More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0537 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0537  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 254 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6245  ABC transporter related  78.31 
 
 		 272 aa  407  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5059  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  78.4 
 
 		 271 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3891  ABC transporter related  69.76 
 
 		 258 aa  351  5.9999999999999994e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524263  normal  0.0369893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6692  putative ABC transporter (ATP binding subunit)  68.29 
 
 		 259 aa  351  7e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3154  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  69.76 
 
 		 276 aa  350  8.999999999999999e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4372  ABC transporter related  70.04 
 
 		 256 aa  340  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0056  ABC transporter related  68.02 
 
 		 256 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4124  ABC transporter related  65.31 
 
 		 264 aa  338  4e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4011  ABC transporter related  65.31 
 
 		 264 aa  338  4e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0056  ABC transporter related  67.21 
 
 		 256 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03034  ABC transporter ATP-binding protein  64.52 
 
 		 261 aa  334  7e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.459171  normal  0.0870544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5197  ABC transporter, ATP-binding protein  64.03 
 
 		 286 aa  331  6e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0338  ABC transporter  64.26 
 
 		 291 aa  329  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30910  ABC transporter, ATP-binding protein  63.28 
 
 		 276 aa  329  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1796  ABC transporter related protein  61.54 
 
 		 284 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34780  putative ABC transporter ATP-binding component  63.35 
 
 		 282 aa  319  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0748092  normal  0.0155255 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4138  ABC transporter (ATP-binding protein)  61.75 
 
 		 279 aa  318  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.285064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1121  ABC transporter related  61.29 
 
 		 292 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0155  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  59.92 
 
 		 276 aa  314  8e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588792 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3602  ABC transporter related  61.6 
 
 		 279 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1398  ABC transporter related  59.76 
 
 		 288 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2171  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  59.45 
 
 		 276 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0139  ABC transporter-like  64.4 
 
 		 286 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0190  ABC transporter related  63.6 
 
 		 287 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746927  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6249  ABC transporter related  61.2 
 
 		 313 aa  308  8e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1243  ABC transporter related  60.16 
 
 		 332 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.756326  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6589  ABC transporter related  60.16 
 
 		 332 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6193  ABC transporter related  60.16 
 
 		 332 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6048  ABC transporter related  60.48 
 
 		 308 aa  306  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.713083 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1729  ABC transporter related protein  61.94 
 
 		 265 aa  306  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6534  ABC transporter related  59.38 
 
 		 336 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0192  ABC transporter related  62.4 
 
 		 287 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0171  ABC transporter ATP-binding protein  62.4 
 
 		 287 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2678  ABC transporter related  58.91 
 
 		 298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1298  ABC transporter related  59.11 
 
 		 278 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3451  ABC transporter related  62.61 
 
 		 578 aa  300  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90461  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5056  ABC transporter related  62.8 
 
 		 287 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4506  ABC transporter related  62.86 
 
 		 265 aa  292  4e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0820  ABC transporter, ATP-binding protein  60.89 
 
 		 276 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0049646  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1868  ABC transporter, ATP-binding protein  60.89 
 
 		 276 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1880  ABC transporter, ATP-binding protein  60.89 
 
 		 276 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1685  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  60.89 
 
 		 276 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859906  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0341  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  60.89 
 
 		 276 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0513  ABC transporter related  57.6 
 
 		 313 aa  288  8e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2035  ABC transporter, ATP-binding protein  60.48 
 
 		 276 aa  287  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.9269  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1583  ABC transporter related  58.47 
 
 		 271 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3454  ABC transporter related  55.24 
 
 		 282 aa  261  8e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4889  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.53 
 
 		 257 aa  238  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  51.13 
 
 		 280 aa  223  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  47.22 
 
 		 278 aa  223  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  49.77 
 
 		 264 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  50 
 
 		 265 aa  216  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 		 264 aa  214  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 281 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  48.84 
 
 		 283 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  44.74 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  45.58 
 
 		 279 aa  209  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  46.64 
 
 		 307 aa  209  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  47.71 
 
 		 292 aa  208  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  49.55 
 
 		 260 aa  208  8e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  49.33 
 
 		 267 aa  208  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  43.3 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  43.3 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  43.3 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  47.56 
 
 		 251 aa  206  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  50 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  47.06 
 
 		 266 aa  206  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  47.3 
 
 		 306 aa  206  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  48.13 
 
 		 276 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  49.77 
 
 		 260 aa  206  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  42.04 
 
 		 256 aa  205  5e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  52.07 
 
 		 258 aa  205  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  46.36 
 
 		 272 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  40.65 
 
 		 256 aa  204  9e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  41.96 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  46.88 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  46.58 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  49.52 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  44.8 
 
 		 304 aa  203  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  48.65 
 
 		 278 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  46.61 
 
 		 286 aa  202  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  45.96 
 
 		 253 aa  201  8e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  47.09 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  48.85 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  47.06 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  46.82 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  44.91 
 
 		 289 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  48.33 
 
 		 267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  50.51 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  45.21 
 
 		 297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  43.59 
 
 		 273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  51.04 
 
 		 263 aa  198  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  47.95 
 
 		 275 aa  199  5e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  46.15 
 
 		 267 aa  198  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  44.2 
 
 		 308 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.4 
 
 		 304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  44.44 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  44.4 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  44.44 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>