More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2151 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 
286 aa  583  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2674  pantoate--beta-alanine ligase  71.17 
 
 
283 aa  420  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2620  pantoate--beta-alanine ligase  71.17 
 
 
283 aa  420  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  54.32 
 
 
282 aa  322  6e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  54.32 
 
 
282 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  54.32 
 
 
282 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  54.32 
 
 
282 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  53.96 
 
 
282 aa  318  5e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  53.96 
 
 
282 aa  318  5e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  53.24 
 
 
282 aa  318  5e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  53.24 
 
 
282 aa  318  5e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1465  pantoate--beta-alanine ligase  54.32 
 
 
282 aa  317  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  53.24 
 
 
282 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1263  pantoate--beta-alanine ligase  53.24 
 
 
282 aa  310  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.933341  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  51.26 
 
 
282 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  51.26 
 
 
282 aa  298  7e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  53.05 
 
 
280 aa  297  2e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  49.1 
 
 
280 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  49.1 
 
 
280 aa  286  4e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  50.54 
 
 
282 aa  281  9e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 
281 aa  280  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0502  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 
300 aa  278  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  47.31 
 
 
282 aa  275  5e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  48.19 
 
 
288 aa  273  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 
280 aa  268  7e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  46.76 
 
 
281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  47.14 
 
 
283 aa  265  7e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  46.04 
 
 
283 aa  264  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  45.68 
 
 
281 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  45.71 
 
 
289 aa  262  6e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  46.59 
 
 
284 aa  259  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  47.12 
 
 
281 aa  259  4e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 
280 aa  258  6e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  45.36 
 
 
293 aa  258  8e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  45.36 
 
 
293 aa  257  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  44.96 
 
 
278 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  45.91 
 
 
283 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  44.6 
 
 
278 aa  256  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  45 
 
 
283 aa  256  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  42.4 
 
 
309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  44.8 
 
 
276 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  48.52 
 
 
279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  45.23 
 
 
288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  42.6 
 
 
281 aa  253  3e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  43.06 
 
 
283 aa  252  6e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  45.62 
 
 
283 aa  251  9.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  44.36 
 
 
281 aa  251  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  44.6 
 
 
289 aa  249  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  42.61 
 
 
300 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  45.04 
 
 
282 aa  249  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  45 
 
 
291 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  44.09 
 
 
291 aa  246  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  43.21 
 
 
289 aa  244  8e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 
283 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  45.16 
 
 
283 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  44.8 
 
 
277 aa  242  5e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  45.16 
 
 
283 aa  242  6e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  45.16 
 
 
283 aa  242  6e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  45.16 
 
 
283 aa  242  6e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  43.46 
 
 
289 aa  242  6e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 
283 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  44.8 
 
 
283 aa  240  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  44.8 
 
 
283 aa  240  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  44.8 
 
 
283 aa  240  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  43.17 
 
 
327 aa  239  2.9999999999999997e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.83 
 
 
527 aa  239  2.9999999999999997e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  43.73 
 
 
277 aa  238  5.999999999999999e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  43.26 
 
 
281 aa  237  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0476  pantoate--beta-alanine ligase  43.62 
 
 
281 aa  237  1e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  45.35 
 
 
277 aa  236  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  45.2 
 
 
279 aa  236  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  44.04 
 
 
284 aa  234  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  43.21 
 
 
287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  46.24 
 
 
268 aa  233  3e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  42.86 
 
 
287 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  45 
 
 
279 aa  232  6e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  43.12 
 
 
284 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  42.09 
 
 
282 aa  231  7.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  42.09 
 
 
282 aa  231  8.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0787  pantoate--beta-alanine ligase  40.07 
 
 
283 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.232916  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  42.14 
 
 
287 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  42.09 
 
 
282 aa  231  1e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.16 
 
 
526 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  42.96 
 
 
283 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  43.12 
 
 
284 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  42.86 
 
 
287 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  42.75 
 
 
284 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  43.53 
 
 
283 aa  230  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1683  pantoate--beta-alanine ligase  42.75 
 
 
287 aa  229  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.708165  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  42.75 
 
 
284 aa  228  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  41.54 
 
 
539 aa  228  8e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  43.68 
 
 
283 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.81 
 
 
511 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  45.05 
 
 
284 aa  228  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  42.86 
 
 
287 aa  227  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  40.14 
 
 
281 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.81 
 
 
511 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  42.75 
 
 
285 aa  227  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  41.94 
 
 
284 aa  226  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  45.95 
 
 
281 aa  226  3e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>