More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5619 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5619  ABC transporter related  100 
 
 		 278 aa  546  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  78.09 
 
 		 262 aa  394  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  75.29 
 
 		 265 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  74 
 
 		 271 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  74.4 
 
 		 273 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  74.4 
 
 		 273 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  72.05 
 
 		 265 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  73.2 
 
 		 275 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  72.05 
 
 		 265 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  73.6 
 
 		 266 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  73.2 
 
 		 266 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3265  ABC transporter related  73.6 
 
 		 273 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.952951 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  67.73 
 
 		 263 aa  353  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  67.32 
 
 		 263 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  67.73 
 
 		 264 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  65.89 
 
 		 262 aa  333  2e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  67.42 
 
 		 268 aa  332  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  67.58 
 
 		 276 aa  327  9e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0116  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  63.74 
 
 		 276 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3269  ABC transporter related  63.75 
 
 		 263 aa  315  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874896 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  62.8 
 
 		 280 aa  315  6e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31130  ABC transporter ATP binding protein  64.45 
 
 		 264 aa  310  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.098287  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4901  ABC transporter related  68.7 
 
 		 265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  57.46 
 
 		 270 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4837  ABC transporter related  67.07 
 
 		 263 aa  299  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.856491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1167  ABC transporter related  65.1 
 
 		 266 aa  294  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259654  normal  0.174224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1327  ABC transporter related  64.71 
 
 		 266 aa  290  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  0.338067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0859  ABC transporter related  59.76 
 
 		 258 aa  265  8e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0340597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  48.15 
 
 		 262 aa  254  8e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  47.95 
 
 		 251 aa  251  7e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  52.76 
 
 		 284 aa  248  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.68 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  53.12 
 
 		 282 aa  237  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  45.68 
 
 		 252 aa  236  3e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  46 
 
 		 253 aa  236  4e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  49.8 
 
 		 259 aa  234  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  46.03 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  52.19 
 
 		 259 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  43.03 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  45.53 
 
 		 256 aa  231  7.000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  47.95 
 
 		 265 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0528  ABC transporter related  46.12 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  53.52 
 
 		 261 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  42.21 
 
 		 254 aa  229  3e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  52.89 
 
 		 260 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  42.46 
 
 		 254 aa  229  4e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  40.16 
 
 		 254 aa  229  5e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  42.68 
 
 		 254 aa  228  8e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  47.81 
 
 		 254 aa  228  8e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  48.56 
 
 		 285 aa  227  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  48.26 
 
 		 261 aa  226  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  50.44 
 
 		 259 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  46.34 
 
 		 278 aa  226  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  50.62 
 
 		 255 aa  226  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  46.26 
 
 		 258 aa  226  4e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  50.86 
 
 		 271 aa  225  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  46.39 
 
 		 267 aa  225  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  44.49 
 
 		 256 aa  225  6e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  49.33 
 
 		 261 aa  225  7e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  43.93 
 
 		 260 aa  225  7e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.54 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  48.5 
 
 		 260 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  51.93 
 
 		 267 aa  223  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  49.22 
 
 		 264 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  49.55 
 
 		 283 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  49.8 
 
 		 281 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  49.8 
 
 		 281 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  44.53 
 
 		 265 aa  222  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  50.21 
 
 		 274 aa  222  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  49.58 
 
 		 298 aa  222  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  44.49 
 
 		 264 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  50.42 
 
 		 262 aa  222  6e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  45.93 
 
 		 267 aa  221  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  48.99 
 
 		 281 aa  221  8e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  44.63 
 
 		 272 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  49.38 
 
 		 288 aa  221  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  45.64 
 
 		 265 aa  221  9e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  43.44 
 
 		 253 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  46.8 
 
 		 287 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  48.35 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  49.56 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  44.63 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  49.56 
 
 		 284 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  49.78 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  48.48 
 
 		 256 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  48.74 
 
 		 274 aa  220  3e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  46.37 
 
 		 287 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  47.19 
 
 		 246 aa  219  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  48.16 
 
 		 281 aa  219  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  51.92 
 
 		 261 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  49.37 
 
 		 262 aa  218  6e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.77 
 
 		 281 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  44.06 
 
 		 286 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  48.26 
 
 		 285 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 251 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  47.49 
 
 		 279 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  48.84 
 
 		 267 aa  217  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  47.58 
 
 		 303 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  47.79 
 
 		 259 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  46.98 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>