More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5340 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  100 
 
 
526 aa  1075    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  63.74 
 
 
511 aa  659    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  63.55 
 
 
511 aa  654    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  57.06 
 
 
539 aa  620  1e-176  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  57.06 
 
 
534 aa  613  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  56.98 
 
 
528 aa  601  1.0000000000000001e-171  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  56.45 
 
 
529 aa  592  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  54.14 
 
 
527 aa  521  1e-146  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.2 
 
 
516 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.78 
 
 
516 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.95 
 
 
483 aa  429  1e-119  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.51 
 
 
517 aa  428  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.01 
 
 
488 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.94 
 
 
480 aa  408  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1682  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.83 
 
 
510 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17821  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.9 
 
 
510 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17771  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.22 
 
 
509 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17991  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.16 
 
 
509 aa  355  8.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  47.57 
 
 
280 aa  288  2e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  47.22 
 
 
280 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
283 aa  281  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  47.2 
 
 
283 aa  270  5e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  48.72 
 
 
280 aa  266  5.999999999999999e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  45.42 
 
 
282 aa  265  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  48.78 
 
 
288 aa  262  8.999999999999999e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  49.07 
 
 
281 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  45.36 
 
 
281 aa  254  3e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  45.55 
 
 
288 aa  254  3e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  44.91 
 
 
289 aa  253  7e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  45.99 
 
 
273 aa  253  7e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  47.22 
 
 
283 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  44.44 
 
 
280 aa  251  3e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  42.81 
 
 
289 aa  249  6e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  44.79 
 
 
281 aa  249  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  47.22 
 
 
281 aa  249  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  47.57 
 
 
281 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  46.45 
 
 
279 aa  248  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  43.62 
 
 
289 aa  247  4e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  44.44 
 
 
291 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  44.33 
 
 
282 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  45.67 
 
 
291 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  44.98 
 
 
280 aa  244  3e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0404  pantoate/beta-alanine ligase  45.33 
 
 
281 aa  244  3e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302391  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  45.58 
 
 
279 aa  243  9e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  45.49 
 
 
283 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  47.92 
 
 
281 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  46.77 
 
 
281 aa  241  2e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  45.39 
 
 
283 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  42.71 
 
 
282 aa  241  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  45.14 
 
 
283 aa  240  5e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  45.33 
 
 
279 aa  239  5.999999999999999e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  46.13 
 
 
287 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  42.86 
 
 
283 aa  239  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  46.53 
 
 
279 aa  238  2e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  42.25 
 
 
282 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  45.9 
 
 
289 aa  237  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  44.36 
 
 
282 aa  237  4e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  46.18 
 
 
280 aa  237  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  45.76 
 
 
284 aa  237  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  46.15 
 
 
287 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  46.27 
 
 
296 aa  236  9e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  46.15 
 
 
287 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  43.36 
 
 
294 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  42.01 
 
 
282 aa  235  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  43.73 
 
 
285 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  45.45 
 
 
286 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  42.48 
 
 
327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  41.78 
 
 
300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  44.48 
 
 
283 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  42.01 
 
 
276 aa  234  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  43.9 
 
 
278 aa  234  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  44.06 
 
 
282 aa  234  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  45.8 
 
 
287 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  44.48 
 
 
283 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0502  pantoate--beta-alanine ligase  45.23 
 
 
300 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  48.13 
 
 
277 aa  233  7.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  42.55 
 
 
282 aa  232  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  44.76 
 
 
283 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22955  predicted protein  43.56 
 
 
311 aa  232  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.271201  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  42.71 
 
 
278 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  42.16 
 
 
286 aa  231  3e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  46.15 
 
 
287 aa  230  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  44.41 
 
 
283 aa  231  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  45.23 
 
 
281 aa  230  4e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  45.23 
 
 
285 aa  230  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  45.58 
 
 
283 aa  230  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  45.02 
 
 
286 aa  230  5e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  42.31 
 
 
283 aa  230  5e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  43.06 
 
 
289 aa  229  7e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  42.12 
 
 
309 aa  229  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2891  pantoate/beta-alanine ligase  45.52 
 
 
290 aa  229  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150324  normal  0.438724 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 
284 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  44.14 
 
 
283 aa  228  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  45.08 
 
 
296 aa  227  4e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  44.12 
 
 
282 aa  226  6e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  42.36 
 
 
282 aa  226  8e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  42.51 
 
 
282 aa  226  8e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  45.17 
 
 
284 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  41.32 
 
 
293 aa  225  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  45.17 
 
 
284 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>