More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2816 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  100 
 
 		 244 aa  476  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  61.64 
 
 		 230 aa  230  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  61.5 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  61.33 
 
 		 228 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  61.33 
 
 		 228 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  61.33 
 
 		 228 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3275  cytidylate kinase  63.27 
 
 		 228 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00480456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  58.53 
 
 		 230 aa  218  5e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  57.14 
 
 		 269 aa  205  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  46.19 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  46.54 
 
 		 214 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  45.25 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  51.6 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  51.77 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  43.12 
 
 		 228 aa  186  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  45.54 
 
 		 226 aa  185  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  43.69 
 
 		 224 aa  185  5e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  45.62 
 
 		 230 aa  185  6e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  49.77 
 
 		 224 aa  185  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  45.12 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  44.76 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  45.41 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  45.12 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  45.12 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  45.12 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  47.71 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  45.12 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  46.08 
 
 		 222 aa  182  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  40.93 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5748  cytidylate kinase  43.69 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0113044 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  48.07 
 
 		 251 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  45.12 
 
 		 225 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  48.07 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  45.87 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0780  cytidylate kinase  47.49 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0405191  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  44.86 
 
 		 227 aa  179  4e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4053  cytidylate kinase  51.54 
 
 		 237 aa  179  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.737669  normal  0.51193 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  44.5 
 
 		 233 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  48.87 
 
 		 223 aa  178  5.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  43.72 
 
 		 227 aa  178  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  44.35 
 
 		 240 aa  177  9e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  43.98 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  39.55 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.95 
 
 		 534 aa  176  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  42.2 
 
 		 232 aa  174  9e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  45.29 
 
 		 514 aa  174  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  44.44 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  44.44 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1496  cytidylate kinase  50.89 
 
 		 252 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  46.19 
 
 		 218 aa  172  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.12 
 
 		 526 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.12 
 
 		 511 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0979  cytidylate kinase  49.55 
 
 		 231 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.12 
 
 		 511 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  45.54 
 
 		 225 aa  172  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  46.67 
 
 		 539 aa  171  9e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3589  cytidylate kinase  43.48 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.577192  normal  0.0958027 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  41.47 
 
 		 219 aa  171  1e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  40.71 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  44.5 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  42.4 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  47.77 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  43.38 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  40.28 
 
 		 213 aa  169  4e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  41.05 
 
 		 233 aa  169  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  48.15 
 
 		 250 aa  168  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1456  cytidylate kinase  48.58 
 
 		 268 aa  168  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00727375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.59 
 
 		 529 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  40.27 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  41.85 
 
 		 230 aa  168  9e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  40.99 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  40.67 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  42.22 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  42.22 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  43.75 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2403  cytidylate kinase  41.41 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  40.45 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2999  cytidylate kinase  48.17 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  42.04 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  46.4 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4424  cytidylate kinase  47.71 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  38.43 
 
 		 226 aa  166  4e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  40.65 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  45.95 
 
 		 252 aa  165  5.9999999999999996e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1209  cytidylate kinase  47.3 
 
 		 240 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  41.52 
 
 		 230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0173  cytidylate kinase  43.46 
 
 		 225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000480933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  41.63 
 
 		 219 aa  165  6.9999999999999995e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  45.45 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.4 
 
 		 527 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  45.45 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  45.45 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  42.72 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>