More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1498 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 281 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2942  pantoate--beta-alanine ligase  63.57 
 
 		 283 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17212 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0787  pantoate--beta-alanine ligase  61.57 
 
 		 283 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.232916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2286  pantoate--beta-alanine ligase  57.5 
 
 		 282 aa  334  7.999999999999999e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000010295  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1683  pantoate--beta-alanine ligase  52.35 
 
 		 287 aa  300  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.708165  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  55.85 
 
 		 282 aa  298  6e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  51.62 
 
 		 283 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 		 283 aa  280  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 283 aa  276  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  49.12 
 
 		 280 aa  275  7e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  49.12 
 
 		 280 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  46.43 
 
 		 280 aa  273  3e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  46.07 
 
 		 280 aa  271  6e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  48.41 
 
 		 283 aa  272  6e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  47.33 
 
 		 281 aa  271  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  48.93 
 
 		 282 aa  270  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  45.36 
 
 		 281 aa  269  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  46.79 
 
 		 281 aa  268  5e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  46.1 
 
 		 280 aa  268  5e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  43.57 
 
 		 282 aa  263  3e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 279 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 		 283 aa  261  8.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  46.79 
 
 		 282 aa  259  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  45.71 
 
 		 282 aa  259  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  46.43 
 
 		 282 aa  259  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  47.87 
 
 		 283 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3808  pantoate--beta-alanine ligase  52.1 
 
 		 289 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471604 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  46.26 
 
 		 281 aa  258  8e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  48.68 
 
 		 273 aa  257  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  46.43 
 
 		 283 aa  257  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  46.07 
 
 		 282 aa  257  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  46.07 
 
 		 282 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  49.46 
 
 		 281 aa  255  5e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  45.32 
 
 		 283 aa  255  5e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  45.71 
 
 		 282 aa  255  6e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  45.71 
 
 		 282 aa  255  6e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  48.76 
 
 		 279 aa  254  9e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  44.24 
 
 		 281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  47.86 
 
 		 284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  46.07 
 
 		 282 aa  253  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  47.87 
 
 		 283 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  45.71 
 
 		 282 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1465  pantoate--beta-alanine ligase  45.55 
 
 		 282 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  45.71 
 
 		 282 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  45.71 
 
 		 281 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  49.08 
 
 		 288 aa  250  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  48.58 
 
 		 278 aa  249  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  42.65 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1263  pantoate--beta-alanine ligase  45.36 
 
 		 282 aa  249  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.933341  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3822  pantoate--beta-alanine ligase  51.24 
 
 		 289 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3739  pantoate--beta-alanine ligase  51.24 
 
 		 289 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.28887  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  41.94 
 
 		 282 aa  247  2e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  45.71 
 
 		 291 aa  246  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  48.41 
 
 		 288 aa  246  3e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 284 aa  246  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  41.94 
 
 		 282 aa  246  4e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  48.75 
 
 		 284 aa  246  4e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  48.23 
 
 		 283 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  47.55 
 
 		 282 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  49.12 
 
 		 287 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  45.36 
 
 		 277 aa  245  6e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  50.98 
 
 		 278 aa  245  6.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  49.12 
 
 		 287 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  49.12 
 
 		 287 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  48.23 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  48.06 
 
 		 290 aa  243  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 288 aa  241  7e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  47.29 
 
 		 289 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1634  pantoate--beta-alanine ligase  45.39 
 
 		 283 aa  240  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  46.81 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.92 
 
 		 526 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  44.88 
 
 		 288 aa  240  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 287 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  46.1 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  43.57 
 
 		 277 aa  238  1e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  46.83 
 
 		 286 aa  236  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  49.62 
 
 		 290 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3681  pantoate--beta-alanine ligase  50.53 
 
 		 289 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.963286  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  47.52 
 
 		 283 aa  236  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  49.03 
 
 		 277 aa  236  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  48.4 
 
 		 284 aa  235  6e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  45.63 
 
 		 268 aa  235  7e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0600  pantoate--beta-alanine ligase  45.16 
 
 		 283 aa  235  7e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  45.13 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2891  pantoate/beta-alanine ligase  50.71 
 
 		 290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150324  normal  0.438724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  48.36 
 
 		 288 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  42.7 
 
 		 276 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  46.98 
 
 		 285 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  43.61 
 
 		 284 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.51 
 
 		 529 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  46.1 
 
 		 286 aa  232  5e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  44.88 
 
 		 290 aa  232  6e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  46.74 
 
 		 281 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  43.46 
 
 		 282 aa  231  8.000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  47.92 
 
 		 285 aa  231  9e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  47.9 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  43.68 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  44.88 
 
 		 289 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>