More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1333 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  100 
 
 		 252 aa  496  1e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  69.86 
 
 		 223 aa  298  8e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  67.89 
 
 		 223 aa  270  2e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  47.77 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  51.4 
 
 		 534 aa  194  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  49.54 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47 
 
 		 526 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  49.07 
 
 		 539 aa  191  7e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.13 
 
 		 528 aa  191  7e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.85 
 
 		 511 aa  191  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.85 
 
 		 511 aa  191  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  49.3 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  50 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  48.84 
 
 		 229 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  45.62 
 
 		 228 aa  185  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.54 
 
 		 529 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  45.58 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  50.23 
 
 		 233 aa  183  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  46.54 
 
 		 224 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  48.7 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  52.27 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  49.3 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  44.6 
 
 		 237 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  44.6 
 
 		 220 aa  182  5.0000000000000004e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  44.91 
 
 		 225 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  44.44 
 
 		 225 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  44.44 
 
 		 221 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  44.24 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  48.67 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  44.44 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  45.75 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  47.25 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  44.04 
 
 		 225 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  46.08 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  44.04 
 
 		 225 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  48.67 
 
 		 514 aa  179  2.9999999999999997e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  47.19 
 
 		 232 aa  179  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  46.98 
 
 		 222 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  43.58 
 
 		 229 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  50.68 
 
 		 228 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  46.3 
 
 		 229 aa  178  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  43.06 
 
 		 224 aa  178  8e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  46.08 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  43.98 
 
 		 225 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  43.98 
 
 		 225 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  44.19 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1026  cytidylate kinase  48.58 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000434199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  43.98 
 
 		 225 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  43.98 
 
 		 225 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  43.98 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  49.77 
 
 		 488 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  46.88 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  46.79 
 
 		 227 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  46.79 
 
 		 227 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  46.79 
 
 		 227 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  46.79 
 
 		 227 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  46.79 
 
 		 227 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  46.08 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  46.33 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  46.33 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  46.33 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2669  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410063  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  46.85 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  46.33 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  46.33 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1954  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000903512  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  46.33 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2581  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000568011  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  46.33 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  46.33 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  46.33 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  46.08 
 
 		 228 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  46.08 
 
 		 228 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  49.54 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  49.54 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  44.5 
 
 		 229 aa  175  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  49.54 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.4 
 
 		 516 aa  175  6e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  46.08 
 
 		 234 aa  175  6e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.32 
 
 		 517 aa  175  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  45.97 
 
 		 231 aa  174  9e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  45.97 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  43.4 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  46.95 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  45.79 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.4 
 
 		 516 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  43.56 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  43.87 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  46.23 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  43.52 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  42.47 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  47.73 
 
 		 251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  47.73 
 
 		 251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  47.77 
 
 		 230 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  52.29 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  45.5 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  41.82 
 
 		 226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  43.87 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  49.77 
 
 		 237 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>