More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0369 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 283 aa  575  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  58.78 
 
 		 283 aa  332  3e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  57.35 
 
 		 283 aa  313  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  55.56 
 
 		 280 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  55.56 
 
 		 280 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  54.48 
 
 		 282 aa  310  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  53.05 
 
 		 284 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  54.21 
 
 		 273 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  53.41 
 
 		 281 aa  301  6.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  54.48 
 
 		 283 aa  300  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  54.84 
 
 		 283 aa  298  5e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  54.12 
 
 		 279 aa  293  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  51.97 
 
 		 280 aa  293  3e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  53.62 
 
 		 283 aa  292  4e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  54.48 
 
 		 279 aa  291  7e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  51.25 
 
 		 282 aa  291  9e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  51.09 
 
 		 281 aa  290  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 283 aa  289  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  53.17 
 
 		 289 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  52.67 
 
 		 278 aa  284  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  51.97 
 
 		 280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  51.97 
 
 		 288 aa  281  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  52.33 
 
 		 278 aa  280  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 281 aa  279  5e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  51.43 
 
 		 288 aa  278  6e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 280 aa  278  7e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 281 aa  278  8e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  51.97 
 
 		 282 aa  276  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  48.56 
 
 		 281 aa  276  4e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  52.33 
 
 		 281 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1683  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 287 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.708165  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  51.25 
 
 		 282 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  50.87 
 
 		 288 aa  270  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  45 
 
 		 282 aa  268  5e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  51.25 
 
 		 282 aa  268  5e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  44.29 
 
 		 282 aa  268  8.999999999999999e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  47.86 
 
 		 282 aa  266  2e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  44.29 
 
 		 282 aa  266  2e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  50.54 
 
 		 282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  50.54 
 
 		 282 aa  265  8e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  48.73 
 
 		 281 aa  264  1e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  50.54 
 
 		 282 aa  264  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  52.46 
 
 		 327 aa  264  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  50.54 
 
 		 282 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  50.54 
 
 		 282 aa  263  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  47.5 
 
 		 276 aa  262  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 282 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 282 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1465  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 282 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 		 281 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  50.7 
 
 		 291 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0787  pantoate--beta-alanine ligase  47.52 
 
 		 283 aa  259  3e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.232916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  50.18 
 
 		 290 aa  257  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2942  pantoate--beta-alanine ligase  46.64 
 
 		 283 aa  256  3e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17212 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 		 282 aa  255  5e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  46.64 
 
 		 291 aa  254  9e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  47.35 
 
 		 279 aa  253  3e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 287 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  47.29 
 
 		 282 aa  251  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  48.04 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  51.94 
 
 		 277 aa  251  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  46.76 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1263  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 		 282 aa  251  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.933341  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 287 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  46.98 
 
 		 283 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  47.33 
 
 		 286 aa  248  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2286  pantoate--beta-alanine ligase  46.48 
 
 		 282 aa  247  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000010295  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  49.22 
 
 		 529 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  46.59 
 
 		 289 aa  246  3e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3681  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 289 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.963286  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  48.21 
 
 		 289 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  47.83 
 
 		 279 aa  244  9e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  45.36 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  48.56 
 
 		 287 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  48.25 
 
 		 286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  47.12 
 
 		 283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  44.68 
 
 		 282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  47.89 
 
 		 293 aa  243  3e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  44.64 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  44.72 
 
 		 283 aa  243  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  47.89 
 
 		 293 aa  242  6e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 		 296 aa  241  7e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  46.91 
 
 		 281 aa  240  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3739  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 289 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.28887  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3822  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 289 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.14 
 
 		 526 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3808  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 289 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  47.62 
 
 		 290 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  46.76 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  46.4 
 
 		 284 aa  239  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0502  pantoate--beta-alanine ligase  47.31 
 
 		 300 aa  239  4e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  43.73 
 
 		 285 aa  239  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  44.84 
 
 		 286 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  45.16 
 
 		 289 aa  238  5.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0476  pantoate--beta-alanine ligase  45.91 
 
 		 281 aa  238  6.999999999999999e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.87 
 
 		 511 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  45.88 
 
 		 277 aa  238  1e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  46.24 
 
 		 284 aa  236  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3149  pantoate--beta-alanine ligase  45.32 
 
 		 290 aa  237  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>