More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2217 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2217  ABC transporter related  100 
 
 		 277 aa  572  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.294499 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0925  ABC transporter ATP-binding protein  53.68 
 
 		 288 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.85132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2215  ABC transporter related  46.03 
 
 		 279 aa  256  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  46.82 
 
 		 291 aa  245  6e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  45.52 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  44.78 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0927  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component-like protein  41.24 
 
 		 296 aa  237  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  44.75 
 
 		 283 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  48.03 
 
 		 251 aa  231  1e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  49.18 
 
 		 290 aa  229  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.34 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  43.28 
 
 		 282 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  42.97 
 
 		 261 aa  225  6e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  43.8 
 
 		 252 aa  225  6e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  45.76 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  44.4 
 
 		 259 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  42.22 
 
 		 279 aa  223  4e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  42.86 
 
 		 254 aa  222  6e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  43.08 
 
 		 267 aa  221  7e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  42.29 
 
 		 267 aa  221  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  43.63 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  46.31 
 
 		 288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  45.31 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  47.08 
 
 		 263 aa  219  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  42.04 
 
 		 254 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  45.12 
 
 		 274 aa  218  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  42.04 
 
 		 254 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  40.98 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.44 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  43.22 
 
 		 255 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  42.69 
 
 		 267 aa  216  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  43.08 
 
 		 278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4878  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.65 
 
 		 265 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.0921087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  44.35 
 
 		 259 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1472  ABC transporter related  45.11 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211771  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  43.31 
 
 		 301 aa  216  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  43.8 
 
 		 261 aa  216  5e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  42.74 
 
 		 260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  43.55 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  43.03 
 
 		 252 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  42.08 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  43.2 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  47.23 
 
 		 281 aa  212  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  44.58 
 
 		 261 aa  212  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0052  ABC transporter related  42.47 
 
 		 265 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  42.02 
 
 		 259 aa  211  9e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3960  ABC transporter related  42.47 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  43.15 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  45.27 
 
 		 304 aa  211  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0037  ABC transporter related  42.08 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0033  ABC transporter related  42.08 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  42.74 
 
 		 259 aa  210  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  42.74 
 
 		 245 aa  209  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  47 
 
 		 273 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 		 264 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  42.64 
 
 		 293 aa  209  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  40.55 
 
 		 272 aa  209  5e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  44.17 
 
 		 253 aa  209  5e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  45.49 
 
 		 295 aa  209  5e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3217  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  42.08 
 
 		 265 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  42.64 
 
 		 293 aa  209  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0025  ABC transporter related  41.7 
 
 		 265 aa  208  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0034  ABC transporter related  41.7 
 
 		 265 aa  208  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  42.13 
 
 		 257 aa  208  8e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  45.38 
 
 		 264 aa  208  9e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  46.95 
 
 		 307 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  41.31 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4034  ABC transporter related  42.86 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0494  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  42.86 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  41.31 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  41.31 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  41.31 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  41.31 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  43.36 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  41.31 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  41.31 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  41.31 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  45.95 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0035  ABC transporter related  41.31 
 
 		 265 aa  205  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3611  ABC transporter related  43.9 
 
 		 275 aa  205  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  44.12 
 
 		 260 aa  205  7e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  40.7 
 
 		 262 aa  204  9e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  44.67 
 
 		 263 aa  204  9e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  42.92 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  41.57 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  43.57 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  41.39 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  39.92 
 
 		 259 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  41.57 
 
 		 263 aa  203  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0807  ABC transporter related  42.15 
 
 		 269 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455697  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  41 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  42.13 
 
 		 263 aa  203  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  39.25 
 
 		 279 aa  202  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42.99 
 
 		 281 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  46.26 
 
 		 280 aa  202  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  45.23 
 
 		 260 aa  202  5e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  40.98 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  41.91 
 
 		 253 aa  202  6e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  41.48 
 
 		 303 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  44.75 
 
 		 246 aa  201  8e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>