More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2147 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  100 
 
 
232 aa  467  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  60.79 
 
 
233 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  60.35 
 
 
233 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  60.81 
 
 
240 aa  280  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  60 
 
 
232 aa  275  4e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  59.74 
 
 
233 aa  274  8e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  60 
 
 
233 aa  267  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  55 
 
 
235 aa  246  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  45.37 
 
 
230 aa  220  9.999999999999999e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  47.79 
 
 
228 aa  218  7.999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  47.03 
 
 
226 aa  217  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  48.15 
 
 
224 aa  209  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.36 
 
 
511 aa  208  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.36 
 
 
511 aa  208  7e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  44.55 
 
 
225 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  44.55 
 
 
225 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  44.55 
 
 
225 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  44.55 
 
 
225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  44.55 
 
 
225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  44.55 
 
 
225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  46.92 
 
 
232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  45.66 
 
 
231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  44.55 
 
 
225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.64 
 
 
488 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.89 
 
 
529 aa  198  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  44.08 
 
 
225 aa  197  9e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.61 
 
 
527 aa  197  9e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  44.08 
 
 
225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  44.08 
 
 
225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.09 
 
 
483 aa  196  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  44.08 
 
 
225 aa  196  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  40.93 
 
 
219 aa  196  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.14 
 
 
480 aa  194  8.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.89 
 
 
516 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  46.63 
 
 
229 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.81 
 
 
534 aa  193  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.29 
 
 
528 aa  193  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  44.98 
 
 
229 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  45.93 
 
 
227 aa  192  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.36 
 
 
516 aa  191  8e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  46.89 
 
 
218 aa  191  8e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  44.02 
 
 
229 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  43.32 
 
 
217 aa  191  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  47 
 
 
251 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  47 
 
 
251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  46.54 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  45.02 
 
 
237 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  42.53 
 
 
221 aa  188  8e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  45.54 
 
 
243 aa  187  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  43.78 
 
 
232 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  45.89 
 
 
229 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.89 
 
 
526 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  43.11 
 
 
227 aa  186  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.82 
 
 
517 aa  185  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  44.39 
 
 
227 aa  185  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  40.09 
 
 
224 aa  185  5e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  44.6 
 
 
224 aa  185  6e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  44.02 
 
 
229 aa  185  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  47.57 
 
 
222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  43.95 
 
 
221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  44.8 
 
 
514 aa  183  2.0000000000000003e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  43.5 
 
 
539 aa  183  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0780  cytidylate kinase  42.86 
 
 
223 aa  182  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0405191  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  43.46 
 
 
227 aa  182  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  43.96 
 
 
226 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  46.61 
 
 
224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  43.54 
 
 
229 aa  181  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  45.28 
 
 
223 aa  181  8.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  43.75 
 
 
224 aa  181  8.000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  42.59 
 
 
230 aa  181  9.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  42.01 
 
 
227 aa  179  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  45.75 
 
 
252 aa  179  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  46.19 
 
 
228 aa  179  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  47.09 
 
 
223 aa  179  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2334  cytidylate kinase  42.31 
 
 
226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000116453  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  40.91 
 
 
228 aa  178  4.999999999999999e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  42.65 
 
 
222 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  41.01 
 
 
217 aa  178  8e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  40.55 
 
 
217 aa  177  9e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  41.55 
 
 
227 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  41.55 
 
 
227 aa  177  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  39.72 
 
 
227 aa  177  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  41.55 
 
 
227 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  41.55 
 
 
227 aa  177  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  42.33 
 
 
230 aa  177  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  41.86 
 
 
230 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  41.55 
 
 
227 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  41.55 
 
 
227 aa  177  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  41.55 
 
 
227 aa  177  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  41.86 
 
 
230 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  41.55 
 
 
227 aa  177  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  41.55 
 
 
227 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  40.48 
 
 
237 aa  177  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  41.86 
 
 
230 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  41.86 
 
 
230 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  41.71 
 
 
232 aa  176  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  42.72 
 
 
225 aa  176  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02861  cytidylate kinase  43.48 
 
 
226 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  42.11 
 
 
228 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  43.06 
 
 
225 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>