More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4375 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4375  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 381 aa  729    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0200  pantoate--beta-alanine ligase  66.13 
 
 		 360 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  57.03 
 
 		 287 aa  266  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  55.02 
 
 		 288 aa  263  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2096  pantoate/beta-alanine ligase  59.92 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.985614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  55.89 
 
 		 294 aa  260  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  50.93 
 
 		 334 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  51.32 
 
 		 285 aa  257  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  58 
 
 		 273 aa  256  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  57.53 
 
 		 289 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0575  pantoate--beta-alanine ligase  60.55 
 
 		 288 aa  251  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.447307  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32010  pantothenate synthetase  51.94 
 
 		 321 aa  246  4e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0211  pantothenate synthetase  50.65 
 
 		 303 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.120689 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4718  pantoate--beta-alanine ligase  55.89 
 
 		 282 aa  237  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  53.21 
 
 		 296 aa  236  7e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  51.59 
 
 		 284 aa  235  8e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0567  pantoate/beta-alanine ligase  53.38 
 
 		 308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4283  pantoate--beta-alanine ligase  56.7 
 
 		 282 aa  233  6e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35550  pantoate--beta-alanine ligase  56.13 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0479281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3808  pantoate--beta-alanine ligase  51.34 
 
 		 289 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471604 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  49.8 
 
 		 283 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0632  pantoate/beta-alanine ligase  58.1 
 
 		 276 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0325  pantoate--beta-alanine ligase  53.94 
 
 		 296 aa  223  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  45.6 
 
 		 283 aa  222  8e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4762  pantoate--beta-alanine ligase  56.52 
 
 		 313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4848  pantoate--beta-alanine ligase  56.52 
 
 		 313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0717789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5148  pantoate--beta-alanine ligase  56.3 
 
 		 313 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  48.41 
 
 		 279 aa  216  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  49.07 
 
 		 278 aa  216  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0323  pantoate--beta-alanine ligase  47.78 
 
 		 301 aa  216  7e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  45.88 
 
 		 290 aa  216  7e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  48.29 
 
 		 283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  48.41 
 
 		 283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  44.23 
 
 		 273 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  45.86 
 
 		 279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 278 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0361  pantoate--beta-alanine ligase  45.02 
 
 		 273 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.98 
 
 		 511 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0160  pantoate--beta-alanine ligase  45.55 
 
 		 304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  51.98 
 
 		 288 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  44.53 
 
 		 282 aa  213  4.9999999999999996e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  44.44 
 
 		 282 aa  212  7e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1424  pantoate--beta-alanine ligase  53.63 
 
 		 314 aa  212  9e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.172502 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  42.17 
 
 		 282 aa  211  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.29 
 
 		 511 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  42.46 
 
 		 280 aa  210  3e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.94 
 
 		 526 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4007  pantoate/beta-alanine ligase  51.59 
 
 		 318 aa  209  8e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0635  pantoate/beta-alanine ligase  55.68 
 
 		 324 aa  209  9e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.53875  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  44.2 
 
 		 300 aa  208  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  45.35 
 
 		 284 aa  208  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  44.44 
 
 		 301 aa  208  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  48.5 
 
 		 291 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  43.19 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  43.19 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0436  pantoate/beta-alanine ligase  43.13 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0667  pantoate--beta-alanine ligase  43.13 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.41 
 
 		 527 aa  206  5e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  46.83 
 
 		 289 aa  206  6e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0501  pantoate--beta-alanine ligase  42.86 
 
 		 273 aa  206  6e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  47.01 
 
 		 291 aa  206  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  48.81 
 
 		 289 aa  206  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  48.11 
 
 		 283 aa  206  7e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  49.4 
 
 		 283 aa  205  9e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  45.72 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  46.33 
 
 		 283 aa  205  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  42.8 
 
 		 281 aa  205  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  45.85 
 
 		 281 aa  203  4e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  43.18 
 
 		 289 aa  203  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13634  pantoate--beta-alanine ligase  56.63 
 
 		 309 aa  203  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.55171e-34  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  41.18 
 
 		 279 aa  202  6e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  46.54 
 
 		 288 aa  202  6e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1134  pantoate/beta-alanine ligase  46.04 
 
 		 283 aa  202  6e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  48.02 
 
 		 282 aa  202  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.68 
 
 		 529 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0600  pantoate--beta-alanine ligase  44.19 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  45.25 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3681  pantoate--beta-alanine ligase  50.97 
 
 		 289 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.963286  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  44.87 
 
 		 289 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  46.48 
 
 		 279 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  49.43 
 
 		 296 aa  201  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  41.77 
 
 		 281 aa  200  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  41.27 
 
 		 281 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  38.96 
 
 		 282 aa  199  5e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  38.96 
 
 		 282 aa  199  7e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.05 
 
 		 534 aa  199  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  47.49 
 
 		 287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  43.6 
 
 		 280 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0583  pantoate--beta-alanine ligase  38.31 
 
 		 273 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  46.46 
 
 		 283 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  46.36 
 
 		 284 aa  198  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2674  pantoate--beta-alanine ligase  42.8 
 
 		 283 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2620  pantoate--beta-alanine ligase  42.8 
 
 		 283 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  40.47 
 
 		 282 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  46.8 
 
 		 289 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0134  pantoate/beta-alanine ligase  43.31 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  46.18 
 
 		 293 aa  197  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  46.85 
 
 		 277 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  45.28 
 
 		 281 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  46.18 
 
 		 293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>