More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0455 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0455  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  100 
 
 
287 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
261 aa  221  8e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  47.41 
 
 
264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  43.31 
 
 
259 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0845  ABC transporter related  47.31 
 
 
276 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 
259 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  43.98 
 
 
255 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  47.48 
 
 
275 aa  209  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0807  ABC transporter related  42.52 
 
 
269 aa  208  8e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455697  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  46.18 
 
 
253 aa  208  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  45.68 
 
 
274 aa  206  4e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  46.12 
 
 
261 aa  206  5e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  41.02 
 
 
260 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  42.67 
 
 
254 aa  205  6e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  45.12 
 
 
267 aa  205  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  45.28 
 
 
278 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  45.45 
 
 
290 aa  203  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  43.32 
 
 
275 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  42.28 
 
 
283 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  46.81 
 
 
274 aa  203  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  46.55 
 
 
288 aa  203  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  40.94 
 
 
259 aa  202  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  44.05 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  45.38 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  45.08 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  46.44 
 
 
271 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  41.34 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  43.53 
 
 
252 aa  199  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  45.76 
 
 
276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  40.75 
 
 
279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  46.43 
 
 
260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  40.55 
 
 
264 aa  199  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  38.87 
 
 
283 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  40.87 
 
 
271 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  44.02 
 
 
269 aa  198  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  43.57 
 
 
267 aa  198  7e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0667  ABC transporter related  44.35 
 
 
273 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  44.96 
 
 
272 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  41.27 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  38.31 
 
 
261 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  42.55 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2563  ABC-transport protein, ATP-binding protein  44.18 
 
 
288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.25889 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  41.96 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  43.32 
 
 
253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  43.15 
 
 
267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  43.2 
 
 
264 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  43.6 
 
 
264 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  40.3 
 
 
267 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  43.32 
 
 
304 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.58 
 
 
304 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  43.72 
 
 
264 aa  196  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  40.48 
 
 
271 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  42.19 
 
 
260 aa  195  6e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  44.35 
 
 
259 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  43.58 
 
 
263 aa  195  8.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  41.67 
 
 
258 aa  194  1e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7649  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44.26 
 
 
289 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  44.3 
 
 
291 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  42.32 
 
 
258 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  42.34 
 
 
286 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  41.92 
 
 
297 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  41.31 
 
 
259 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  43.35 
 
 
273 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  43.88 
 
 
279 aa  193  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  45.81 
 
 
260 aa  193  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  42.8 
 
 
282 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0734  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  42.86 
 
 
257 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4883  ABC transporter related  40.82 
 
 
269 aa  193  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.641028  normal  0.709013 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  44.81 
 
 
268 aa  192  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0052  ABC transporter related  43.64 
 
 
265 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  42.04 
 
 
262 aa  192  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.21 
 
 
283 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  43.2 
 
 
295 aa  192  5e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  44.59 
 
 
263 aa  192  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  41.46 
 
 
267 aa  192  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.62 
 
 
263 aa  192  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  42.19 
 
 
276 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3277  translation initiation factor IF-2  45.19 
 
 
261 aa  192  5e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0034  ABC transporter related  44.07 
 
 
265 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  44.54 
 
 
293 aa  192  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  42.28 
 
 
272 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0025  ABC transporter related  44.07 
 
 
265 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0037  ABC transporter related  43.64 
 
 
265 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0033  ABC transporter related  43.64 
 
 
265 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  38.4 
 
 
253 aa  192  8e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  39.22 
 
 
279 aa  192  8e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  45.95 
 
 
307 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  41.13 
 
 
254 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  42.51 
 
 
308 aa  191  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  41.18 
 
 
267 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  44.69 
 
 
272 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  40.47 
 
 
256 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  41.98 
 
 
292 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  40.59 
 
 
259 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  42.02 
 
 
284 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  43.61 
 
 
274 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.91 
 
 
324 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  44.12 
 
 
293 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>