More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1254 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1254  ABC transporter related  100 
 
 		 260 aa  507  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00814045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2596  ABC transporter, ATPase subunit  98.08 
 
 		 260 aa  500  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.198098  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1927  ABC transporter related  85 
 
 		 262 aa  391  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.20546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2080  ABC transporter related  62.4 
 
 		 270 aa  295  6e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  51.93 
 
 		 273 aa  243  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  51.68 
 
 		 264 aa  236  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  47.47 
 
 		 273 aa  235  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  49.37 
 
 		 253 aa  233  3e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  51.67 
 
 		 254 aa  229  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  50 
 
 		 263 aa  229  4e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  48.44 
 
 		 261 aa  229  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  49.78 
 
 		 276 aa  226  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  47.62 
 
 		 267 aa  225  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  46.22 
 
 		 295 aa  224  7e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  47.43 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  48.79 
 
 		 279 aa  223  3e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  50.44 
 
 		 253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  45.6 
 
 		 252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  47.41 
 
 		 290 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  46.61 
 
 		 261 aa  219  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  44.44 
 
 		 301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  47.6 
 
 		 261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  47.37 
 
 		 260 aa  218  7e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  49.3 
 
 		 251 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  47.84 
 
 		 259 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  43.82 
 
 		 276 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  50.22 
 
 		 258 aa  217  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  47.84 
 
 		 288 aa  217  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  47.86 
 
 		 264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  52.13 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  47.21 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  42.62 
 
 		 261 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  50 
 
 		 304 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  46.38 
 
 		 278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  50.46 
 
 		 304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  47.21 
 
 		 259 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  45.88 
 
 		 280 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  46.98 
 
 		 264 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  50 
 
 		 304 aa  211  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  47.01 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  38.46 
 
 		 254 aa  209  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1236  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  45.87 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  41.1 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2961  ABC transporter related  45.9 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0491364  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6193  ABC transporter related  53.7 
 
 		 332 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  45.81 
 
 		 308 aa  209  3e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  43.35 
 
 		 297 aa  209  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  49.77 
 
 		 274 aa  209  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1243  ABC transporter related  53.7 
 
 		 332 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.756326  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6589  ABC transporter related  53.7 
 
 		 332 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  46.41 
 
 		 256 aa  209  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  46.12 
 
 		 292 aa  209  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  44.54 
 
 		 263 aa  209  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  46.72 
 
 		 267 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  42.8 
 
 		 255 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  44.18 
 
 		 278 aa  209  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  50 
 
 		 257 aa  209  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.44 
 
 		 257 aa  209  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255113  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4878  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.18 
 
 		 265 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.0921087 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6048  ABC transporter related  52.31 
 
 		 308 aa  208  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.713083 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  50.24 
 
 		 246 aa  208  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0888  ABC transporter related  42.64 
 
 		 284 aa  208  8e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.3127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  46.12 
 
 		 291 aa  207  9e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  50 
 
 		 303 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  50 
 
 		 303 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3602  ABC transporter related  52.31 
 
 		 279 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  48.93 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  45.27 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  51.07 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  44.86 
 
 		 306 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  42.28 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  50.95 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  44 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0164  ABC transporter related  43.19 
 
 		 275 aa  207  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  45.73 
 
 		 284 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0155  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  53.96 
 
 		 276 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588792 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21980  ABC transporter, ATP binding component  49.78 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 		 260 aa  206  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  47.09 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  48.75 
 
 		 311 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.96 
 
 		 283 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  45.69 
 
 		 274 aa  205  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  44.78 
 
 		 278 aa  205  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6249  ABC transporter related  52.31 
 
 		 313 aa  205  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  49.14 
 
 		 311 aa  205  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6534  ABC transporter related  52.31 
 
 		 336 aa  205  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  44.67 
 
 		 267 aa  205  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0767  ABC transporter related  45 
 
 		 265 aa  205  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  45.99 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  48.5 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0039  ABC transporter related  43.8 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147558  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  45.45 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  48.91 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2105  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  44.92 
 
 		 289 aa  202  3e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  47.85 
 
 		 256 aa  203  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  47.19 
 
 		 244 aa  202  4e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  43.37 
 
 		 283 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0845  ABC transporter related  43.6 
 
 		 276 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2171  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  52.97 
 
 		 276 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  45.45 
 
 		 260 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>