More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4723 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 309 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  87.97 
 
 		 300 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  67.62 
 
 		 291 aa  388  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  64.29 
 
 		 289 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  64.29 
 
 		 293 aa  375  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  63.7 
 
 		 293 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  64.77 
 
 		 289 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 		 283 aa  288  7e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 281 aa  288  7e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 		 282 aa  286  4e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  51.07 
 
 		 281 aa  285  5e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  47.65 
 
 		 280 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  48.93 
 
 		 280 aa  283  4.0000000000000003e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  49.29 
 
 		 283 aa  280  3e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  48.39 
 
 		 280 aa  278  7e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  48.39 
 
 		 280 aa  278  7e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  51.07 
 
 		 278 aa  276  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  47.14 
 
 		 281 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  51.79 
 
 		 278 aa  276  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  45 
 
 		 282 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  49.29 
 
 		 276 aa  274  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  48.19 
 
 		 281 aa  273  4.0000000000000004e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  46.98 
 
 		 282 aa  268  5.9999999999999995e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  47.86 
 
 		 291 aa  267  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  47.1 
 
 		 281 aa  267  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  47.67 
 
 		 280 aa  260  2e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  48.91 
 
 		 288 aa  259  3e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  54.26 
 
 		 277 aa  259  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  45.29 
 
 		 282 aa  258  7e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  50.75 
 
 		 281 aa  258  9e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 284 aa  257  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  48.07 
 
 		 288 aa  256  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  47.5 
 
 		 280 aa  257  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  50.59 
 
 		 268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  42.4 
 
 		 286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  45.23 
 
 		 283 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  48.75 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  47.12 
 
 		 279 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  46.43 
 
 		 289 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  45.39 
 
 		 282 aa  252  6e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  45.04 
 
 		 283 aa  252  6e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  47.52 
 
 		 277 aa  252  7e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  43.57 
 
 		 282 aa  251  1e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0476  pantoate--beta-alanine ligase  46.98 
 
 		 281 aa  251  1e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  51.09 
 
 		 274 aa  250  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  49.11 
 
 		 289 aa  250  3e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  43.57 
 
 		 282 aa  249  3e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 283 aa  248  6e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  47.48 
 
 		 283 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  42.86 
 
 		 282 aa  247  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  48.75 
 
 		 287 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  46.81 
 
 		 293 aa  246  4e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  47.14 
 
 		 283 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  46.04 
 
 		 282 aa  246  4.9999999999999997e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  46.62 
 
 		 300 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  47.16 
 
 		 283 aa  245  6.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  46.98 
 
 		 301 aa  244  9e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.44 
 
 		 529 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  43.48 
 
 		 279 aa  244  9.999999999999999e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  48.06 
 
 		 277 aa  242  5e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  47.84 
 
 		 282 aa  242  5e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  45.61 
 
 		 289 aa  242  6e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 		 282 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  43.11 
 
 		 283 aa  241  9e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  48.92 
 
 		 287 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0231  pantoate--beta-alanine ligase  44.68 
 
 		 285 aa  241  1e-62  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  46.76 
 
 		 283 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  46.29 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  44.24 
 
 		 281 aa  240  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  48.56 
 
 		 287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  48.56 
 
 		 287 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2942  pantoate--beta-alanine ligase  44.84 
 
 		 283 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17212 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  42.75 
 
 		 282 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  43.12 
 
 		 282 aa  238  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0701  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 279 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.307086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1204  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 279 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  42.75 
 
 		 282 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  46.76 
 
 		 283 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1049  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 279 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2975  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 279 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00455305  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1043  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 279 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  43.71 
 
 		 284 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1624  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 279 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00769335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2312  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 279 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0189212  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  43.71 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  49.81 
 
 		 289 aa  237  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  46.69 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  43.71 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0668  pantoate--beta-alanine ligase  49.3 
 
 		 282 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.5 
 
 		 527 aa  236  3e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2620  pantoate--beta-alanine ligase  42.81 
 
 		 283 aa  236  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  47.17 
 
 		 539 aa  236  4e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2674  pantoate--beta-alanine ligase  42.81 
 
 		 283 aa  236  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  44.37 
 
 		 282 aa  236  4e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  45.23 
 
 		 284 aa  236  5.0000000000000005e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>