More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1706 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 283 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  78.45 
 
 		 283 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  69.15 
 
 		 282 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  63.48 
 
 		 279 aa  371  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  63.83 
 
 		 279 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  61.57 
 
 		 283 aa  358  5e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  61.43 
 
 		 284 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  57.14 
 
 		 281 aa  342  5e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  54.64 
 
 		 280 aa  340  1e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  54.64 
 
 		 280 aa  340  1e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  58.78 
 
 		 283 aa  332  3e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  54.84 
 
 		 281 aa  330  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  55.56 
 
 		 281 aa  329  3e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  53.21 
 
 		 280 aa  326  3e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  55.2 
 
 		 283 aa  324  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  56.03 
 
 		 283 aa  319  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  52.67 
 
 		 283 aa  311  5.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  53.93 
 
 		 280 aa  310  2e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  51.97 
 
 		 282 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  54.81 
 
 		 273 aa  305  4.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 282 aa  305  4.0000000000000004e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  52.35 
 
 		 280 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 		 282 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  55.56 
 
 		 281 aa  301  6.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  52.35 
 
 		 288 aa  293  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  53.57 
 
 		 278 aa  292  5e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  53.05 
 
 		 278 aa  291  7e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  51.06 
 
 		 289 aa  290  3e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  48.93 
 
 		 276 aa  285  7e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  49.28 
 
 		 281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  48.56 
 
 		 281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2942  pantoate--beta-alanine ligase  50.53 
 
 		 283 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17212 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  52.29 
 
 		 281 aa  281  1e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  51.09 
 
 		 288 aa  280  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0787  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  278  7e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.232916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 277 aa  277  2e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 281 aa  276  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  49.65 
 
 		 288 aa  275  5e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  52.33 
 
 		 327 aa  275  8e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  48.75 
 
 		 282 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3808  pantoate--beta-alanine ligase  54.04 
 
 		 289 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471604 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  47.46 
 
 		 282 aa  272  4.0000000000000004e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  48.21 
 
 		 277 aa  271  6e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  46.74 
 
 		 282 aa  271  9e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  48.75 
 
 		 282 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  48.39 
 
 		 282 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  50.9 
 
 		 296 aa  271  1e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  48.39 
 
 		 282 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  48.39 
 
 		 282 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  46.74 
 
 		 282 aa  269  4e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  48.39 
 
 		 282 aa  269  4e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  48.39 
 
 		 282 aa  269  4e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3681  pantoate--beta-alanine ligase  56.23 
 
 		 289 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.963286  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2620  pantoate--beta-alanine ligase  47.52 
 
 		 283 aa  269  5e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2674  pantoate--beta-alanine ligase  47.52 
 
 		 283 aa  269  5e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  48.75 
 
 		 282 aa  268  7e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3822  pantoate--beta-alanine ligase  55.28 
 
 		 289 aa  268  8e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3739  pantoate--beta-alanine ligase  55.28 
 
 		 289 aa  268  8e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.28887  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1263  pantoate--beta-alanine ligase  47.31 
 
 		 282 aa  267  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.933341  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1683  pantoate--beta-alanine ligase  48.38 
 
 		 287 aa  267  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.708165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  48.03 
 
 		 282 aa  267  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 291 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  46.48 
 
 		 289 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  48.92 
 
 		 279 aa  265  8.999999999999999e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 282 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  48.23 
 
 		 290 aa  264  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0502  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 300 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1465  pantoate--beta-alanine ligase  47.31 
 
 		 282 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  49.42 
 
 		 268 aa  260  2e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  48.03 
 
 		 283 aa  260  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  47.1 
 
 		 279 aa  259  3e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 		 300 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  48.39 
 
 		 284 aa  258  7e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  48.39 
 
 		 284 aa  258  7e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  48.2 
 
 		 284 aa  257  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2286  pantoate--beta-alanine ligase  48.57 
 
 		 282 aa  258  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000010295  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  48.04 
 
 		 283 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  45.23 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  50.19 
 
 		 277 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.22 
 
 		 526 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  47.52 
 
 		 293 aa  252  4.0000000000000004e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  47.16 
 
 		 289 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.52 
 
 		 511 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.52 
 
 		 529 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  49.07 
 
 		 282 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  43.06 
 
 		 286 aa  252  6e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  47.33 
 
 		 283 aa  252  6e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  47.5 
 
 		 289 aa  252  6e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  47.52 
 
 		 293 aa  251  8.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  47.12 
 
 		 284 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0476  pantoate--beta-alanine ligase  45.36 
 
 		 281 aa  250  2e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  46.4 
 
 		 283 aa  248  6e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.81 
 
 		 511 aa  248  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  44.96 
 
 		 282 aa  248  8e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  46.4 
 
 		 284 aa  248  9e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  50.97 
 
 		 285 aa  247  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 289 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  47.7 
 
 		 279 aa  247  1e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  48.04 
 
 		 281 aa  247  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>