More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1571 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 
280 aa  570  1.0000000000000001e-162  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  76.7 
 
 
280 aa  449  1e-125  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  70.36 
 
 
280 aa  408  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  70.36 
 
 
280 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  61.92 
 
 
282 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  59.86 
 
 
281 aa  349  3e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  58.06 
 
 
283 aa  347  8e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  57.3 
 
 
281 aa  332  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  55.56 
 
 
281 aa  329  4e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  53.21 
 
 
283 aa  326  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  55.04 
 
 
280 aa  317  1e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  57.19 
 
 
283 aa  316  3e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  52.86 
 
 
283 aa  315  7e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  55.47 
 
 
281 aa  311  9e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  55.12 
 
 
282 aa  308  5e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  53.05 
 
 
282 aa  308  9e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  53.76 
 
 
278 aa  306  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  51.79 
 
 
276 aa  307  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  51.79 
 
 
282 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  53.41 
 
 
282 aa  306  3e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  52.86 
 
 
282 aa  306  3e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  53.41 
 
 
282 aa  305  4.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  53.05 
 
 
278 aa  305  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  53.57 
 
 
282 aa  305  4.0000000000000004e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  52.67 
 
 
282 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  52.52 
 
 
281 aa  304  8.000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  52.67 
 
 
282 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  52.67 
 
 
282 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  54.48 
 
 
282 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  52.31 
 
 
282 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  54.84 
 
 
281 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  52.9 
 
 
281 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  51.96 
 
 
282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  52.31 
 
 
282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  52.31 
 
 
282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1465  pantoate--beta-alanine ligase  53.41 
 
 
282 aa  300  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  51.25 
 
 
277 aa  300  2e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  51.6 
 
 
282 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  51.43 
 
 
284 aa  300  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  51.74 
 
 
289 aa  298  5e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  50.9 
 
 
277 aa  298  7e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  53.05 
 
 
286 aa  297  2e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  53.79 
 
 
288 aa  296  3e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1263  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
282 aa  293  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.933341  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  51.97 
 
 
283 aa  293  3e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  49.3 
 
 
288 aa  290  1e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  52.88 
 
 
279 aa  290  2e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  48.75 
 
 
291 aa  289  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  48.4 
 
 
289 aa  288  7e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  52.96 
 
 
268 aa  287  1e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0502  pantoate--beta-alanine ligase  51.97 
 
 
300 aa  285  5e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2674  pantoate--beta-alanine ligase  51.43 
 
 
283 aa  285  5.999999999999999e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2620  pantoate--beta-alanine ligase  51.43 
 
 
283 aa  285  5.999999999999999e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  49.29 
 
 
283 aa  285  8e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  49.29 
 
 
279 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  48.93 
 
 
309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
279 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  53.49 
 
 
277 aa  282  5.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  54.26 
 
 
279 aa  282  5.000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 
283 aa  281  8.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  51.43 
 
 
291 aa  279  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2942  pantoate--beta-alanine ligase  49.62 
 
 
283 aa  276  3e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17212 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  48.39 
 
 
300 aa  275  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0787  pantoate--beta-alanine ligase  47.14 
 
 
283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.232916  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  46.43 
 
 
281 aa  273  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  48.4 
 
 
293 aa  270  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1683  pantoate--beta-alanine ligase  48.4 
 
 
287 aa  270  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.708165  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  48.4 
 
 
293 aa  270  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.74 
 
 
527 aa  269  2.9999999999999997e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  47.23 
 
 
282 aa  268  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  48.57 
 
 
289 aa  266  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  47.14 
 
 
289 aa  265  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  48.39 
 
 
327 aa  265  5.999999999999999e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  45.2 
 
 
282 aa  263  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.65 
 
 
529 aa  262  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  47.78 
 
 
273 aa  262  6e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  46.04 
 
 
283 aa  261  8e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  46.4 
 
 
283 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  46.62 
 
 
286 aa  259  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  50.38 
 
 
511 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  50.35 
 
 
289 aa  260  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  50.38 
 
 
511 aa  259  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  49.62 
 
 
289 aa  260  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  47.91 
 
 
539 aa  259  4e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  45.91 
 
 
283 aa  258  8e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  47.23 
 
 
288 aa  257  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1370  pantoate--beta-alanine ligase  45.88 
 
 
273 aa  257  2e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22955  predicted protein  47.62 
 
 
311 aa  256  3e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.271201  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.75 
 
 
528 aa  256  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.9 
 
 
534 aa  255  6e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0501  pantoate--beta-alanine ligase  47.31 
 
 
273 aa  254  9e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  47.1 
 
 
280 aa  252  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  46.62 
 
 
282 aa  251  8.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.44 
 
 
526 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2286  pantoate--beta-alanine ligase  43.11 
 
 
282 aa  250  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000010295  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 
290 aa  250  2e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  46.89 
 
 
283 aa  250  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  44.84 
 
 
287 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2469  pantothenate synthetase  45.61 
 
 
291 aa  249  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163424  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  44.84 
 
 
287 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0650903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>