More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3003 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 279 aa  553  1e-157  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  61.27 
 
 		 286 aa  318  7.999999999999999e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  60.79 
 
 		 282 aa  308  9e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  56.27 
 
 		 290 aa  294  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  56.07 
 
 		 288 aa  290  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  56.41 
 
 		 290 aa  289  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  53.9 
 
 		 285 aa  277  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 283 aa  276  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1396  pantoate--beta-alanine ligase  54.58 
 
 		 288 aa  276  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.262573  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  51.45 
 
 		 283 aa  275  6e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  54.72 
 
 		 285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  53.16 
 
 		 285 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  51.62 
 
 		 283 aa  268  5e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  45.88 
 
 		 282 aa  269  5e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  51.67 
 
 		 282 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0555  pantoate--beta-alanine ligase  54.84 
 
 		 278 aa  266  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  46.4 
 
 		 280 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  52.14 
 
 		 283 aa  265  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  47.86 
 
 		 282 aa  264  8.999999999999999e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3149  pantoate--beta-alanine ligase  51.79 
 
 		 290 aa  263  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2560  pantoate--beta-alanine ligase  52.54 
 
 		 284 aa  263  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  50.57 
 
 		 273 aa  263  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  51.08 
 
 		 283 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3332  pantoate--beta-alanine ligase  52.5 
 
 		 311 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2423  pantoate--beta-alanine ligase  51.79 
 
 		 283 aa  261  6.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  54.29 
 
 		 287 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  261  8e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  46.98 
 
 		 280 aa  259  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  260  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  49.28 
 
 		 282 aa  259  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  50.89 
 
 		 283 aa  259  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  46.98 
 
 		 280 aa  258  6e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  46.01 
 
 		 281 aa  258  7e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  51.25 
 
 		 283 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  45.88 
 
 		 279 aa  258  1e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4085  pantoate--beta-alanine ligase  53.45 
 
 		 282 aa  256  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0133419 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  48.93 
 
 		 283 aa  256  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 281 aa  256  3e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  49.81 
 
 		 281 aa  254  9e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  51.25 
 
 		 287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  47.48 
 
 		 281 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2251  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 		 307 aa  253  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  47.14 
 
 		 283 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 281 aa  251  7e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  45.22 
 
 		 284 aa  251  7e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  50.54 
 
 		 286 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  47.83 
 
 		 283 aa  251  8.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  47.7 
 
 		 283 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  51.6 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  49.12 
 
 		 284 aa  251  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  47.16 
 
 		 282 aa  250  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  50.9 
 
 		 287 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 291 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  50.9 
 
 		 287 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  48.58 
 
 		 289 aa  249  3e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 276 aa  249  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  43.37 
 
 		 280 aa  249  3e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2942  pantoate--beta-alanine ligase  47.5 
 
 		 283 aa  249  5e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17212 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  44.09 
 
 		 280 aa  248  8e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  51.45 
 
 		 288 aa  248  9e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2388  pantoate--beta-alanine ligase  53.08 
 
 		 283 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0472601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  44.33 
 
 		 283 aa  247  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  48.19 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1702  pantoate--beta-alanine ligase  51.91 
 
 		 283 aa  246  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.238045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  45.68 
 
 		 281 aa  246  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  47.5 
 
 		 277 aa  246  4e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 280 aa  245  6.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  49.65 
 
 		 288 aa  245  6.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 285 aa  244  9e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  49.1 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  49.11 
 
 		 287 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  52.29 
 
 		 294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  45.71 
 
 		 284 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  46.45 
 
 		 283 aa  243  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  46.62 
 
 		 282 aa  243  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 293 aa  242  3.9999999999999997e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 278 aa  242  6e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 284 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  46.62 
 
 		 281 aa  241  7e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  49.11 
 
 		 283 aa  241  7e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 284 aa  241  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  47.5 
 
 		 277 aa  241  1e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  46.57 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  47.29 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1658  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.752293 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  46.85 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  49.11 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  47.33 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  48.92 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  48.04 
 
 		 288 aa  240  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  48.3 
 
 		 281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0787  pantoate--beta-alanine ligase  46.43 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.232916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 284 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0198  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 281 aa  239  5e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.795684  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  51.74 
 
 		 287 aa  238  5.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0476  pantoate--beta-alanine ligase  46.24 
 
 		 281 aa  238  6.999999999999999e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  48.56 
 
 		 283 aa  238  8e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  48.56 
 
 		 283 aa  238  9e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2495  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 280 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>