More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1261 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1261  ABC transporter related  100 
 
 
257 aa  489  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.192421  normal  0.0152402 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  54.35 
 
 
271 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  53.09 
 
 
267 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  51.45 
 
 
270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  51.53 
 
 
267 aa  215  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  52.97 
 
 
268 aa  216  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  49.59 
 
 
276 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  44.27 
 
 
274 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.7 
 
 
324 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  46.22 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  50.87 
 
 
267 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  43.72 
 
 
274 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3413  ATP-binding protein of ABC transporter  50.41 
 
 
259 aa  211  7e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  46.99 
 
 
277 aa  208  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.29 
 
 
276 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  56.35 
 
 
246 aa  205  8e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  45.56 
 
 
282 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  45.34 
 
 
267 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1090  ABC transporter related  43.78 
 
 
261 aa  201  8e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  42.86 
 
 
246 aa  201  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  43.3 
 
 
252 aa  201  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  46.77 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  46.49 
 
 
276 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  48.74 
 
 
257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  44.53 
 
 
299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  44 
 
 
284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  44.57 
 
 
304 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  44.53 
 
 
306 aa  195  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  43.43 
 
 
266 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  45.19 
 
 
252 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  43.27 
 
 
278 aa  189  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  42.34 
 
 
266 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 
261 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  51.78 
 
 
284 aa  186  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  50.46 
 
 
291 aa  185  6e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  45.42 
 
 
299 aa  185  7e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  47.88 
 
 
284 aa  185  8e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4360  ABC transporter related  47.72 
 
 
257 aa  184  9e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  43.72 
 
 
261 aa  184  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  51.27 
 
 
289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  48.44 
 
 
274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  42.61 
 
 
278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  41.36 
 
 
261 aa  183  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  43.56 
 
 
263 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  44.84 
 
 
257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  43.4 
 
 
255 aa  181  7e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  43.78 
 
 
265 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3141  ABC transporter-related protein  47.75 
 
 
233 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.0402056 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  42.19 
 
 
333 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  43.04 
 
 
258 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2280  ABC transporter related  48.33 
 
 
257 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16771  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  44.54 
 
 
261 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  39.04 
 
 
258 aa  181  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  48.13 
 
 
262 aa  180  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  48.87 
 
 
265 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  45.9 
 
 
265 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  45.9 
 
 
265 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  47.49 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  43.23 
 
 
271 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  44.21 
 
 
264 aa  179  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  43.23 
 
 
271 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  48.09 
 
 
259 aa  179  4.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  39.17 
 
 
432 aa  179  4.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  42.53 
 
 
260 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  42.79 
 
 
271 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5983  ABC transporter ATP-binding protein  49.55 
 
 
267 aa  178  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4057  ABC transporter related  45.12 
 
 
288 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  43.55 
 
 
279 aa  178  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  45.99 
 
 
246 aa  178  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  43.97 
 
 
262 aa  178  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0621  ABC transporter related  45.18 
 
 
276 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  48.78 
 
 
270 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  42.34 
 
 
259 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  48.13 
 
 
244 aa  178  1e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  40.96 
 
 
255 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  43.15 
 
 
279 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  44.12 
 
 
246 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  45.65 
 
 
245 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  44.55 
 
 
264 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  42.49 
 
 
265 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  41.74 
 
 
261 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4164  ABC transporter related  47.06 
 
 
268 aa  176  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143983  normal  0.780966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  45.53 
 
 
252 aa  176  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  49.05 
 
 
260 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  41.74 
 
 
245 aa  176  5e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  45.69 
 
 
267 aa  175  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  41.35 
 
 
264 aa  175  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3789  ABC transporter related  48.44 
 
 
254 aa  175  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0962243  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  43.02 
 
 
268 aa  175  6e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  40 
 
 
259 aa  175  8e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  43.84 
 
 
265 aa  174  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3453  ABC transporter component  46.15 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  49.09 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  45.63 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  44.49 
 
 
261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  41.3 
 
 
271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  45.37 
 
 
254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1394  ABC transporter-like protein  43.84 
 
 
267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317135  normal  0.304507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  45.92 
 
 
278 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  47.42 
 
 
244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>