More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4462 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  100 
 
 		 280 aa  573  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4557  pantoate/beta-alanine ligase  59.07 
 
 		 280 aa  315  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.146553  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3835  pantothenate synthetase  48.4 
 
 		 283 aa  287  2e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  47.5 
 
 		 282 aa  276  4e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  50 
 
 		 283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  48.93 
 
 		 281 aa  272  4.0000000000000004e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1507  pantoate/beta-alanine ligase  49.08 
 
 		 280 aa  264  1e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 		 291 aa  261  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 		 283 aa  259  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  47.5 
 
 		 309 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  46.93 
 
 		 280 aa  257  1e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  46.93 
 
 		 280 aa  257  1e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0477  pantoate--beta-alanine ligase  46.93 
 
 		 281 aa  254  8e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  47.5 
 
 		 300 aa  254  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  47.86 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  47.19 
 
 		 280 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  47.52 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  47.1 
 
 		 280 aa  252  4.0000000000000004e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  47.52 
 
 		 283 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  47.5 
 
 		 283 aa  252  6e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  47.5 
 
 		 283 aa  252  6e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  47.5 
 
 		 283 aa  252  6e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2314  pantoate/beta-alanine ligase  50.9 
 
 		 284 aa  251  9.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000496833  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  47.5 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  47.5 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  47.5 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  45.91 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 		 284 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  47.5 
 
 		 284 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  47.48 
 
 		 289 aa  249  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 		 278 aa  247  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 		 284 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  50.19 
 
 		 278 aa  246  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  47.14 
 
 		 284 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  46.26 
 
 		 282 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  46.67 
 
 		 276 aa  245  6e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0134  pantoate/beta-alanine ligase  45 
 
 		 279 aa  244  8e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  49.43 
 
 		 539 aa  244  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  47.86 
 
 		 284 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  46.98 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  49.28 
 
 		 288 aa  244  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  46.59 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  46.93 
 
 		 289 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  44.8 
 
 		 282 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  48.76 
 
 		 284 aa  243  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0825  pantoate--beta-alanine ligase  44.12 
 
 		 292 aa  243  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  47.65 
 
 		 287 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  48.76 
 
 		 284 aa  242  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  48.76 
 
 		 284 aa  242  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.77 
 
 		 528 aa  241  7.999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0680  pantoate--beta-alanine ligase  46.45 
 
 		 284 aa  241  7.999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.337976  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  45.65 
 
 		 281 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  47.52 
 
 		 283 aa  238  5.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  45.32 
 
 		 298 aa  238  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  48.41 
 
 		 301 aa  237  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  46.76 
 
 		 289 aa  237  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.18 
 
 		 526 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0404  pantoate/beta-alanine ligase  45.2 
 
 		 281 aa  236  2e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1159  pantoate--beta-alanine ligase  46.79 
 
 		 284 aa  236  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480021  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  46.12 
 
 		 280 aa  236  3e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  44.24 
 
 		 279 aa  236  4e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2130  pantoate--beta-alanine ligase  47.33 
 
 		 286 aa  236  4e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332887 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  47.52 
 
 		 300 aa  236  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0502  pantoate--beta-alanine ligase  48.04 
 
 		 300 aa  235  6e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0579  pantoate--beta-alanine ligase  41.9 
 
 		 289 aa  235  8e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.51 
 
 		 529 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  47.31 
 
 		 284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  46.69 
 
 		 281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  48.07 
 
 		 282 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  48.06 
 
 		 277 aa  233  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  45.13 
 
 		 289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.7 
 
 		 534 aa  232  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  44.73 
 
 		 283 aa  232  5e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  43.42 
 
 		 281 aa  232  6e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.44 
 
 		 527 aa  232  6e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  45.36 
 
 		 282 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  45.49 
 
 		 288 aa  231  9e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  45.45 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  43.12 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  47.72 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  45.09 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2251  pantoate--beta-alanine ligase  46.55 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  46.57 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  45.19 
 
 		 277 aa  229  3e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0160  pantoate--beta-alanine ligase  47 
 
 		 304 aa  229  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  43.73 
 
 		 284 aa  229  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2674  pantoate--beta-alanine ligase  42.75 
 
 		 283 aa  229  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2620  pantoate--beta-alanine ligase  42.75 
 
 		 283 aa  229  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  44.25 
 
 		 282 aa  229  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  44.73 
 
 		 284 aa  228  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  44.73 
 
 		 287 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  46.1 
 
 		 283 aa  228  8e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  48.45 
 
 		 284 aa  228  9e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0117  pantoate--beta-alanine ligase  46.89 
 
 		 288 aa  228  1e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  45.86 
 
 		 290 aa  228  1e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  44.6 
 
 		 283 aa  227  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  45.04 
 
 		 282 aa  227  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  45.82 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0403  pantoate--beta-alanine ligase  47.25 
 
 		 279 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  44.36 
 
 		 279 aa  227  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>