More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0039 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  100 
 
 
289 aa  591  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  53.96 
 
 
280 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  53.96 
 
 
280 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  49.62 
 
 
280 aa  260  2e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  43.97 
 
 
282 aa  259  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  48.19 
 
 
280 aa  258  7e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  50.9 
 
 
285 aa  257  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  47.41 
 
 
280 aa  256  3e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  52.49 
 
 
283 aa  254  8e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  49.25 
 
 
284 aa  253  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  47.58 
 
 
282 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  49.47 
 
 
283 aa  252  5.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  47.31 
 
 
281 aa  252  5.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  49.44 
 
 
283 aa  251  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
281 aa  251  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  50.38 
 
 
286 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  50.92 
 
 
286 aa  250  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
283 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  49.1 
 
 
283 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  52.03 
 
 
287 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  50.38 
 
 
283 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  50.57 
 
 
276 aa  249  4e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  48.91 
 
 
281 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  46.35 
 
 
283 aa  248  8e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  48.91 
 
 
281 aa  248  9e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  46.59 
 
 
283 aa  247  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  48.91 
 
 
281 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 
281 aa  247  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  50.74 
 
 
289 aa  246  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  48.54 
 
 
281 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  51.28 
 
 
290 aa  246  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  49.08 
 
 
286 aa  246  4e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
283 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
281 aa  246  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  46.32 
 
 
283 aa  244  8e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  46.4 
 
 
281 aa  244  8e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  47.19 
 
 
284 aa  244  9e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  44.33 
 
 
282 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  48.38 
 
 
281 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
283 aa  242  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  47.35 
 
 
283 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  51.13 
 
 
287 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  49.22 
 
 
283 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
281 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  50.38 
 
 
285 aa  241  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.28 
 
 
527 aa  240  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  46.49 
 
 
284 aa  240  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  50.75 
 
 
287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  47.23 
 
 
282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  44.04 
 
 
282 aa  239  4e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  51.14 
 
 
281 aa  239  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  49.81 
 
 
300 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  50.38 
 
 
287 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  46.07 
 
 
281 aa  237  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  44.85 
 
 
279 aa  238  1e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  47.21 
 
 
281 aa  238  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  49.81 
 
 
309 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  46.93 
 
 
282 aa  237  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
282 aa  236  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  48.47 
 
 
300 aa  236  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  49.24 
 
 
301 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  48.88 
 
 
283 aa  235  6e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  46.74 
 
 
293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  46.74 
 
 
293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  46.74 
 
 
288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  45.32 
 
 
281 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  44.33 
 
 
283 aa  232  5e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  48.11 
 
 
289 aa  232  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.99 
 
 
534 aa  232  6e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  46.74 
 
 
293 aa  232  6e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  45.69 
 
 
279 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  45.19 
 
 
289 aa  231  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  46.86 
 
 
286 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  48.86 
 
 
288 aa  231  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  45.88 
 
 
281 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  48.38 
 
 
288 aa  229  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2674  pantoate--beta-alanine ligase  44.68 
 
 
283 aa  229  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2620  pantoate--beta-alanine ligase  44.68 
 
 
283 aa  229  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  44.64 
 
 
282 aa  230  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  49.11 
 
 
280 aa  229  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  46.89 
 
 
291 aa  228  6e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  48.73 
 
 
274 aa  228  9e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  45.28 
 
 
279 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.62 
 
 
529 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  45.83 
 
 
539 aa  226  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  44.87 
 
 
282 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  44.84 
 
 
289 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  45.22 
 
 
281 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  46.67 
 
 
288 aa  227  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  41.84 
 
 
286 aa  225  6e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  47.6 
 
 
296 aa  225  6e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.62 
 
 
526 aa  225  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  45.05 
 
 
298 aa  225  8e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  46.04 
 
 
288 aa  225  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  47.74 
 
 
280 aa  225  8e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  45.39 
 
 
291 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  46.97 
 
 
294 aa  224  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  46.79 
 
 
289 aa  224  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  49.45 
 
 
285 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  48.35 
 
 
285 aa  223  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.496301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>