More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0155 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0155  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  100 
 
 
276 aa  565  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588792 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2171  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  90.94 
 
 
276 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3602  ABC transporter related  83.03 
 
 
279 aa  471  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6534  ABC transporter related  82.68 
 
 
336 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6249  ABC transporter related  83.6 
 
 
313 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6193  ABC transporter related  82.8 
 
 
332 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1243  ABC transporter related  82.8 
 
 
332 aa  427  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.756326  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6589  ABC transporter related  82.8 
 
 
332 aa  427  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6048  ABC transporter related  81.64 
 
 
308 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.713083 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30910  ABC transporter, ATP-binding protein  76.54 
 
 
276 aa  401  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5197  ABC transporter, ATP-binding protein  74.72 
 
 
286 aa  394  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0820  ABC transporter, ATP-binding protein  72.43 
 
 
276 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0049646  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0338  ABC transporter  74.43 
 
 
291 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4138  ABC transporter (ATP-binding protein)  74.03 
 
 
279 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.285064  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1880  ABC transporter, ATP-binding protein  72.43 
 
 
276 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1685  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  72.43 
 
 
276 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859906  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0341  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  72.43 
 
 
276 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1868  ABC transporter, ATP-binding protein  72.43 
 
 
276 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2035  ABC transporter, ATP-binding protein  71.69 
 
 
276 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.9269  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0171  ABC transporter ATP-binding protein  79.6 
 
 
287 aa  384  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0192  ABC transporter related  79.6 
 
 
287 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0190  ABC transporter related  79.28 
 
 
287 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746927  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0139  ABC transporter-like  76.56 
 
 
286 aa  378  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1398  ABC transporter related  70.98 
 
 
288 aa  378  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34780  putative ABC transporter ATP-binding component  73.93 
 
 
282 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0748092  normal  0.0155255 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1796  ABC transporter related protein  73.58 
 
 
284 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2678  ABC transporter related  68.91 
 
 
298 aa  371  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5056  ABC transporter related  78.09 
 
 
287 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1298  ABC transporter related  71.14 
 
 
278 aa  365  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3451  ABC transporter related  73.71 
 
 
578 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90461  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0513  ABC transporter related  68.7 
 
 
313 aa  352  4e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3154  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  64.26 
 
 
276 aa  331  8e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3891  ABC transporter related  64.26 
 
 
258 aa  331  9e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524263  normal  0.0369893 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5059  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  62.45 
 
 
271 aa  326  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1121  ABC transporter related  59.14 
 
 
292 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0056  ABC transporter related  63.41 
 
 
256 aa  319  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4124  ABC transporter related  62.7 
 
 
264 aa  318  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4011  ABC transporter related  62.7 
 
 
264 aa  318  5e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38128  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0056  ABC transporter related  62.6 
 
 
256 aa  317  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6692  putative ABC transporter (ATP binding subunit)  68.33 
 
 
259 aa  317  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0537  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.92 
 
 
254 aa  314  9e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03034  ABC transporter ATP-binding protein  62.2 
 
 
261 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.459171  normal  0.0870544 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6245  ABC transporter related  61.54 
 
 
272 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4372  ABC transporter related  61.9 
 
 
256 aa  310  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1729  ABC transporter related protein  57.63 
 
 
265 aa  295  6e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1583  ABC transporter related  56.18 
 
 
271 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4506  ABC transporter related  60.08 
 
 
265 aa  284  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3454  ABC transporter related  55.21 
 
 
282 aa  271  7e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162103  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4889  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.05 
 
 
257 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  51.28 
 
 
264 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  54.55 
 
 
264 aa  229  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  51.39 
 
 
306 aa  223  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  50.69 
 
 
254 aa  223  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  46.92 
 
 
273 aa  222  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  55.67 
 
 
280 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  52.94 
 
 
262 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  55.28 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  45.06 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  53.11 
 
 
278 aa  219  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  50.22 
 
 
260 aa  217  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  48.44 
 
 
286 aa  217  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  47.69 
 
 
261 aa  217  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  52.28 
 
 
265 aa  217  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  46.54 
 
 
256 aa  215  5.9999999999999996e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  45.7 
 
 
271 aa  214  9e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  46.09 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  48.12 
 
 
279 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  46.09 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  51.39 
 
 
303 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  51.39 
 
 
303 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  51.39 
 
 
303 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  48.65 
 
 
274 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  46.58 
 
 
266 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  48.9 
 
 
292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  48.15 
 
 
308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  53.85 
 
 
257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  49.39 
 
 
262 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2105  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  45.08 
 
 
289 aa  212  3.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  47.11 
 
 
286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  44.96 
 
 
297 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  45.83 
 
 
256 aa  211  7.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  45.83 
 
 
254 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4565  taurine transporter ATP-binding subunit  46.15 
 
 
255 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.739 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  53.73 
 
 
311 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  54.19 
 
 
311 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  48.23 
 
 
291 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  44.55 
 
 
258 aa  210  2e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  45.31 
 
 
271 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  49.55 
 
 
278 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  47.77 
 
 
260 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  49.07 
 
 
251 aa  210  2e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  54.12 
 
 
258 aa  209  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  42.57 
 
 
272 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  47.84 
 
 
304 aa  209  3e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  54.08 
 
 
259 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0429  ABC transporter related  53.2 
 
 
313 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0115377  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  50.93 
 
 
253 aa  209  4e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.78 
 
 
263 aa  209  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1296  ABC transporter related  48.62 
 
 
265 aa  209  5e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  44.66 
 
 
271 aa  208  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>