More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3602 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3602  ABC transporter related  100 
 
 
279 aa  569  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0155  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  83.03 
 
 
276 aa  471  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588792 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2171  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  81.72 
 
 
276 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6048  ABC transporter related  82.47 
 
 
308 aa  435  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.713083 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6249  ABC transporter related  82.07 
 
 
313 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1243  ABC transporter related  81.27 
 
 
332 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.756326  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6534  ABC transporter related  81.27 
 
 
336 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6589  ABC transporter related  81.27 
 
 
332 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6193  ABC transporter related  81.2 
 
 
332 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1880  ABC transporter, ATP-binding protein  74.45 
 
 
276 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1868  ABC transporter, ATP-binding protein  74.45 
 
 
276 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0820  ABC transporter, ATP-binding protein  74.45 
 
 
276 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0049646  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1685  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  74.45 
 
 
276 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859906  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0341  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  74.45 
 
 
276 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0338  ABC transporter  73.13 
 
 
291 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2035  ABC transporter, ATP-binding protein  73.72 
 
 
276 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.9269  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5197  ABC transporter, ATP-binding protein  72.93 
 
 
286 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30910  ABC transporter, ATP-binding protein  76.1 
 
 
276 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4138  ABC transporter (ATP-binding protein)  75 
 
 
279 aa  384  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.285064  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1398  ABC transporter related  73.98 
 
 
288 aa  377  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34780  putative ABC transporter ATP-binding component  75.81 
 
 
282 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0748092  normal  0.0155255 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1796  ABC transporter related protein  72.33 
 
 
284 aa  376  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0171  ABC transporter ATP-binding protein  73.96 
 
 
287 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2678  ABC transporter related  68.4 
 
 
298 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0192  ABC transporter related  74.34 
 
 
287 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0190  ABC transporter related  73.58 
 
 
287 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746927  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0139  ABC transporter-like  72.93 
 
 
286 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5056  ABC transporter related  72.93 
 
 
287 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1298  ABC transporter related  69.92 
 
 
278 aa  359  3e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3451  ABC transporter related  74.24 
 
 
578 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90461  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0513  ABC transporter related  70.56 
 
 
313 aa  347  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3154  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  62.93 
 
 
276 aa  335  5e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3891  ABC transporter related  64.4 
 
 
258 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524263  normal  0.0369893 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5059  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  63.49 
 
 
271 aa  332  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6692  putative ABC transporter (ATP binding subunit)  66.81 
 
 
259 aa  321  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0056  ABC transporter related  68.33 
 
 
256 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0056  ABC transporter related  67.87 
 
 
256 aa  316  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6245  ABC transporter related  59.85 
 
 
272 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0537  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.6 
 
 
254 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1121  ABC transporter related  58.27 
 
 
292 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4124  ABC transporter related  63.01 
 
 
264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4011  ABC transporter related  63.01 
 
 
264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38128  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4372  ABC transporter related  62.3 
 
 
256 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03034  ABC transporter ATP-binding protein  62.6 
 
 
261 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.459171  normal  0.0870544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1583  ABC transporter related  57.65 
 
 
271 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1729  ABC transporter related protein  58.63 
 
 
265 aa  287  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4506  ABC transporter related  61.67 
 
 
265 aa  278  5e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3454  ABC transporter related  54.02 
 
 
282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162103  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4889  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.65 
 
 
257 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  49.57 
 
 
264 aa  224  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  46.99 
 
 
264 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  47.47 
 
 
256 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  54.77 
 
 
264 aa  219  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  47.62 
 
 
278 aa  218  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  46.18 
 
 
273 aa  218  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  51.1 
 
 
280 aa  217  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50.92 
 
 
279 aa  216  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  52.04 
 
 
262 aa  214  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  44.91 
 
 
256 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  48.85 
 
 
254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  46.76 
 
 
261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  54.29 
 
 
257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  46.19 
 
 
272 aa  212  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  46.19 
 
 
272 aa  212  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  48.22 
 
 
266 aa  212  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  46.19 
 
 
272 aa  211  7.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  48 
 
 
286 aa  211  9e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  47.93 
 
 
258 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  49.07 
 
 
306 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  46.64 
 
 
271 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  46.64 
 
 
271 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  43.64 
 
 
258 aa  209  5e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  46.64 
 
 
265 aa  209  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  46.22 
 
 
286 aa  208  7e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  48.15 
 
 
251 aa  208  9e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  47.75 
 
 
274 aa  207  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  50 
 
 
267 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  48.68 
 
 
260 aa  208  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  45.26 
 
 
256 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  45.45 
 
 
271 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  50.98 
 
 
259 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  43.53 
 
 
307 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  47.74 
 
 
267 aa  206  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  44.98 
 
 
267 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  53.09 
 
 
258 aa  206  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  50.23 
 
 
311 aa  205  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  46.9 
 
 
291 aa  205  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  44.68 
 
 
290 aa  206  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  47.93 
 
 
260 aa  206  5e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  51 
 
 
292 aa  205  6e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.22 
 
 
263 aa  205  7e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2105  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  47.47 
 
 
289 aa  205  7e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  49.55 
 
 
278 aa  205  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  51.49 
 
 
293 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  45.38 
 
 
271 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  49.06 
 
 
253 aa  204  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  43.98 
 
 
254 aa  203  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.02 
 
 
281 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  52.04 
 
 
260 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4565  taurine transporter ATP-binding subunit  47.66 
 
 
255 aa  203  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>