More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_22471 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  100 
 
 
488 aa  982    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  58.44 
 
 
517 aa  606  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  64.48 
 
 
483 aa  596  1e-169  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  55.12 
 
 
516 aa  586  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  64.61 
 
 
480 aa  572  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  54.71 
 
 
516 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  50.62 
 
 
527 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  49.07 
 
 
534 aa  423  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.77 
 
 
529 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.42 
 
 
526 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17821  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.07 
 
 
510 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17771  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.91 
 
 
509 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.92 
 
 
511 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.71 
 
 
511 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1682  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.87 
 
 
510 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  47.97 
 
 
539 aa  409  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.06 
 
 
528 aa  402  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17991  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.66 
 
 
509 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  50.93 
 
 
224 aa  212  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  45 
 
 
225 aa  207  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  48.64 
 
 
232 aa  207  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  45.41 
 
 
225 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  45.41 
 
 
225 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  45.41 
 
 
225 aa  206  6e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  45.41 
 
 
225 aa  206  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  45.41 
 
 
225 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  45.41 
 
 
225 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  47.31 
 
 
334 aa  203  6e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  44.55 
 
 
225 aa  202  8e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  44.95 
 
 
225 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  44.55 
 
 
225 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  46.46 
 
 
283 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  44.04 
 
 
225 aa  201  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  46.46 
 
 
283 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  44.6 
 
 
231 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  42.8 
 
 
283 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  43.92 
 
 
283 aa  196  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  46.19 
 
 
226 aa  196  9e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  41.6 
 
 
283 aa  195  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  49.08 
 
 
222 aa  193  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  46.82 
 
 
228 aa  193  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  49.33 
 
 
224 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  44.44 
 
 
230 aa  192  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  45.32 
 
 
289 aa  191  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  43.41 
 
 
287 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  41.8 
 
 
283 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  44.4 
 
 
287 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  42.64 
 
 
287 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  43.3 
 
 
287 aa  189  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  48.88 
 
 
514 aa  189  1e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  40.87 
 
 
281 aa  189  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  39.45 
 
 
280 aa  188  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  45 
 
 
232 aa  188  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  43.7 
 
 
285 aa  188  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  45.45 
 
 
279 aa  188  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  42.35 
 
 
282 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  44.44 
 
 
281 aa  187  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  45.45 
 
 
285 aa  187  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  41.54 
 
 
283 aa  187  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  44.49 
 
 
285 aa  187  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  40.77 
 
 
283 aa  186  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  41.57 
 
 
283 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  40.61 
 
 
283 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  39.84 
 
 
287 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  47.47 
 
 
232 aa  184  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  42.05 
 
 
283 aa  184  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  49.07 
 
 
223 aa  184  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  41.5 
 
 
284 aa  184  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  39.69 
 
 
283 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  40.31 
 
 
279 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  45.33 
 
 
232 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  43.78 
 
 
233 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  40.86 
 
 
283 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  38.52 
 
 
281 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  48.18 
 
 
233 aa  182  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  42.25 
 
 
288 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  41.6 
 
 
286 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0404  pantoate/beta-alanine ligase  39.53 
 
 
281 aa  181  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302391  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  43.14 
 
 
300 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  50.23 
 
 
252 aa  181  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  46.89 
 
 
240 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  42.35 
 
 
282 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0555  pantoate--beta-alanine ligase  44.62 
 
 
278 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  39.37 
 
 
282 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  39.3 
 
 
279 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0200  pantoate--beta-alanine ligase  45.56 
 
 
360 aa  181  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  43.14 
 
 
309 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  38.98 
 
 
283 aa  180  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  40.47 
 
 
282 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  39.92 
 
 
284 aa  179  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  36.61 
 
 
282 aa  179  9e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  44.04 
 
 
235 aa  179  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  38.65 
 
 
279 aa  179  1e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  38.82 
 
 
282 aa  179  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  40.54 
 
 
289 aa  179  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  45.93 
 
 
220 aa  179  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  40.47 
 
 
285 aa  178  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  37.3 
 
 
283 aa  177  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  37.74 
 
 
280 aa  177  4e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  36.08 
 
 
282 aa  177  5e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>