More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3835 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3835  pantothenate synthetase  100 
 
 		 283 aa  580  1.0000000000000001e-165  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  48.4 
 
 		 280 aa  287  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4557  pantoate/beta-alanine ligase  47.48 
 
 		 280 aa  271  8.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.146553  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_002950  PG0477  pantoate--beta-alanine ligase  46.35 
 
 		 281 aa  250  2e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  41.99 
 
 		 282 aa  246  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  44.13 
 
 		 276 aa  244  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  42.35 
 
 		 280 aa  238  9e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  42.35 
 
 		 280 aa  238  9e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  42.96 
 
 		 281 aa  236  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2314  pantoate/beta-alanine ligase  45.71 
 
 		 284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000496833  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  41.73 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  43.57 
 
 		 283 aa  232  6e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  42.8 
 
 		 289 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  45.2 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3689  pantoate/beta-alanine ligase  44.89 
 
 		 285 aa  229  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141413 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  41.99 
 
 		 282 aa  228  8e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  41.28 
 
 		 280 aa  228  9e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  42.4 
 
 		 291 aa  227  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  42.81 
 
 		 282 aa  225  5.0000000000000005e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  39.86 
 
 		 282 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  41.73 
 
 		 282 aa  224  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  42.14 
 
 		 289 aa  223  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  41.99 
 
 		 282 aa  223  4e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  41.9 
 
 		 288 aa  223  4e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  43.97 
 
 		 279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0134  pantoate/beta-alanine ligase  42.46 
 
 		 279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  41.99 
 
 		 280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  43.68 
 
 		 296 aa  221  9e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  44.87 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.06 
 
 		 529 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1658  pantoate--beta-alanine ligase  40.71 
 
 		 282 aa  219  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.752293 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2495  pantoate--beta-alanine ligase  41.73 
 
 		 280 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  43.77 
 
 		 288 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  39.08 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  41.05 
 
 		 287 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  42.64 
 
 		 539 aa  216  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  38.95 
 
 		 283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  39.3 
 
 		 283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  38.95 
 
 		 283 aa  216  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  39.08 
 
 		 282 aa  216  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  38.95 
 
 		 283 aa  216  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  39.08 
 
 		 282 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  38.95 
 
 		 283 aa  216  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  38.95 
 
 		 283 aa  216  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  39.08 
 
 		 282 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  39.08 
 
 		 282 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  39.5 
 
 		 278 aa  216  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  38.95 
 
 		 283 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  38.95 
 
 		 283 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  41.5 
 
 		 285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  38.95 
 
 		 283 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1465  pantoate--beta-alanine ligase  39.43 
 
 		 282 aa  215  7e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  38.57 
 
 		 282 aa  215  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  39.71 
 
 		 282 aa  215  8e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  39.15 
 
 		 278 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  38.16 
 
 		 282 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  38.49 
 
 		 286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  39.72 
 
 		 309 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2620  pantoate--beta-alanine ligase  38.3 
 
 		 283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  39.86 
 
 		 280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  40.57 
 
 		 300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2674  pantoate--beta-alanine ligase  38.3 
 
 		 283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  40.29 
 
 		 283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  38.21 
 
 		 282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  39.72 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.18 
 
 		 528 aa  213  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  42.25 
 
 		 282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1263  pantoate--beta-alanine ligase  39.22 
 
 		 282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.933341  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0403  pantoate--beta-alanine ligase  40.29 
 
 		 279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  38.57 
 
 		 282 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01430  pantoate--beta-alanine ligase  39.22 
 
 		 283 aa  211  7.999999999999999e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  40.99 
 
 		 283 aa  211  7.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0825  pantoate--beta-alanine ligase  41.7 
 
 		 292 aa  211  7.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  40.54 
 
 		 277 aa  211  9e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  40.83 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  40.35 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2251  pantoate--beta-alanine ligase  41.16 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1507  pantoate/beta-alanine ligase  42.39 
 
 		 280 aa  210  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.73 
 
 		 534 aa  210  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  38.95 
 
 		 282 aa  210  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  38.49 
 
 		 284 aa  210  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.42 
 
 		 527 aa  209  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  40 
 
 		 287 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1757  pantoate--beta-alanine ligase  39.57 
 
 		 279 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  37.89 
 
 		 284 aa  208  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  39.93 
 
 		 287 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3439  pantoate--beta-alanine ligase  37.15 
 
 		 280 aa  208  7e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  37.89 
 
 		 284 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  40.5 
 
 		 289 aa  208  9e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  38.43 
 
 		 289 aa  207  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  40.07 
 
 		 283 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2054  pantoate--beta-alanine ligase  41.43 
 
 		 283 aa  207  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  39.86 
 
 		 281 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0502  pantoate--beta-alanine ligase  39.58 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  40.93 
 
 		 283 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.11 
 
 		 526 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  40.21 
 
 		 283 aa  207  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0693  pantoate--beta-alanine ligase  41.38 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.001104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2891  pantoate/beta-alanine ligase  40.71 
 
 		 290 aa  206  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150324  normal  0.438724 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0160  pantoate--beta-alanine ligase  39.14 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>