More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1321 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 284 aa  577  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  61.37 
 
 		 287 aa  338  5e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  55.96 
 
 		 283 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  54.61 
 
 		 283 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2423  pantoate--beta-alanine ligase  51.99 
 
 		 283 aa  293  3e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  53.76 
 
 		 283 aa  291  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3332  pantoate--beta-alanine ligase  53.79 
 
 		 311 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2388  pantoate--beta-alanine ligase  57.59 
 
 		 283 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0472601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1702  pantoate--beta-alanine ligase  55.47 
 
 		 283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.238045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  53.9 
 
 		 288 aa  280  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  54.41 
 
 		 285 aa  280  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4542  pantoate--beta-alanine ligase  53.48 
 
 		 285 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  51.79 
 
 		 290 aa  278  9e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  54.41 
 
 		 285 aa  276  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  55.51 
 
 		 285 aa  275  6e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  50.9 
 
 		 281 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4085  pantoate--beta-alanine ligase  54.23 
 
 		 282 aa  272  6e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0133419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  54.51 
 
 		 290 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3149  pantoate--beta-alanine ligase  51.76 
 
 		 290 aa  259  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  46.67 
 
 		 281 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  52.03 
 
 		 283 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  50.53 
 
 		 283 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1396  pantoate--beta-alanine ligase  52.71 
 
 		 288 aa  256  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.262573  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  45.59 
 
 		 284 aa  255  5e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  51.3 
 
 		 281 aa  254  9e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  51.3 
 
 		 281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  50.37 
 
 		 281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 281 aa  253  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  49.81 
 
 		 281 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  49.44 
 
 		 281 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  49.44 
 
 		 281 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  49.44 
 
 		 281 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  49.12 
 
 		 287 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2495  pantoate--beta-alanine ligase  51.61 
 
 		 280 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  49.1 
 
 		 283 aa  249  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 287 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  47.48 
 
 		 283 aa  249  5e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 283 aa  248  6e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 287 aa  248  7e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  51.3 
 
 		 281 aa  248  7e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  50.73 
 
 		 283 aa  246  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  49.12 
 
 		 287 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  45.42 
 
 		 283 aa  247  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2251  pantoate--beta-alanine ligase  48.4 
 
 		 307 aa  246  4e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  47.12 
 
 		 283 aa  244  9e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1721  pantothenate synthetase  50 
 
 		 288 aa  244  9e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.308068  normal  0.216295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 286 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2942  pantoate--beta-alanine ligase  47.33 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17212 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0198  pantoate--beta-alanine ligase  46.76 
 
 		 281 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.795684  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  49.3 
 
 		 283 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  50.71 
 
 		 282 aa  243  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  48.9 
 
 		 281 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0174  pantoate--beta-alanine ligase  46.4 
 
 		 281 aa  241  7.999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2560  pantoate--beta-alanine ligase  46.79 
 
 		 284 aa  241  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  50.37 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  46.1 
 
 		 281 aa  240  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  46.01 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0555  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 278 aa  240  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  50.37 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 		 284 aa  239  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  48.94 
 
 		 283 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  49.11 
 
 		 283 aa  239  5e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  45.16 
 
 		 284 aa  239  5e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 284 aa  238  6.999999999999999e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  46.62 
 
 		 280 aa  237  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  45.88 
 
 		 288 aa  237  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1757  pantoate--beta-alanine ligase  51.25 
 
 		 279 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  44.12 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  44.29 
 
 		 279 aa  236  3e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0600  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 283 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  48.77 
 
 		 279 aa  235  8e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0567  pantoate/beta-alanine ligase  50.88 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 		 279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  50.19 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  43.21 
 
 		 280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 		 290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  46.76 
 
 		 281 aa  233  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  47.73 
 
 		 282 aa  233  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3186  pantoate--beta-alanine ligase  47.64 
 
 		 274 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.722916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  45.42 
 
 		 282 aa  232  5e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  46.89 
 
 		 284 aa  232  6e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  45.68 
 
 		 282 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  48.15 
 
 		 283 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1634  pantoate--beta-alanine ligase  46.24 
 
 		 283 aa  231  8.000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  47.06 
 
 		 283 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  46.04 
 
 		 282 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  47.21 
 
 		 283 aa  231  9e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0403  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  45.74 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  44.48 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  46.69 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  46.69 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  47.18 
 
 		 288 aa  230  2e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  47.18 
 
 		 288 aa  230  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  46.69 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  46.32 
 
 		 287 aa  230  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1658  pantoate--beta-alanine ligase  49.28 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.752293 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  46.69 
 
 		 283 aa  229  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3822  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 289 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  46.69 
 
 		 283 aa  229  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>