More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1233 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1233  ABC transporter related  100 
 
 		 262 aa  507  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1034  ABC transporter related protein  62.3 
 
 		 272 aa  286  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  59.92 
 
 		 263 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0713  ABC transporter related protein  61.33 
 
 		 265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7381  ABC transporter related  60.52 
 
 		 262 aa  277  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4373  ABC transporter related  59.68 
 
 		 297 aa  276  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.403478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3570  ABC transporter related  56.83 
 
 		 265 aa  268  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.476626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3116  ABC transporter related  60.24 
 
 		 241 aa  268  8.999999999999999e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1173  ABC transporter related  59.29 
 
 		 253 aa  267  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628732  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2815  ABC transporter related  59.84 
 
 		 241 aa  267  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000485223 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10000  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  64.38 
 
 		 241 aa  252  4.0000000000000004e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0152878  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  48.1 
 
 		 273 aa  218  7e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  49.58 
 
 		 271 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  54.22 
 
 		 273 aa  208  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  51.3 
 
 		 292 aa  208  7e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  48.64 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  52.36 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  51.27 
 
 		 272 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  48.74 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  45.45 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0408  ABC transporter related  49.36 
 
 		 262 aa  203  2e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.468128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  51.53 
 
 		 264 aa  203  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  48.02 
 
 		 261 aa  202  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  43.42 
 
 		 279 aa  202  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  45.91 
 
 		 256 aa  202  6e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  48.31 
 
 		 271 aa  201  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  48.36 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  52.79 
 
 		 291 aa  199  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  46.32 
 
 		 278 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  45.38 
 
 		 293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  51.77 
 
 		 280 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  45.38 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  46.51 
 
 		 289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  52.68 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  43.67 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  43.67 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  50 
 
 		 284 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  52.49 
 
 		 278 aa  196  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  48.82 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  45.24 
 
 		 263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.13 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  51.15 
 
 		 246 aa  195  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  45.37 
 
 		 289 aa  195  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  51.43 
 
 		 256 aa  195  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  45.81 
 
 		 287 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  47.81 
 
 		 261 aa  194  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  43.23 
 
 		 272 aa  194  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  46.12 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  46.12 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  47.98 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  49.56 
 
 		 263 aa  193  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2536  putative taurine ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 264 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  47.62 
 
 		 260 aa  192  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  45.74 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  44.16 
 
 		 245 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  47.37 
 
 		 267 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  50.64 
 
 		 311 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  43.89 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  49.55 
 
 		 258 aa  191  8e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  47.6 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2560  ABC transporter related  44.49 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1284  ABC transporter-like protein  45.18 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0530246 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  42.73 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  44.3 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  52.25 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3506  ABC transporter related  47.2 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.715593  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  47.32 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  46.75 
 
 		 252 aa  189  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  45.87 
 
 		 276 aa  189  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1321  ABC transporter-like protein  50 
 
 		 288 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251104 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  49.09 
 
 		 257 aa  188  7e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2134  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 260 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841384  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  48.94 
 
 		 311 aa  188  8e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  43.85 
 
 		 267 aa  188  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1296  ABC transporter related  43.32 
 
 		 265 aa  188  8e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  43.24 
 
 		 254 aa  188  9e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  42.06 
 
 		 255 aa  188  9e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.79 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  48.05 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1581  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  50.47 
 
 		 260 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132278  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.32 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0621  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  50.47 
 
 		 260 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00429609  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0696  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  50.47 
 
 		 260 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  42.79 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  45.24 
 
 		 261 aa  186  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2018  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  50.47 
 
 		 260 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.828893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2221  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  50.47 
 
 		 260 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.893896  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  49.79 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  42.86 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0801  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  50.94 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119213  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  46.01 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  43.96 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  45.57 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  41.95 
 
 		 258 aa  185  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0054  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44 
 
 		 257 aa  185  5e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  47.54 
 
 		 295 aa  185  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  39.3 
 
 		 254 aa  185  5e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  44.44 
 
 		 259 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  48.04 
 
 		 288 aa  185  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  45.57 
 
 		 252 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>