More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2060 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 291 aa  578  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  71.89 
 
 		 289 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  70 
 
 		 293 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  69.75 
 
 		 293 aa  397  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  70 
 
 		 300 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  67.62 
 
 		 309 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  67.36 
 
 		 289 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  53.57 
 
 		 283 aa  291  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  51.07 
 
 		 281 aa  288  5.0000000000000004e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  52.5 
 
 		 282 aa  286  4e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  51.26 
 
 		 283 aa  285  7e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  51.79 
 
 		 276 aa  285  8e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  51.07 
 
 		 281 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  51.79 
 
 		 281 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  49.28 
 
 		 280 aa  280  2e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  51.43 
 
 		 280 aa  279  3e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  47.35 
 
 		 282 aa  276  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0476  pantoate--beta-alanine ligase  51.07 
 
 		 281 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  49.11 
 
 		 282 aa  272  5.000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  53.57 
 
 		 278 aa  270  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  53.79 
 
 		 288 aa  269  4e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  49.11 
 
 		 280 aa  269  4e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  49.11 
 
 		 280 aa  269  5e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  51.79 
 
 		 278 aa  268  7e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  52.33 
 
 		 287 aa  265  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  46.81 
 
 		 281 aa  263  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  52.16 
 
 		 281 aa  262  4e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  47.65 
 
 		 281 aa  261  8e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  46.79 
 
 		 284 aa  260  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  50.7 
 
 		 283 aa  260  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 		 283 aa  259  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  51.07 
 
 		 286 aa  259  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 283 aa  259  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  46.21 
 
 		 282 aa  258  6e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  50.9 
 
 		 287 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  50.9 
 
 		 287 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  50.9 
 
 		 287 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  48.94 
 
 		 288 aa  257  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 		 282 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  53.1 
 
 		 277 aa  256  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 		 281 aa  254  9e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  47.39 
 
 		 291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  46.26 
 
 		 289 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  47.86 
 
 		 282 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  50.97 
 
 		 529 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  49.29 
 
 		 283 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 277 aa  253  3e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  49.29 
 
 		 283 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  48.04 
 
 		 280 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  46.88 
 
 		 285 aa  252  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  50.17 
 
 		 296 aa  251  7e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2620  pantoate--beta-alanine ligase  46.43 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2674  pantoate--beta-alanine ligase  46.43 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  46.26 
 
 		 277 aa  250  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 		 284 aa  250  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 283 aa  250  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  47.65 
 
 		 279 aa  249  5e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  48.68 
 
 		 268 aa  247  1e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  46.1 
 
 		 283 aa  248  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  45 
 
 		 286 aa  247  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  49.1 
 
 		 289 aa  246  2e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  46.64 
 
 		 282 aa  246  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 289 aa  246  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 		 283 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  47 
 
 		 282 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  46.64 
 
 		 282 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 293 aa  245  4.9999999999999997e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  46.64 
 
 		 282 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  46.62 
 
 		 283 aa  245  6e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.67 
 
 		 526 aa  245  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  46.07 
 
 		 281 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  46.02 
 
 		 284 aa  245  8e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  45.52 
 
 		 282 aa  244  9e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  45.94 
 
 		 282 aa  244  9e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  46.29 
 
 		 282 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  45.67 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  46.29 
 
 		 282 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  46.98 
 
 		 280 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  46.29 
 
 		 283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  45.94 
 
 		 282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  45.67 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  49.29 
 
 		 283 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 279 aa  243  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  47.86 
 
 		 283 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  47.16 
 
 		 301 aa  241  9e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  48.06 
 
 		 284 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1465  pantoate--beta-alanine ligase  47.29 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  48.06 
 
 		 284 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  48.06 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.93 
 
 		 534 aa  240  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  47.14 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  42.86 
 
 		 282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0231  pantoate--beta-alanine ligase  44.48 
 
 		 285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  46.45 
 
 		 300 aa  239  5e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  45.94 
 
 		 282 aa  239  5e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  42.5 
 
 		 282 aa  238  5.999999999999999e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1683  pantoate--beta-alanine ligase  48.04 
 
 		 287 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.708165  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  48.06 
 
 		 284 aa  238  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  46.18 
 
 		 284 aa  238  8e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>