More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1167 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1167  ABC transporter related  100 
 
 		 266 aa  510  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259654  normal  0.174224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1327  ABC transporter related  99.25 
 
 		 266 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  0.338067 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4901  ABC transporter related  86.74 
 
 		 265 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4837  ABC transporter related  85.14 
 
 		 263 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.856491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  66.8 
 
 		 270 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  71.49 
 
 		 268 aa  338  4e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  69.35 
 
 		 264 aa  335  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  69.35 
 
 		 262 aa  329  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  65.64 
 
 		 280 aa  328  6e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  66.67 
 
 		 263 aa  326  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  66.4 
 
 		 263 aa  326  3e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  63.74 
 
 		 276 aa  322  5e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  65.5 
 
 		 265 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  65.5 
 
 		 265 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  64.96 
 
 		 262 aa  319  3e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0116  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  61.17 
 
 		 276 aa  316  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  64.31 
 
 		 265 aa  316  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  67.48 
 
 		 275 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31130  ABC transporter ATP binding protein  66.53 
 
 		 264 aa  307  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.098287  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  67.48 
 
 		 266 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  67.48 
 
 		 266 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  67.07 
 
 		 273 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  67.07 
 
 		 273 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3265  ABC transporter related  67.07 
 
 		 273 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.952951 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  66.67 
 
 		 271 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3269  ABC transporter related  60.89 
 
 		 263 aa  295  5e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874896 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5619  ABC transporter related  66.8 
 
 		 278 aa  288  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0859  ABC transporter related  60.75 
 
 		 258 aa  279  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0340597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.18 
 
 		 284 aa  257  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  48.22 
 
 		 261 aa  241  6e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  47.52 
 
 		 258 aa  240  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  46.77 
 
 		 251 aa  236  3e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  49.39 
 
 		 260 aa  235  6e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  51.46 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  48.8 
 
 		 278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  46.37 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  43.98 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  48.12 
 
 		 260 aa  233  3e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  46.5 
 
 		 253 aa  232  6e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  48.68 
 
 		 262 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  41.87 
 
 		 258 aa  231  1e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  47.44 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  48.23 
 
 		 264 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  47.95 
 
 		 263 aa  230  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2936  ABC transporter related  46.56 
 
 		 250 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  45.83 
 
 		 267 aa  228  8e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  49.17 
 
 		 285 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  47.98 
 
 		 265 aa  226  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  45.87 
 
 		 265 aa  226  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  46.12 
 
 		 246 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  43.9 
 
 		 252 aa  226  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  50.88 
 
 		 286 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4887  ABC transporter related  49.61 
 
 		 259 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.546298  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  44.35 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  47.56 
 
 		 282 aa  224  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  42.68 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  44.72 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  46.75 
 
 		 434 aa  222  4.9999999999999996e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  41.94 
 
 		 254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  51.77 
 
 		 288 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  46.75 
 
 		 438 aa  222  6e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  47.84 
 
 		 262 aa  221  7e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  46.4 
 
 		 267 aa  221  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  43.33 
 
 		 256 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  47.13 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  45.53 
 
 		 261 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  45.85 
 
 		 262 aa  220  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  48.95 
 
 		 279 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  41.94 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  50.88 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  46.99 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  46.99 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  48.59 
 
 		 278 aa  219  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  46.31 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  48.59 
 
 		 281 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  48.59 
 
 		 281 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  49.35 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  45.19 
 
 		 259 aa  219  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  46.8 
 
 		 281 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  48.54 
 
 		 279 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  41.53 
 
 		 254 aa  218  6e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1561  ABC transporter related  47.43 
 
 		 291 aa  218  6e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000732497 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  48.19 
 
 		 281 aa  218  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  48.36 
 
 		 281 aa  217  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  45.77 
 
 		 267 aa  217  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  45.9 
 
 		 259 aa  217  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  48.12 
 
 		 287 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  51.05 
 
 		 264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  51.84 
 
 		 252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  48.32 
 
 		 272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  50.45 
 
 		 264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  46.99 
 
 		 271 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  49.79 
 
 		 311 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0550  ABC transporter related  45.16 
 
 		 276 aa  215  5e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.589055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  47.58 
 
 		 304 aa  215  5e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  45.61 
 
 		 271 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  45.04 
 
 		 259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.56 
 
 		 281 aa  215  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4878  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.15 
 
 		 265 aa  215  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.0921087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  44.49 
 
 		 260 aa  214  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>