More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_30910 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_30910  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
276 aa  556  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5197  ABC transporter, ATP-binding protein  79.78 
 
 
286 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0338  ABC transporter  84 
 
 
291 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0139  ABC transporter-like  80.88 
 
 
286 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0190  ABC transporter related  82.21 
 
 
287 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746927  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4138  ABC transporter (ATP-binding protein)  77.13 
 
 
279 aa  404  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.285064  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0171  ABC transporter ATP-binding protein  81.82 
 
 
287 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0155  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  76.54 
 
 
276 aa  401  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0192  ABC transporter related  81.82 
 
 
287 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34780  putative ABC transporter ATP-binding component  79.53 
 
 
282 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0748092  normal  0.0155255 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5056  ABC transporter related  82.21 
 
 
287 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2171  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  76.8 
 
 
276 aa  391  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3602  ABC transporter related  76.1 
 
 
279 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1398  ABC transporter related  71.26 
 
 
288 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6249  ABC transporter related  72.9 
 
 
313 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1243  ABC transporter related  74.03 
 
 
332 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.756326  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6193  ABC transporter related  74.03 
 
 
332 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6589  ABC transporter related  74.03 
 
 
332 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6048  ABC transporter related  73.64 
 
 
308 aa  381  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.713083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2678  ABC transporter related  73 
 
 
298 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1796  ABC transporter related protein  71.04 
 
 
284 aa  378  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6534  ABC transporter related  74.5 
 
 
336 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1298  ABC transporter related  72.16 
 
 
278 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0513  ABC transporter related  74.3 
 
 
313 aa  368  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3451  ABC transporter related  77.68 
 
 
578 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90461  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1685  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  73.39 
 
 
276 aa  347  9e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859906  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0341  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  73.39 
 
 
276 aa  347  9e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1868  ABC transporter, ATP-binding protein  73.39 
 
 
276 aa  347  9e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1880  ABC transporter, ATP-binding protein  73.39 
 
 
276 aa  347  9e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0820  ABC transporter, ATP-binding protein  73.39 
 
 
276 aa  347  9e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0049646  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2035  ABC transporter, ATP-binding protein  72.58 
 
 
276 aa  343  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.9269  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3154  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  61.65 
 
 
276 aa  334  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3891  ABC transporter related  61.98 
 
 
258 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524263  normal  0.0369893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0537  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.28 
 
 
254 aa  329  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0056  ABC transporter related  65.18 
 
 
256 aa  328  6e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4011  ABC transporter related  63.6 
 
 
264 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38128  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4124  ABC transporter related  63.6 
 
 
264 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0056  ABC transporter related  64.37 
 
 
256 aa  323  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6692  putative ABC transporter (ATP binding subunit)  67.26 
 
 
259 aa  324  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03034  ABC transporter ATP-binding protein  64 
 
 
261 aa  322  3e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.459171  normal  0.0870544 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5059  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  63.35 
 
 
271 aa  322  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4372  ABC transporter related  65.6 
 
 
256 aa  321  8e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6245  ABC transporter related  63.1 
 
 
272 aa  318  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1729  ABC transporter related protein  61.72 
 
 
265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1121  ABC transporter related  58.7 
 
 
292 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1583  ABC transporter related  60.57 
 
 
271 aa  288  8e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4506  ABC transporter related  57.53 
 
 
265 aa  277  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3454  ABC transporter related  54.4 
 
 
282 aa  271  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162103  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4889  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.25 
 
 
257 aa  239  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  45.55 
 
 
306 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  48.86 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  48.74 
 
 
267 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  44.09 
 
 
256 aa  215  7e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  45.83 
 
 
278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  45.04 
 
 
308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  46.67 
 
 
256 aa  212  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  49.31 
 
 
307 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  47.35 
 
 
286 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  45.34 
 
 
271 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  46.12 
 
 
272 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  46.56 
 
 
267 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  50.67 
 
 
283 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  44.57 
 
 
271 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  49.77 
 
 
279 aa  208  8e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  46.51 
 
 
279 aa  208  8e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  50.88 
 
 
262 aa  208  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  46.56 
 
 
272 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  44.98 
 
 
271 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  51.56 
 
 
311 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  46.96 
 
 
291 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  46.02 
 
 
286 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  47.5 
 
 
264 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  50.23 
 
 
278 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  44.53 
 
 
263 aa  206  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  47.44 
 
 
304 aa  206  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  49.55 
 
 
259 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  47.9 
 
 
260 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  42.5 
 
 
256 aa  206  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  48.62 
 
 
281 aa  206  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  48.58 
 
 
292 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  46.44 
 
 
280 aa  203  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  41.7 
 
 
272 aa  203  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  41.7 
 
 
272 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0429  ABC transporter related  52.68 
 
 
313 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0115377  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  50.25 
 
 
258 aa  203  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  49.54 
 
 
304 aa  202  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  46.58 
 
 
253 aa  203  3e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  47.48 
 
 
259 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  41.7 
 
 
272 aa  202  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4878  putative ABC transporter, ATP-binding protein  51.14 
 
 
265 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.0921087 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  42.12 
 
 
293 aa  202  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  48.39 
 
 
251 aa  202  5e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  49.33 
 
 
311 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  50 
 
 
260 aa  202  6e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  48.87 
 
 
274 aa  202  6e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  41.76 
 
 
293 aa  202  7e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  48.61 
 
 
264 aa  201  7e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  48.15 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  47.49 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  44.27 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>