More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3822 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3739  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 289 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.28887  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3822  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 289 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3681  pantoate--beta-alanine ligase  96.54 
 
 		 289 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.963286  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3808  pantoate--beta-alanine ligase  77.51 
 
 		 289 aa  410  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471604 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  53.33 
 
 		 283 aa  291  7e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  55.28 
 
 		 283 aa  285  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  50.35 
 
 		 281 aa  280  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  52.98 
 
 		 282 aa  278  8e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  55.67 
 
 		 288 aa  274  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  55.19 
 
 		 279 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  54.44 
 
 		 279 aa  271  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  52.48 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  52.96 
 
 		 289 aa  268  5e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  52.67 
 
 		 283 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  48.1 
 
 		 280 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  48.1 
 
 		 280 aa  267  2e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  51.58 
 
 		 284 aa  266  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  46.64 
 
 		 280 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  51.24 
 
 		 281 aa  262  6e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  50.88 
 
 		 283 aa  262  6e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 283 aa  260  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  49.62 
 
 		 283 aa  258  7e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  51.03 
 
 		 283 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  48.9 
 
 		 281 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 281 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  51.66 
 
 		 283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2942  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 283 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17212 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  47.37 
 
 		 280 aa  251  8.000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 281 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  50.19 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0787  pantoate--beta-alanine ligase  48.6 
 
 		 283 aa  250  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.232916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  45.86 
 
 		 282 aa  249  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  47.54 
 
 		 290 aa  248  9e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  48.01 
 
 		 273 aa  248  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  53.61 
 
 		 278 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  50.37 
 
 		 282 aa  247  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  50.19 
 
 		 281 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  53.64 
 
 		 278 aa  245  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 286 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  49.28 
 
 		 291 aa  244  8e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  47.33 
 
 		 280 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1683  pantoate--beta-alanine ligase  47.24 
 
 		 287 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.708165  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  48.78 
 
 		 287 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  51.49 
 
 		 288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  50.37 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  50.37 
 
 		 287 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  48.78 
 
 		 287 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  49.44 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  48.89 
 
 		 284 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  48.43 
 
 		 287 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  49.44 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  48.07 
 
 		 284 aa  241  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  49.06 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  49.06 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  49.06 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  49.06 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  49.06 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  49.06 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  49.06 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  51.69 
 
 		 284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  51.69 
 
 		 284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  48.69 
 
 		 284 aa  238  8e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  53.09 
 
 		 285 aa  238  8e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  47.2 
 
 		 293 aa  238  9e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  51.31 
 
 		 284 aa  238  9e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 284 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  47.96 
 
 		 284 aa  236  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  45.64 
 
 		 282 aa  237  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  50.87 
 
 		 288 aa  236  3e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  48.89 
 
 		 284 aa  236  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  53.93 
 
 		 334 aa  236  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  54.18 
 
 		 285 aa  236  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  46.82 
 
 		 284 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  52.36 
 
 		 285 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  49.26 
 
 		 301 aa  235  7e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  46.82 
 
 		 284 aa  235  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0600  pantoate--beta-alanine ligase  47.22 
 
 		 283 aa  235  8e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  51.76 
 
 		 279 aa  235  8e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  50.93 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  48.52 
 
 		 300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  46.44 
 
 		 284 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  46.44 
 
 		 284 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  46.82 
 
 		 284 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  46.62 
 
 		 281 aa  233  3e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  44.36 
 
 		 281 aa  231  8.000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  46.62 
 
 		 277 aa  231  9e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  50.18 
 
 		 283 aa  231  9e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2286  pantoate--beta-alanine ligase  47.7 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000010295  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  53.38 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1634  pantoate--beta-alanine ligase  45.3 
 
 		 283 aa  229  3e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  41.75 
 
 		 279 aa  229  5e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  50.96 
 
 		 277 aa  229  6e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  49.06 
 
 		 282 aa  228  7e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  40.43 
 
 		 282 aa  228  1e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  44.93 
 
 		 281 aa  227  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  47.96 
 
 		 276 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  51.53 
 
 		 296 aa  226  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  42.69 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  46.24 
 
 		 268 aa  226  4e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0667  pantoate--beta-alanine ligase  43.9 
 
 		 283 aa  226  4e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>