More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0502 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0502  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 300 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  74.02 
 
 		 282 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1263  pantoate--beta-alanine ligase  59.86 
 
 		 282 aa  353  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.933341  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  56.99 
 
 		 282 aa  347  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  56.99 
 
 		 282 aa  346  3e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  56.99 
 
 		 282 aa  346  3e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  56.99 
 
 		 282 aa  346  3e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  56.99 
 
 		 282 aa  346  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1465  pantoate--beta-alanine ligase  56.63 
 
 		 282 aa  345  4e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  56.99 
 
 		 282 aa  344  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  56.63 
 
 		 282 aa  343  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  56.99 
 
 		 282 aa  343  2e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  56.27 
 
 		 282 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  53.21 
 
 		 282 aa  338  5.9999999999999996e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  51.96 
 
 		 281 aa  315  4e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  54.09 
 
 		 283 aa  315  6e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  53.57 
 
 		 282 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  53.05 
 
 		 280 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  53.05 
 
 		 280 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  51.42 
 
 		 282 aa  302  5.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  52.1 
 
 		 288 aa  301  9e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  53.62 
 
 		 288 aa  301  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  51.97 
 
 		 280 aa  297  2e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 281 aa  293  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 		 286 aa  293  3e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 281 aa  289  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2620  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 		 283 aa  288  9e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2674  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 		 283 aa  288  9e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 		 283 aa  287  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  50.72 
 
 		 280 aa  282  6.000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  51.43 
 
 		 281 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  51.25 
 
 		 284 aa  281  8.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 280 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 283 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  46.43 
 
 		 281 aa  269  5e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  49.1 
 
 		 283 aa  267  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  52.92 
 
 		 277 aa  266  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  51.8 
 
 		 327 aa  263  4e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 		 283 aa  263  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  48.39 
 
 		 282 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.29 
 
 		 534 aa  261  8.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  46.79 
 
 		 276 aa  259  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  50.9 
 
 		 279 aa  259  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  50.54 
 
 		 279 aa  258  6e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  42.86 
 
 		 282 aa  258  9e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  51.36 
 
 		 278 aa  258  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  47.14 
 
 		 282 aa  257  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  52.33 
 
 		 278 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  45.29 
 
 		 281 aa  258  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  43.09 
 
 		 539 aa  256  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  49.45 
 
 		 273 aa  257  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  47.5 
 
 		 291 aa  257  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  50 
 
 		 279 aa  257  2e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  42.5 
 
 		 282 aa  256  3e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.07 
 
 		 527 aa  256  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  42.14 
 
 		 282 aa  256  5e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  49.81 
 
 		 281 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  47.31 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.3 
 
 		 529 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.23 
 
 		 526 aa  249  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  48.45 
 
 		 289 aa  249  3e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  41.34 
 
 		 283 aa  249  4e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  48.04 
 
 		 280 aa  248  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0787  pantoate--beta-alanine ligase  45.88 
 
 		 283 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.232916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2942  pantoate--beta-alanine ligase  45 
 
 		 283 aa  246  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17212 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.09 
 
 		 511 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  43.51 
 
 		 279 aa  246  4e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.09 
 
 		 511 aa  245  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  45.94 
 
 		 287 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  47.04 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1683  pantoate--beta-alanine ligase  47.83 
 
 		 287 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.708165  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  46.13 
 
 		 281 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  45.94 
 
 		 287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  46.38 
 
 		 300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  45.17 
 
 		 289 aa  243  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  51.34 
 
 		 296 aa  243  3.9999999999999997e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  45.58 
 
 		 285 aa  242  5e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  45.58 
 
 		 286 aa  242  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  45.96 
 
 		 291 aa  242  6e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  45.94 
 
 		 287 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  46.01 
 
 		 309 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  47.02 
 
 		 286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  45.23 
 
 		 287 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  45.26 
 
 		 283 aa  238  9e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.67 
 
 		 528 aa  238  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  44.48 
 
 		 283 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4557  pantoate/beta-alanine ligase  49.23 
 
 		 280 aa  236  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.146553  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  43.77 
 
 		 283 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2286  pantoate--beta-alanine ligase  46.86 
 
 		 282 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000010295  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  45.68 
 
 		 281 aa  235  6e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  42.76 
 
 		 283 aa  235  7e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  45.29 
 
 		 290 aa  234  9e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2891  pantoate/beta-alanine ligase  48.74 
 
 		 290 aa  234  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150324  normal  0.438724 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  46.57 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  42.35 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  44.88 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2314  pantoate/beta-alanine ligase  46.81 
 
 		 284 aa  230  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000496833  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  43.46 
 
 		 283 aa  230  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  44.44 
 
 		 289 aa  230  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>