More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4372 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4372  ABC transporter related  100 
 
 
256 aa  523  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0056  ABC transporter related  80.97 
 
 
256 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0056  ABC transporter related  78.95 
 
 
256 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6692  putative ABC transporter (ATP binding subunit)  78 
 
 
259 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3154  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  74.41 
 
 
276 aa  384  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4124  ABC transporter related  73.05 
 
 
264 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4011  ABC transporter related  73.05 
 
 
264 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38128  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3891  ABC transporter related  74.41 
 
 
258 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524263  normal  0.0369893 
 
 
-
 
NC_003296  RS03034  ABC transporter ATP-binding protein  74.5 
 
 
261 aa  377  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.459171  normal  0.0870544 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6245  ABC transporter related  70.28 
 
 
272 aa  345  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0537  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.04 
 
 
254 aa  340  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5059  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  68.95 
 
 
271 aa  338  5e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0338  ABC transporter  66.27 
 
 
291 aa  334  7e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1398  ABC transporter related  65.46 
 
 
288 aa  333  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5197  ABC transporter, ATP-binding protein  65.88 
 
 
286 aa  332  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4138  ABC transporter (ATP-binding protein)  65.87 
 
 
279 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.285064  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1796  ABC transporter related protein  64.92 
 
 
284 aa  325  5e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30910  ABC transporter, ATP-binding protein  65.6 
 
 
276 aa  321  7e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2678  ABC transporter related  69.2 
 
 
298 aa  318  7e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34780  putative ABC transporter ATP-binding component  64.54 
 
 
282 aa  315  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0748092  normal  0.0155255 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1298  ABC transporter related  63.71 
 
 
278 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1243  ABC transporter related  61.57 
 
 
332 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.756326  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6589  ABC transporter related  61.57 
 
 
332 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6249  ABC transporter related  60.78 
 
 
313 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6193  ABC transporter related  62.06 
 
 
332 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1121  ABC transporter related  61.57 
 
 
292 aa  311  9e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0155  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  61.9 
 
 
276 aa  310  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588792 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6534  ABC transporter related  60.39 
 
 
336 aa  310  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0139  ABC transporter-like  63.95 
 
 
286 aa  310  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3602  ABC transporter related  62.3 
 
 
279 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6048  ABC transporter related  68.78 
 
 
308 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.713083 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2171  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  61.9 
 
 
276 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1729  ABC transporter related protein  62.6 
 
 
265 aa  308  5e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4506  ABC transporter related  71.11 
 
 
265 aa  307  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1880  ABC transporter, ATP-binding protein  63.89 
 
 
276 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0820  ABC transporter, ATP-binding protein  63.89 
 
 
276 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0049646  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1868  ABC transporter, ATP-binding protein  63.89 
 
 
276 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1685  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  63.89 
 
 
276 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859906  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0341  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  63.89 
 
 
276 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3451  ABC transporter related  68.81 
 
 
578 aa  304  9.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90461  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2035  ABC transporter, ATP-binding protein  63.49 
 
 
276 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.9269  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0513  ABC transporter related  61.42 
 
 
313 aa  299  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1583  ABC transporter related  64.22 
 
 
271 aa  297  9e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0171  ABC transporter ATP-binding protein  63.45 
 
 
287 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0192  ABC transporter related  63.45 
 
 
287 aa  295  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0190  ABC transporter related  63.05 
 
 
287 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746927  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5056  ABC transporter related  62.75 
 
 
287 aa  292  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3454  ABC transporter related  54.71 
 
 
282 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162103  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  52.65 
 
 
306 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4889  putative ABC transporter ATP-binding protein  52.03 
 
 
257 aa  225  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  50.92 
 
 
283 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  50.46 
 
 
307 aa  218  8.999999999999998e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  52.26 
 
 
264 aa  217  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  51.08 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  47.49 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  50.69 
 
 
287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  47.49 
 
 
272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  47.03 
 
 
272 aa  212  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  48.68 
 
 
308 aa  212  3.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  50 
 
 
293 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  51.13 
 
 
278 aa  211  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  50.45 
 
 
293 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  42.74 
 
 
256 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  47.04 
 
 
272 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  50 
 
 
260 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  49.77 
 
 
259 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  45.04 
 
 
303 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  45.04 
 
 
303 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  45.04 
 
 
303 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  49.55 
 
 
271 aa  208  8e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  50.46 
 
 
267 aa  207  9e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  49.54 
 
 
271 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1284  ABC transporter-like protein  47.73 
 
 
254 aa  207  1e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0530246 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  48.84 
 
 
263 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  48.15 
 
 
304 aa  206  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  44.49 
 
 
273 aa  206  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  50.72 
 
 
271 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  52.24 
 
 
273 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  50.24 
 
 
292 aa  206  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  48.43 
 
 
286 aa  205  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  52.28 
 
 
254 aa  204  8e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  49.54 
 
 
259 aa  204  8e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  50.23 
 
 
304 aa  204  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 
264 aa  204  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  49.32 
 
 
253 aa  204  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3642  ABC transporter related  48.39 
 
 
239 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649736  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  52.15 
 
 
267 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  52.51 
 
 
258 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  51.02 
 
 
278 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  49.77 
 
 
304 aa  201  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  46.64 
 
 
289 aa  201  8e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  48.88 
 
 
311 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  47.49 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  46.58 
 
 
253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  48.87 
 
 
281 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  47.27 
 
 
272 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  51.34 
 
 
278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  48.4 
 
 
260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  44.44 
 
 
265 aa  199  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  48.87 
 
 
262 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>