More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2254 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  100 
 
 		 289 aa  593  1e-168  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  51.97 
 
 		 283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 289 aa  277  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  47.67 
 
 		 281 aa  276  3e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  47.86 
 
 		 280 aa  275  4e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  47.86 
 
 		 280 aa  275  5e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 		 278 aa  267  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  50.35 
 
 		 280 aa  266  2.9999999999999995e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  48.21 
 
 		 276 aa  266  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  47.14 
 
 		 283 aa  265  8e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  48.25 
 
 		 289 aa  264  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  44.09 
 
 		 282 aa  265  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  48.59 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  48.59 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  48.6 
 
 		 291 aa  263  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  47.5 
 
 		 283 aa  261  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  47.86 
 
 		 283 aa  258  6e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.63 
 
 		 526 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  49.1 
 
 		 291 aa  256  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  44.24 
 
 		 280 aa  257  2e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  46.59 
 
 		 283 aa  256  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  45.7 
 
 		 289 aa  255  6e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  46.86 
 
 		 539 aa  255  6e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  45.88 
 
 		 280 aa  254  8e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.92 
 
 		 528 aa  253  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  47.35 
 
 		 284 aa  253  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  49.05 
 
 		 529 aa  252  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  46.97 
 
 		 273 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  46.39 
 
 		 268 aa  251  9.000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  49.1 
 
 		 287 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.71 
 
 		 527 aa  250  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  46.98 
 
 		 279 aa  250  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  46.9 
 
 		 294 aa  249  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  46.59 
 
 		 282 aa  249  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  45.61 
 
 		 309 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  45.96 
 
 		 285 aa  249  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  48.57 
 
 		 277 aa  248  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  45.88 
 
 		 281 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  43.93 
 
 		 277 aa  247  1e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  45.71 
 
 		 279 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  45.62 
 
 		 279 aa  246  2e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  44.88 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  46.98 
 
 		 282 aa  247  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1683  pantoate--beta-alanine ligase  47.65 
 
 		 287 aa  246  3e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.708165  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.46 
 
 		 534 aa  245  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2942  pantoate--beta-alanine ligase  49.06 
 
 		 283 aa  244  9e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17212 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  44.29 
 
 		 277 aa  244  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  46.48 
 
 		 288 aa  243  3e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  48.23 
 
 		 286 aa  242  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  46.4 
 
 		 282 aa  242  7e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  41.58 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  45.13 
 
 		 280 aa  241  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  47.54 
 
 		 296 aa  239  4e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 		 287 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  41.94 
 
 		 282 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  41.22 
 
 		 282 aa  238  8e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  45.13 
 
 		 281 aa  238  9e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0134  pantoate/beta-alanine ligase  44.48 
 
 		 279 aa  238  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  45.2 
 
 		 286 aa  237  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  41.58 
 
 		 282 aa  236  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  45.85 
 
 		 288 aa  237  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  47.41 
 
 		 282 aa  237  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0211  pantothenate synthetase  48.24 
 
 		 303 aa  237  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.120689 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  45.16 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  46.62 
 
 		 285 aa  236  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  41.94 
 
 		 282 aa  236  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2891  pantoate/beta-alanine ligase  47.67 
 
 		 290 aa  236  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150324  normal  0.438724 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.9 
 
 		 511 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  41.94 
 
 		 282 aa  235  6e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  41.94 
 
 		 282 aa  235  6e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  48.88 
 
 		 334 aa  235  6e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  40.14 
 
 		 282 aa  235  8e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.9 
 
 		 511 aa  234  9e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  44.64 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  40.86 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1465  pantoate--beta-alanine ligase  41.22 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  45.93 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  41.58 
 
 		 282 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1634  pantoate--beta-alanine ligase  43.17 
 
 		 283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  41.58 
 
 		 282 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  43.37 
 
 		 281 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  45.58 
 
 		 287 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  47.55 
 
 		 289 aa  233  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  45.94 
 
 		 287 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0787  pantoate--beta-alanine ligase  46.04 
 
 		 283 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.232916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  44.24 
 
 		 274 aa  232  5e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  45.71 
 
 		 283 aa  232  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  44.57 
 
 		 290 aa  232  6e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  47.12 
 
 		 273 aa  231  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  43.82 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  44.29 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  44.44 
 
 		 290 aa  231  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  45.36 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0476  pantoate--beta-alanine ligase  45 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  41.43 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  43.82 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>