More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0477 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0477  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 		 281 aa  583  1.0000000000000001e-165  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4557  pantoate/beta-alanine ligase  48.93 
 
 		 280 aa  269  4e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.146553  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  46.93 
 
 		 280 aa  262  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3835  pantothenate synthetase  46.35 
 
 		 283 aa  261  6.999999999999999e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0134  pantoate/beta-alanine ligase  44.96 
 
 		 279 aa  251  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1507  pantoate/beta-alanine ligase  46.64 
 
 		 280 aa  246  4e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  43.17 
 
 		 281 aa  237  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01430  pantoate--beta-alanine ligase  41.64 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  43.97 
 
 		 283 aa  233  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  41.58 
 
 		 282 aa  232  6e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0825  pantoate--beta-alanine ligase  41.94 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  44.09 
 
 		 276 aa  230  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  43.16 
 
 		 290 aa  229  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  41.49 
 
 		 280 aa  228  8e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  40.43 
 
 		 281 aa  226  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  43.01 
 
 		 289 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  43.77 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2495  pantoate--beta-alanine ligase  44.77 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  42.2 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  43.53 
 
 		 289 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  46.1 
 
 		 286 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0403  pantoate--beta-alanine ligase  44.93 
 
 		 279 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  44.84 
 
 		 287 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1757  pantoate--beta-alanine ligase  44.93 
 
 		 279 aa  221  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  43.77 
 
 		 283 aa  221  9e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  42.09 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  45.96 
 
 		 285 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  41.37 
 
 		 280 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  47.16 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1658  pantoate--beta-alanine ligase  44.2 
 
 		 282 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.752293 
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  43.17 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  44.44 
 
 		 289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  41.37 
 
 		 280 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  45.7 
 
 		 287 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  43.17 
 
 		 293 aa  219  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2251  pantoate--beta-alanine ligase  44.33 
 
 		 307 aa  219  5e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  43.26 
 
 		 281 aa  219  6e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  47.16 
 
 		 283 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  41.2 
 
 		 283 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  42.29 
 
 		 279 aa  218  7.999999999999999e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  42.45 
 
 		 291 aa  217  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3689  pantoate/beta-alanine ligase  43.4 
 
 		 285 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141413 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  45.36 
 
 		 287 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  44.48 
 
 		 287 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2560  pantoate--beta-alanine ligase  42.39 
 
 		 284 aa  216  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  45.21 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  42.5 
 
 		 283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  41.34 
 
 		 280 aa  216  4e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  43.46 
 
 		 279 aa  216  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  40.65 
 
 		 300 aa  215  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  44.09 
 
 		 282 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.68 
 
 		 511 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2469  pantothenate synthetase  44.76 
 
 		 291 aa  214  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  44.44 
 
 		 282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2891  pantoate/beta-alanine ligase  52.6 
 
 		 290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150324  normal  0.438724 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.33 
 
 		 511 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  45.49 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  43.97 
 
 		 278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  42.7 
 
 		 291 aa  212  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  44.09 
 
 		 282 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  44.09 
 
 		 282 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  40.5 
 
 		 282 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  44.09 
 
 		 282 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2314  pantoate/beta-alanine ligase  45.42 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000496833  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  39.29 
 
 		 282 aa  211  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  44.56 
 
 		 282 aa  211  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  41.07 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  43.73 
 
 		 282 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  43.73 
 
 		 282 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  44.2 
 
 		 285 aa  209  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  43.16 
 
 		 283 aa  209  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  40.07 
 
 		 281 aa  209  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  41.45 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  42.2 
 
 		 283 aa  209  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  41.07 
 
 		 283 aa  209  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  40.71 
 
 		 283 aa  208  7e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  40.71 
 
 		 283 aa  208  7e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4017  pantoate--beta-alanine ligase  42.46 
 
 		 282 aa  208  7e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43915  normal  0.63382 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  40.71 
 
 		 283 aa  208  7e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  43.46 
 
 		 283 aa  208  8e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  40.71 
 
 		 283 aa  208  9e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  40.71 
 
 		 283 aa  208  9e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  40.71 
 
 		 283 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  40.71 
 
 		 283 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  40.71 
 
 		 283 aa  207  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.03 
 
 		 527 aa  207  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  41.79 
 
 		 300 aa  207  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  43.01 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  45.33 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  44.57 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  43.26 
 
 		 284 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1465  pantoate--beta-alanine ligase  42.65 
 
 		 282 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.69 
 
 		 528 aa  207  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  40.57 
 
 		 284 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  40.07 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2610  pantoate--beta-alanine ligase  40.85 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205281  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  40.57 
 
 		 284 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0502  pantoate--beta-alanine ligase  41.84 
 
 		 300 aa  205  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  42.29 
 
 		 282 aa  205  7e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  40.57 
 
 		 284 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>