More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_35550 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_35550  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 302 aa  600  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0479281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0325  pantoate--beta-alanine ligase  62.5 
 
 		 296 aa  351  1e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1424  pantoate--beta-alanine ligase  61.81 
 
 		 314 aa  347  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.172502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4762  pantoate--beta-alanine ligase  64.69 
 
 		 313 aa  339  4e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4848  pantoate--beta-alanine ligase  64.69 
 
 		 313 aa  339  4e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0717789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5148  pantoate--beta-alanine ligase  64.34 
 
 		 313 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0567  pantoate/beta-alanine ligase  60.62 
 
 		 308 aa  332  5e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4007  pantoate/beta-alanine ligase  61.17 
 
 		 318 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5364  pantoate--beta-alanine ligase  60.47 
 
 		 311 aa  322  3e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00859126 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13634  pantoate--beta-alanine ligase  61.81 
 
 		 309 aa  305  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.55171e-34  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0632  pantoate/beta-alanine ligase  64.45 
 
 		 276 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  56.25 
 
 		 273 aa  269  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  56.98 
 
 		 285 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  52.88 
 
 		 334 aa  254  9e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  54.83 
 
 		 288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  53.38 
 
 		 281 aa  250  2e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  55.76 
 
 		 289 aa  250  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  54.58 
 
 		 287 aa  248  8e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  42.86 
 
 		 279 aa  243  3.9999999999999997e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  54.55 
 
 		 294 aa  242  5e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  46.21 
 
 		 284 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4283  pantoate--beta-alanine ligase  57.53 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  48 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0575  pantoate--beta-alanine ligase  55.98 
 
 		 288 aa  238  5.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.447307  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  50.19 
 
 		 282 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  45.65 
 
 		 283 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  47.7 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  52.31 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4718  pantoate--beta-alanine ligase  55.6 
 
 		 282 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  47.78 
 
 		 281 aa  235  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  48.61 
 
 		 287 aa  235  8e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  45.56 
 
 		 280 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  46.57 
 
 		 281 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  45.56 
 
 		 280 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 309 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  47.58 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 300 aa  232  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  47.64 
 
 		 283 aa  232  5e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  43.8 
 
 		 281 aa  232  6e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  48.67 
 
 		 281 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  45.49 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0200  pantoate--beta-alanine ligase  53.96 
 
 		 360 aa  230  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  47.33 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  51.7 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  45.68 
 
 		 291 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  42.45 
 
 		 282 aa  231  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  48 
 
 		 281 aa  229  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  45.09 
 
 		 281 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  47.49 
 
 		 280 aa  229  4e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  48.7 
 
 		 283 aa  229  5e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  50 
 
 		 288 aa  229  6e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  49.22 
 
 		 279 aa  228  8e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  45.56 
 
 		 280 aa  228  1e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  47.89 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  47.18 
 
 		 284 aa  228  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  49.1 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  49.46 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2469  pantothenate synthetase  48.26 
 
 		 291 aa  227  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163424  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  47.62 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  47.35 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4375  pantoate--beta-alanine ligase  56.13 
 
 		 381 aa  226  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  46.56 
 
 		 273 aa  226  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  47.35 
 
 		 285 aa  226  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0404  pantoate/beta-alanine ligase  48.25 
 
 		 281 aa  226  5.0000000000000005e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  46.4 
 
 		 283 aa  225  6e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 281 aa  225  6e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  49.09 
 
 		 327 aa  225  8e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2096  pantoate/beta-alanine ligase  53.28 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.985614 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  49.06 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  47.9 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0211  pantothenate synthetase  50.19 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.120689 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  49.08 
 
 		 283 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  48.85 
 
 		 277 aa  223  2e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  46.97 
 
 		 283 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  47.64 
 
 		 279 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2674  pantoate--beta-alanine ligase  42.24 
 
 		 283 aa  224  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  47.04 
 
 		 283 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2620  pantoate--beta-alanine ligase  42.24 
 
 		 283 aa  224  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  50.37 
 
 		 285 aa  223  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  45.32 
 
 		 289 aa  222  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  46.83 
 
 		 283 aa  221  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  47.27 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0596  pantoate--beta-alanine ligase  48.09 
 
 		 278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.242968 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  42.22 
 
 		 289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  45.59 
 
 		 289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  47.21 
 
 		 283 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 288 aa  219  3e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  46.85 
 
 		 285 aa  219  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  47.71 
 
 		 277 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  46.69 
 
 		 286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  46.91 
 
 		 283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  47.91 
 
 		 281 aa  219  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  48.07 
 
 		 289 aa  219  5e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  47.2 
 
 		 288 aa  219  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0553  pantoate--beta-alanine ligase  41.61 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 288 aa  219  6e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  46.49 
 
 		 293 aa  219  6e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0600  pantoate--beta-alanine ligase  44.13 
 
 		 283 aa  219  6e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>