More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0201 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 
284 aa  581  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  98.94 
 
 
284 aa  574  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  98.59 
 
 
284 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  98.24 
 
 
284 aa  570  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  98.24 
 
 
284 aa  571  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  87.99 
 
 
283 aa  511  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  87.99 
 
 
283 aa  511  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  87.28 
 
 
283 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  87.63 
 
 
283 aa  509  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  87.63 
 
 
283 aa  509  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  87.63 
 
 
283 aa  509  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  87.28 
 
 
283 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  87.28 
 
 
283 aa  508  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  87.28 
 
 
283 aa  508  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  84.51 
 
 
284 aa  499  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  71.99 
 
 
284 aa  430  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  73.05 
 
 
284 aa  426  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  73.05 
 
 
284 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  73.05 
 
 
284 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  69.96 
 
 
284 aa  420  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  69.61 
 
 
284 aa  421  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  68.55 
 
 
284 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  69.86 
 
 
284 aa  396  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0231  pantoate--beta-alanine ligase  55.99 
 
 
285 aa  345  6e-94  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  58.97 
 
 
301 aa  340  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  58.61 
 
 
300 aa  337  9.999999999999999e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  57.8 
 
 
293 aa  332  5e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  55.56 
 
 
298 aa  319  3e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0579  pantoate--beta-alanine ligase  54.26 
 
 
289 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  53.74 
 
 
283 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  53.38 
 
 
283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  52.3 
 
 
283 aa  300  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  52.3 
 
 
283 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  52.48 
 
 
286 aa  299  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  53.07 
 
 
287 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  51.77 
 
 
283 aa  295  6e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  52.84 
 
 
287 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  51.99 
 
 
287 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  51.77 
 
 
283 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  51.62 
 
 
287 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
284 aa  287  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  51.59 
 
 
285 aa  286  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  51.24 
 
 
283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  51.77 
 
 
286 aa  280  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  49.11 
 
 
282 aa  281  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  49.65 
 
 
282 aa  280  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2130  pantoate--beta-alanine ligase  51.8 
 
 
286 aa  279  4e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000332887 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  49.47 
 
 
283 aa  278  8e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  48.4 
 
 
281 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0775  pantoate--beta-alanine ligase  52.99 
 
 
281 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4313  pantoate--beta-alanine ligase  48.61 
 
 
288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
282 aa  273  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
282 aa  273  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  51.87 
 
 
281 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3409  pantoate--beta-alanine ligase  51.49 
 
 
281 aa  270  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.545812  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  46.83 
 
 
283 aa  267  1e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0867  pantoate--beta-alanine ligase  51.12 
 
 
281 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.712584  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3495  pantoate--beta-alanine ligase  50.75 
 
 
281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3133  pantoate--beta-alanine ligase  51.49 
 
 
281 aa  266  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  48.92 
 
 
283 aa  266  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  48.75 
 
 
281 aa  266  4e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0844  pantoate--beta-alanine ligase  51.12 
 
 
281 aa  265  5e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0879  pantoate--beta-alanine ligase  51.12 
 
 
281 aa  265  5e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00646372  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0725  pantoate--beta-alanine ligase  51.12 
 
 
281 aa  264  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.278718  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3297  pantoate--beta-alanine ligase  51.12 
 
 
281 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.749755  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  47.62 
 
 
286 aa  263  3e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  46.37 
 
 
288 aa  258  9e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0126  pantoate--beta-alanine ligase  46.32 
 
 
287 aa  257  1e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1061  pantoate--beta-alanine ligase  44.33 
 
 
284 aa  256  3e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0674  pantoate--beta-alanine ligase  48.54 
 
 
285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  46.76 
 
 
291 aa  252  6e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  46.81 
 
 
286 aa  251  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  48.38 
 
 
281 aa  250  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2042  pantoate/beta-alanine ligase  47.2 
 
 
293 aa  248  7e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
279 aa  247  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0878  Pantoate--beta-alanine ligase  48.58 
 
 
286 aa  246  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  44.48 
 
 
283 aa  246  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  44.6 
 
 
282 aa  245  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  48.03 
 
 
281 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  44.52 
 
 
289 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  46.59 
 
 
280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1134  pantoate/beta-alanine ligase  49.81 
 
 
283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  43.17 
 
 
282 aa  243  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  46.04 
 
 
283 aa  241  9e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  45.32 
 
 
279 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  45.68 
 
 
283 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  47.72 
 
 
283 aa  241  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  44.24 
 
 
284 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  44.96 
 
 
283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  46.98 
 
 
289 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  47.16 
 
 
288 aa  238  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  45.61 
 
 
293 aa  237  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  45.61 
 
 
293 aa  238  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  43.32 
 
 
280 aa  238  1e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  48.06 
 
 
291 aa  237  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  45.94 
 
 
289 aa  236  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  44.64 
 
 
282 aa  237  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  44.44 
 
 
280 aa  236  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  44.44 
 
 
280 aa  236  3e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  44.6 
 
 
281 aa  236  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>