More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0200 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0200  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 360 aa  702    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4375  pantoate--beta-alanine ligase  66.13 
 
 		 381 aa  350  2e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  59.66 
 
 		 287 aa  300  3e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  56.31 
 
 		 288 aa  285  8e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  57.04 
 
 		 294 aa  281  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  59.33 
 
 		 334 aa  278  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  55.21 
 
 		 285 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2096  pantoate/beta-alanine ligase  57.43 
 
 		 302 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.985614 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32010  pantothenate synthetase  61.09 
 
 		 321 aa  270  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  55.96 
 
 		 273 aa  266  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0575  pantoate--beta-alanine ligase  59.65 
 
 		 288 aa  265  7e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.447307  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  58.69 
 
 		 289 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  52.92 
 
 		 296 aa  257  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4718  pantoate--beta-alanine ligase  57.69 
 
 		 282 aa  247  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0632  pantoate/beta-alanine ligase  57.6 
 
 		 276 aa  242  7e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4283  pantoate--beta-alanine ligase  57.69 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  52.59 
 
 		 283 aa  237  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0160  pantoate--beta-alanine ligase  47.56 
 
 		 304 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0323  pantoate--beta-alanine ligase  48.67 
 
 		 301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  50.59 
 
 		 284 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  49.24 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35550  pantoate--beta-alanine ligase  55.64 
 
 		 302 aa  232  7.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0479281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  45.2 
 
 		 283 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0567  pantoate/beta-alanine ligase  55.82 
 
 		 308 aa  231  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0211  pantothenate synthetase  47.06 
 
 		 303 aa  229  5e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.120689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0325  pantoate--beta-alanine ligase  55.81 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5148  pantoate--beta-alanine ligase  59.22 
 
 		 313 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4762  pantoate--beta-alanine ligase  58.82 
 
 		 313 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4848  pantoate--beta-alanine ligase  58.82 
 
 		 313 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0717789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0635  pantoate/beta-alanine ligase  58.05 
 
 		 324 aa  226  7e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.53875  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  42.49 
 
 		 282 aa  222  7e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4007  pantoate/beta-alanine ligase  52.87 
 
 		 318 aa  222  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1424  pantoate--beta-alanine ligase  52.71 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.172502 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  43.92 
 
 		 282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  45.16 
 
 		 281 aa  219  6e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  48.25 
 
 		 279 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  41.95 
 
 		 281 aa  218  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  45.38 
 
 		 282 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  51.19 
 
 		 282 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  44.27 
 
 		 539 aa  214  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  46.09 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  47.84 
 
 		 283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  51.16 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3808  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 289 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471604 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  46.18 
 
 		 283 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  50 
 
 		 288 aa  213  5.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  47.49 
 
 		 278 aa  213  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  47.31 
 
 		 283 aa  212  7e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.84 
 
 		 529 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  44.31 
 
 		 290 aa  212  7.999999999999999e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  44.35 
 
 		 280 aa  212  9e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  44.35 
 
 		 280 aa  212  9e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  43.85 
 
 		 289 aa  212  9e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  47.89 
 
 		 289 aa  212  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  44.71 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.76 
 
 		 511 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01440  pantothenate synthetase  48.23 
 
 		 343 aa  211  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  49.61 
 
 		 281 aa  211  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  48.65 
 
 		 288 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3822  pantoate--beta-alanine ligase  50.17 
 
 		 289 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0361  pantoate--beta-alanine ligase  45.02 
 
 		 273 aa  210  3e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3739  pantoate--beta-alanine ligase  50.17 
 
 		 289 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.28887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  42.97 
 
 		 281 aa  210  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0716  pantoate/beta-alanine ligase  57.25 
 
 		 618 aa  209  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.34765 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  42.46 
 
 		 280 aa  209  6e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  48.13 
 
 		 279 aa  209  6e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  46.51 
 
 		 278 aa  209  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  43.36 
 
 		 273 aa  208  9e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0198  pantoate--beta-alanine ligase  48.01 
 
 		 281 aa  208  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.795684  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.76 
 
 		 511 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3681  pantoate--beta-alanine ligase  52.48 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.963286  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  47.1 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0667  pantoate--beta-alanine ligase  41.98 
 
 		 283 aa  207  3e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0600  pantoate--beta-alanine ligase  44.19 
 
 		 283 aa  207  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  44.44 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0174  pantoate--beta-alanine ligase  46.74 
 
 		 281 aa  206  5e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  44 
 
 		 281 aa  206  6e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.53 
 
 		 528 aa  205  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  44.71 
 
 		 281 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  47.83 
 
 		 291 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.15 
 
 		 534 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  47.29 
 
 		 288 aa  204  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  47.47 
 
 		 282 aa  204  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  41.73 
 
 		 282 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  48.67 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  39.92 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5364  pantoate--beta-alanine ligase  53.49 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00859126 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  48.05 
 
 		 287 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4557  pantoate/beta-alanine ligase  44.4 
 
 		 280 aa  202  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.146553  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1370  pantoate--beta-alanine ligase  41.2 
 
 		 273 aa  202  8e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  45.28 
 
 		 281 aa  202  8e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  50.37 
 
 		 285 aa  202  9e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13634  pantoate--beta-alanine ligase  54.58 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.55171e-34  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1134  pantoate/beta-alanine ligase  47.88 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  44.92 
 
 		 283 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0553  pantoate--beta-alanine ligase  43.31 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.716348  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  44.09 
 
 		 301 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  41.94 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  49.24 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  47.64 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>