP-binding protein  41.58 
 
 		 254 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1284  ABC transporter-like protein  42.92 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0530246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1055  ABC transporter related  41.39 
 
 		 292 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258334  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0962  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.63 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.439268 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  39.32 
 
 		 279 aa  181  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  43.19 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3061  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  37.02 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00453099  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  37.55 
 
 		 254 aa  179  4e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  48.97 
 
 		 280 aa  179  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  49.03 
 
 		 261 aa  179  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11500  ABC transporter related  36.84 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319747  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  43.75 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  42.27 
 
 		 259 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  41.11 
 
 		 299 aa  179  5.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2749  sulfonate/taurine ABC transporter ATP-binding protein  36.64 
 
 		 259 aa  178  9e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  40.41 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  46.46 
 
 		 267 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.04 
 
 		 272 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  42.36 
 
 		 254 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2573  ABC transporter related protein  38.2 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1153  ABC transporter related  38.17 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4901  ABC transporter, ATP-binding protein  41.92 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3335  ABC transporter related  41.59 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127136  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001609  nitrate ABC transporter ATP-binding protein  39.43 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  39.92 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  45.45 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2266  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.8 
 
 		 587 aa  176  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.278164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  37.5 
 
 		 274 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  40.08 
 
 		 278 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2066  ABC transporter related protein  36.91 
 
 		 244 aa  176  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.572481  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05590  hypothetical protein  39.92 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6068  ABC transporter ATP-binding protein  40.81 
 
 		 270 aa  175  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  41.41 
 
 		 260 aa  175  7e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2257  ABC transporter related  40.08 
 
 		 285 aa  175  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 265 aa  175  9e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  41.36 
 
 		 259 aa  175  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3217  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  38.52 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0052  ABC transporter related  39.53 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3059  taurine import ATP-binding protein TauB  38.08 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  44.67 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4200  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.55 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  43.56 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 288 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 288 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  40.62 
 
 		 301 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0034  ABC transporter related  42.47 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3605  ABC transporter related  43.39 
 
 		 287 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.475451  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 288 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>