More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3011 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 279 aa  567  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  93.19 
 
 		 279 aa  536  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  63.48 
 
 		 283 aa  371  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  63.83 
 
 		 283 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  63.48 
 
 		 282 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  59.29 
 
 		 284 aa  337  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  56.23 
 
 		 283 aa  319  3e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  54.12 
 
 		 281 aa  307  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  54.96 
 
 		 283 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  54.12 
 
 		 283 aa  305  6e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  53.11 
 
 		 281 aa  300  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  52.33 
 
 		 282 aa  300  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 		 280 aa  295  5e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  54.12 
 
 		 283 aa  293  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 280 aa  293  3e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  53.82 
 
 		 273 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 282 aa  285  5.999999999999999e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  48.58 
 
 		 283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 280 aa  282  4.0000000000000003e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  51.61 
 
 		 281 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 		 280 aa  278  5e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  48.93 
 
 		 282 aa  278  6e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  51.62 
 
 		 280 aa  278  9e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  51.45 
 
 		 278 aa  277  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 281 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 		 278 aa  270  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  48.92 
 
 		 281 aa  268  5e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  51.26 
 
 		 288 aa  268  5.9999999999999995e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  54.62 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  47.29 
 
 		 277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  47.29 
 
 		 277 aa  265  8.999999999999999e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  49.11 
 
 		 289 aa  264  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 281 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 281 aa  263  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3808  pantoate--beta-alanine ligase  52.81 
 
 		 289 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471604 
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  48.51 
 
 		 268 aa  259  3e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  48.72 
 
 		 281 aa  259  3e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 		 281 aa  255  5e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  48.56 
 
 		 281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3739  pantoate--beta-alanine ligase  54.44 
 
 		 289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.28887  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3822  pantoate--beta-alanine ligase  54.44 
 
 		 289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  47.64 
 
 		 290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3681  pantoate--beta-alanine ligase  55.19 
 
 		 289 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.963286  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  48.53 
 
 		 288 aa  252  5.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  48.24 
 
 		 288 aa  252  6e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  45.65 
 
 		 282 aa  252  6e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  46.38 
 
 		 282 aa  251  7e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  47.31 
 
 		 282 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2942  pantoate--beta-alanine ligase  49.61 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17212 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  47.67 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  48.11 
 
 		 539 aa  250  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0502  pantoate--beta-alanine ligase  50.9 
 
 		 300 aa  249  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  46.59 
 
 		 276 aa  249  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  47.9 
 
 		 287 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  48.25 
 
 		 287 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  45.65 
 
 		 282 aa  249  4e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  47.31 
 
 		 282 aa  249  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  48.75 
 
 		 284 aa  249  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  47.67 
 
 		 282 aa  248  6e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0787  pantoate--beta-alanine ligase  46.5 
 
 		 283 aa  248  8e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.232916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 		 282 aa  247  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  46.26 
 
 		 283 aa  247  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  48.51 
 
 		 286 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 287 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  44.96 
 
 		 284 aa  248  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  45.91 
 
 		 283 aa  246  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  46.81 
 
 		 284 aa  246  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  46.26 
 
 		 283 aa  247  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  52.12 
 
 		 296 aa  247  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  45.91 
 
 		 283 aa  246  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  45.91 
 
 		 283 aa  246  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  46.81 
 
 		 284 aa  246  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  49.44 
 
 		 283 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  45.91 
 
 		 283 aa  246  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  49.46 
 
 		 279 aa  246  3e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1683  pantoate--beta-alanine ligase  45.55 
 
 		 287 aa  246  4e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.708165  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  46.81 
 
 		 284 aa  246  4e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  45.91 
 
 		 283 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  45.91 
 
 		 283 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  45.91 
 
 		 283 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  45.55 
 
 		 284 aa  244  9e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  50.57 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  47.83 
 
 		 282 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  47.84 
 
 		 283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  46.24 
 
 		 282 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.58 
 
 		 526 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  45.68 
 
 		 283 aa  242  5e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  46.24 
 
 		 284 aa  242  6e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  46.24 
 
 		 282 aa  241  7e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  46.24 
 
 		 282 aa  241  7e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  46.24 
 
 		 282 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  46.24 
 
 		 282 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  46.64 
 
 		 287 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  50.38 
 
 		 285 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  46.55 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  45.32 
 
 		 284 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  45.71 
 
 		 289 aa  240  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  47.64 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0404  pantoate/beta-alanine ligase  50 
 
 		 281 aa  240  2e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302391  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>